More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7657 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
251 aa  488  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  92.03 
 
 
251 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  78.49 
 
 
251 aa  387  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  76.49 
 
 
251 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  76.49 
 
 
251 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  76.49 
 
 
251 aa  381  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  62.55 
 
 
250 aa  286  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  59.27 
 
 
247 aa  285  5e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  58.47 
 
 
249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  58.3 
 
 
250 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  57.66 
 
 
247 aa  281  5.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  60.24 
 
 
250 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  58.87 
 
 
247 aa  279  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  56.63 
 
 
253 aa  278  5e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  57.89 
 
 
248 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  60.32 
 
 
249 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  57.09 
 
 
248 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  60.16 
 
 
250 aa  275  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  59.35 
 
 
250 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  58.94 
 
 
250 aa  271  5.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  57.09 
 
 
249 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  55.87 
 
 
249 aa  264  8.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  55.47 
 
 
249 aa  263  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  55.47 
 
 
249 aa  263  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  57.32 
 
 
250 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  54.66 
 
 
252 aa  261  8.999999999999999e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  55.65 
 
 
260 aa  260  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  54.12 
 
 
258 aa  248  5e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  51.63 
 
 
251 aa  225  6e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  46.5 
 
 
241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  46.06 
 
 
261 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  47.29 
 
 
261 aa  205  6e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  46.53 
 
 
282 aa  203  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  40.33 
 
 
243 aa  201  9.999999999999999e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  39.09 
 
 
243 aa  201  9.999999999999999e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  42.13 
 
 
257 aa  188  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  43.08 
 
 
260 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  36.07 
 
 
241 aa  186  4e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  40.24 
 
 
243 aa  182  4.0000000000000006e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  44.49 
 
 
248 aa  180  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2594  F0F1 ATP synthase subunit A  43.95 
 
 
267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  41.37 
 
 
268 aa  168  9e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  42.34 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  42.79 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  42.79 
 
 
261 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1893  F0F1 ATP synthase subunit A  44.26 
 
 
249 aa  152  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0190421 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2879  F0F1 ATP synthase subunit A  38.37 
 
 
248 aa  152  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.775771  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  37.3 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  35.62 
 
 
261 aa  122  8e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  39.72 
 
 
266 aa  117  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  35.46 
 
 
281 aa  115  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  34.22 
 
 
263 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  37.22 
 
 
283 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  36.19 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2119  ATP synthase F0, A subunit  37.85 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00507952  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  33.76 
 
 
285 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  34.78 
 
 
263 aa  112  5e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  34.2 
 
 
275 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  35.62 
 
 
247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  31.93 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  33.05 
 
 
373 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  37.65 
 
 
355 aa  110  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  31.14 
 
 
312 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2611  F0F1 ATP synthase subunit A  36.09 
 
 
266 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  33.64 
 
 
229 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  34.86 
 
 
267 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2344  F0F1 ATP synthase subunit A  36.09 
 
 
266 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801138 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  34.96 
 
 
284 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  34.34 
 
 
400 aa  105  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  36.65 
 
 
294 aa  105  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  34.3 
 
 
229 aa  105  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0330  ATP synthase F0, A subunit  34.11 
 
 
280 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  33.77 
 
 
259 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  30.74 
 
 
373 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  34.15 
 
 
229 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  34.36 
 
 
234 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  35.04 
 
 
265 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  33.85 
 
 
267 aa  102  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  34.83 
 
 
229 aa  102  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  35.38 
 
 
229 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  34.91 
 
 
229 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  34.82 
 
 
295 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  31.95 
 
 
263 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0170  ATP synthase F0, A subunit  37.71 
 
 
339 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.222204  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  30.74 
 
 
230 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  31.09 
 
 
262 aa  99.8  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  35.91 
 
 
283 aa  99.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  35.66 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  36.02 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1515  ATP synthase F0, A subunit  33.96 
 
 
248 aa  97.8  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  32.67 
 
 
229 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  35.88 
 
 
276 aa  96.3  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0061  ATP synthase F0 subunit A  32.61 
 
 
339 aa  94.7  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  33.83 
 
 
234 aa  95.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  30.56 
 
 
341 aa  94.7  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  30.3 
 
 
234 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  30.3 
 
 
364 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  31.58 
 
 
234 aa  94  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  31.28 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2502  F0F1 ATP synthase subunit A  27.51 
 
 
338 aa  93.2  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>