More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4816 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 		 249 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  79.35 
 
 		 250 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  78.95 
 
 		 248 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  77.91 
 
 		 247 aa  392  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  77.73 
 
 		 248 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  75.9 
 
 		 247 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  72.69 
 
 		 247 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  61.29 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  58.3 
 
 		 252 aa  292  4e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  59.61 
 
 		 258 aa  292  4e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  59.11 
 
 		 249 aa  290  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  57.89 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  62.35 
 
 		 249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  57.49 
 
 		 249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  60.16 
 
 		 250 aa  285  5e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  58.47 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  58.23 
 
 		 249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  58.87 
 
 		 251 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  60.16 
 
 		 250 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  56.85 
 
 		 260 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  58.4 
 
 		 251 aa  279  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  57.72 
 
 		 250 aa  278  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  58.4 
 
 		 251 aa  278  5e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  58.4 
 
 		 251 aa  278  5e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  59.27 
 
 		 250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  58.8 
 
 		 251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  54.84 
 
 		 253 aa  271  5.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  60.98 
 
 		 250 aa  268  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  55.51 
 
 		 251 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  47.97 
 
 		 241 aa  229  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  48.44 
 
 		 257 aa  220  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  46.77 
 
 		 282 aa  219  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  47.45 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  43.03 
 
 		 243 aa  205  7e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  46.03 
 
 		 260 aa  204  8e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  43.85 
 
 		 261 aa  202  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  41.39 
 
 		 243 aa  202  4e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  45.56 
 
 		 248 aa  202  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  39.59 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2594  F0F1 ATP synthase subunit A  45.42 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546841 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  42 
 
 		 243 aa  195  5.000000000000001e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  43.25 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  42.08 
 
 		 261 aa  191  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  41.7 
 
 		 261 aa  191  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  44.84 
 
 		 247 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2879  F0F1 ATP synthase subunit A  41.46 
 
 		 248 aa  174  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.775771  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1893  F0F1 ATP synthase subunit A  47.13 
 
 		 249 aa  168  9e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0190421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  38.61 
 
 		 283 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2611  F0F1 ATP synthase subunit A  37.89 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  35.63 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2344  F0F1 ATP synthase subunit A  39.76 
 
 		 266 aa  123  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801138 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  38.2 
 
 		 285 aa  122  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  37.85 
 
 		 265 aa  121  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  36.14 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  40 
 
 		 266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  32.1 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  36.55 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  31.09 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  36.75 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  36.14 
 
 		 207 aa  110  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  32.35 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  38.84 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  34.34 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2119  ATP synthase F0, A subunit  35.06 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00507952  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  30.12 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  35.24 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  33.48 
 
 		 373 aa  106  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  34.14 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  30.92 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  33.84 
 
 		 229 aa  106  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0330  ATP synthase F0, A subunit  36.79 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  29.72 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  31.54 
 
 		 312 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  30.86 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0170  ATP synthase F0, A subunit  37.09 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.222204  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  36.22 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  38.57 
 
 		 283 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  30.83 
 
 		 265 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  32.64 
 
 		 262 aa  102  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1515  ATP synthase F0, A subunit  37.93 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  34.12 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  33.67 
 
 		 400 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  34.13 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  33.17 
 
 		 229 aa  99  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  32.23 
 
 		 364 aa  96.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  32.53 
 
 		 284 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  37.44 
 
 		 272 aa  96.7  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  33.96 
 
 		 216 aa  95.5  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1301  ATP synthase F0, A subunit  36.41 
 
 		 282 aa  95.1  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  32.34 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0061  ATP synthase F0 subunit A  30.7 
 
 		 339 aa  92.4  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  34.19 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  31.91 
 
 		 373 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  35.47 
 
 		 355 aa  90.5  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  32.73 
 
 		 270 aa  89.4  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  31.17 
 
 		 233 aa  89  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  28.91 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  30.56 
 
 		 233 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  33.89 
 
 		 247 aa  86.7  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  31.06 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.120848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>