More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0554 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 		 250 aa  490  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  95.2 
 
 		 250 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  86.4 
 
 		 250 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  84 
 
 		 250 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  72.58 
 
 		 249 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  72.98 
 
 		 249 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  72.18 
 
 		 249 aa  377  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  77.82 
 
 		 249 aa  374  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  65.31 
 
 		 252 aa  340  2e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  65.06 
 
 		 250 aa  311  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  64.49 
 
 		 260 aa  308  5e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  66.12 
 
 		 250 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  63.01 
 
 		 247 aa  302  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  62.6 
 
 		 247 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  62.45 
 
 		 253 aa  299  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  63.41 
 
 		 247 aa  299  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  61.89 
 
 		 249 aa  298  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  61.85 
 
 		 248 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  61.85 
 
 		 248 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  60.24 
 
 		 250 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  57.65 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  60.16 
 
 		 249 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  59.35 
 
 		 251 aa  275  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  59.35 
 
 		 251 aa  272  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  59.44 
 
 		 251 aa  272  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  59.44 
 
 		 251 aa  272  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  59.44 
 
 		 251 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  57.72 
 
 		 251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  52.87 
 
 		 241 aa  258  6e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  55.07 
 
 		 251 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  50 
 
 		 257 aa  227  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  45.75 
 
 		 243 aa  216  2e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  46.15 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  46.43 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  44.53 
 
 		 243 aa  206  4e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  45.49 
 
 		 282 aa  202  4e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  38.87 
 
 		 241 aa  196  4.0000000000000005e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  45.24 
 
 		 260 aa  194  8.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  43.53 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  45.16 
 
 		 248 aa  191  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2594  F0F1 ATP synthase subunit A  46.56 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546841 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  41.02 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  40.62 
 
 		 261 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  44.05 
 
 		 247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  41.22 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2879  F0F1 ATP synthase subunit A  43.72 
 
 		 248 aa  172  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.775771  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1893  F0F1 ATP synthase subunit A  47.11 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0190421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  34.73 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  37.5 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  38.6 
 
 		 266 aa  122  6e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  35.27 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  33.47 
 
 		 261 aa  115  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  34.9 
 
 		 257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  33.62 
 
 		 373 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  36.21 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  31.48 
 
 		 312 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  33.9 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  37.3 
 
 		 265 aa  109  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2611  F0F1 ATP synthase subunit A  36.8 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  30.21 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  36.5 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  35.5 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2344  F0F1 ATP synthase subunit A  36.36 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801138 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  33.49 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  34.17 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  33.33 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  33.88 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  34.47 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2119  ATP synthase F0, A subunit  32.56 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00507952  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  34.65 
 
 		 272 aa  102  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  33.17 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  34.16 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  31.45 
 
 		 364 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0170  ATP synthase F0, A subunit  37.43 
 
 		 339 aa  99.8  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.222204  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  34.17 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  33.61 
 
 		 295 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  33.66 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 		 267 aa  99.4  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  32.94 
 
 		 283 aa  99  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  32.49 
 
 		 400 aa  97.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  39.23 
 
 		 276 aa  96.7  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  34.67 
 
 		 229 aa  96.3  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  33 
 
 		 229 aa  96.3  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  32.47 
 
 		 247 aa  96.3  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  34.17 
 
 		 229 aa  96.3  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  32.63 
 
 		 265 aa  92.4  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  31.78 
 
 		 373 aa  92  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0330  ATP synthase F0, A subunit  33.17 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  30.92 
 
 		 345 aa  90.5  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  34.17 
 
 		 284 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1301  ATP synthase F0, A subunit  33.19 
 
 		 282 aa  89.7  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  32.75 
 
 		 355 aa  89.7  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  35.07 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0061  ATP synthase F0 subunit A  37.5 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  31.8 
 
 		 341 aa  87.8  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  28.41 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  33.18 
 
 		 294 aa  86.7  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  32.32 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>