More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1301 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1301  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 		 282 aa  561  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  55.67 
 
 		 294 aa  315  5e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  57.35 
 
 		 281 aa  305  5.0000000000000004e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  53.36 
 
 		 272 aa  302  4.0000000000000003e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  55.64 
 
 		 261 aa  300  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  50 
 
 		 283 aa  261  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  43.41 
 
 		 270 aa  233  3e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  48.19 
 
 		 247 aa  229  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0142  ATP synthase F0, A subunit  41.43 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  38.27 
 
 		 275 aa  171  9e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  36.82 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  36.23 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  37.59 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  36.65 
 
 		 259 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2344  F0F1 ATP synthase subunit A  36.36 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801138 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2611  F0F1 ATP synthase subunit A  35.61 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  35.46 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  38.64 
 
 		 283 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2119  ATP synthase F0, A subunit  35.19 
 
 		 270 aa  156  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00507952  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0330  ATP synthase F0, A subunit  39.25 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  35.91 
 
 		 263 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  38.97 
 
 		 267 aa  145  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  33.73 
 
 		 266 aa  145  8.000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  34.78 
 
 		 261 aa  145  9e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  33.73 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  35.16 
 
 		 295 aa  142  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  36.08 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  33.86 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  36.21 
 
 		 257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  31.2 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  33.06 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  38.65 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  38.29 
 
 		 248 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  36.68 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  33.46 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  38.6 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  38.65 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  33.48 
 
 		 251 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  34.32 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  35.9 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  35.56 
 
 		 247 aa  99.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  33.87 
 
 		 243 aa  98.2  1e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  33.03 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1893  F0F1 ATP synthase subunit A  36.55 
 
 		 249 aa  97.8  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0190421 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  33.09 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  35.27 
 
 		 249 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  30.5 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  32.18 
 
 		 248 aa  95.5  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  34.4 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  31.54 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  34.8 
 
 		 251 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  34.8 
 
 		 251 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  32.37 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  34.78 
 
 		 250 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  33.86 
 
 		 249 aa  92.8  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  30.96 
 
 		 251 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  30.77 
 
 		 261 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  30.77 
 
 		 247 aa  92  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  31.85 
 
 		 268 aa  92  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  33.06 
 
 		 250 aa  92  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  33.78 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  30.37 
 
 		 373 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  32.58 
 
 		 260 aa  92  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  33.79 
 
 		 249 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  34.8 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  30.34 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  33.78 
 
 		 249 aa  91.3  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  30.48 
 
 		 355 aa  91.3  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  33.05 
 
 		 250 aa  89.7  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  33.21 
 
 		 260 aa  89  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  31.94 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  34.18 
 
 		 249 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  32.75 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  34.72 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  31.39 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  30.91 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  30 
 
 		 241 aa  86.3  6e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  31.48 
 
 		 243 aa  85.9  7e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4051  F0F1 ATP synthase subunit A  30.31 
 
 		 264 aa  85.5  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  31.48 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4487  F0F1 ATP synthase subunit A  27.31 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.553444  normal  0.0963007 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  27.52 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  32.71 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03040  putative ATP synthase A chain  28.57 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  32.74 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  29.19 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  28.57 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3758  F0F1 ATP synthase subunit A  26.98 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000113424  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3650  F0F1 ATP synthase subunit A  28.17 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000146441  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3517  F0F1 ATP synthase subunit A  32.3 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2594  F0F1 ATP synthase subunit A  32.9 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546841 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00428  F0F1 ATP synthase subunit A  27.95 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4492  F0F1 ATP synthase subunit A  27.78 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000647119  hitchhiker  0.00000648141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  32.35 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  29.02 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  28.09 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677372  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  31.18 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0061  ATP synthase F0 subunit A  27.15 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002024  ATP synthase A chain  27.63 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  32.34 
 
 		 400 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>