More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4018 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 		 265 aa  526  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  59.77 
 
 		 265 aa  331  6e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  59.77 
 
 		 259 aa  297  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  45.35 
 
 		 275 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  46.04 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2611  F0F1 ATP synthase subunit A  43.89 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  43.66 
 
 		 276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  45.69 
 
 		 295 aa  188  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2344  F0F1 ATP synthase subunit A  41.98 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801138 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  42.35 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  41.89 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  42.91 
 
 		 284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2119  ATP synthase F0, A subunit  40.38 
 
 		 270 aa  179  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00507952  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  40.3 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  39.69 
 
 		 281 aa  169  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  40.78 
 
 		 283 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  41.8 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  37.6 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1301  ATP synthase F0, A subunit  36.23 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  40.38 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  39.85 
 
 		 285 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  38.74 
 
 		 294 aa  156  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  36.64 
 
 		 272 aa  152  8e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  36.26 
 
 		 262 aa  149  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  37.97 
 
 		 261 aa  148  9e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  39.2 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  39.35 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0330  ATP synthase F0, A subunit  40.09 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  41.7 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  38.1 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  37.3 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  37.61 
 
 		 261 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  38.99 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  32.32 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  37.18 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  37.18 
 
 		 247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  36.8 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  36.8 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  38.62 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  36.8 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  38.26 
 
 		 250 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  36.14 
 
 		 251 aa  121  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  36.92 
 
 		 258 aa  121  9e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  37.85 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  36.76 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  40.49 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  35.37 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  40.34 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  39.91 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  41.05 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  41.05 
 
 		 249 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  39.04 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  38.33 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  34.94 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  35.29 
 
 		 253 aa  115  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  37.83 
 
 		 247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  36.65 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  36.02 
 
 		 355 aa  114  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  39.48 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  38.89 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  35.93 
 
 		 282 aa  112  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  38 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2594  F0F1 ATP synthase subunit A  37.39 
 
 		 267 aa  112  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546841 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  35.56 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  35.74 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  36.4 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  32.79 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  36.48 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0142  ATP synthase F0, A subunit  34.07 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  37.29 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  31.76 
 
 		 373 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  38.19 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2879  F0F1 ATP synthase subunit A  36.12 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.775771  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  39.3 
 
 		 250 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  37.66 
 
 		 250 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4487  F0F1 ATP synthase subunit A  36.56 
 
 		 406 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.553444  normal  0.0963007 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1515  ATP synthase F0, A subunit  32.89 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  33.73 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  34.89 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  32.84 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1893  F0F1 ATP synthase subunit A  38.66 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0190421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  32.78 
 
 		 373 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  31.97 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  33.06 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  30.14 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  31.88 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  31.87 
 
 		 342 aa  93.6  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  30.3 
 
 		 235 aa  91.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03040  putative ATP synthase A chain  32.33 
 
 		 361 aa  91.3  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4495  F0F1 ATP synthase subunit A  35.15 
 
 		 384 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  31.62 
 
 		 345 aa  89.7  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  28.77 
 
 		 312 aa  89.7  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  30.04 
 
 		 234 aa  89.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  31.11 
 
 		 258 aa  89.4  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0179  ATP synthase, subunit A (H(+)-transporting two-sector ATPase)  33.77 
 
 		 376 aa  89  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.412196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  31.93 
 
 		 364 aa  88.6  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  37.56 
 
 		 400 aa  88.2  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  29.88 
 
 		 340 aa  85.5  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677372  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  32.06 
 
 		 243 aa  85.1  0.000000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  27.62 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>