More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3499 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 		 251 aa  483  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 		 251 aa  483  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  99.6 
 
 		 251 aa  481  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  85.26 
 
 		 251 aa  431  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  76.49 
 
 		 251 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  75.7 
 
 		 251 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  60 
 
 		 250 aa  285  5e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  58.8 
 
 		 248 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  56.05 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  58.4 
 
 		 248 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  58.4 
 
 		 249 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  60.16 
 
 		 250 aa  278  5e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  55.24 
 
 		 247 aa  277  9e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  57.09 
 
 		 250 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  57.26 
 
 		 247 aa  275  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  56.22 
 
 		 253 aa  275  5e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  57.83 
 
 		 250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  59.44 
 
 		 250 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  56.68 
 
 		 249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  57.03 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  57.03 
 
 		 250 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  56.4 
 
 		 249 aa  259  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  54.62 
 
 		 260 aa  256  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  53.85 
 
 		 249 aa  254  7e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  53.85 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  51.42 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  53.85 
 
 		 249 aa  253  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  54.47 
 
 		 258 aa  248  8e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  52.63 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  46.09 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  43.31 
 
 		 261 aa  194  9e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  39.43 
 
 		 243 aa  192  4e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  39.02 
 
 		 243 aa  192  4e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  43.78 
 
 		 268 aa  192  5e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  44.4 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  43.31 
 
 		 261 aa  188  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  42.69 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  42.52 
 
 		 257 aa  181  9.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  37.55 
 
 		 241 aa  181  1e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  44.35 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2594  F0F1 ATP synthase subunit A  43.55 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546841 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1893  F0F1 ATP synthase subunit A  46.94 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0190421 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  38.06 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2879  F0F1 ATP synthase subunit A  40.41 
 
 		 248 aa  162  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.775771  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  40.54 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  40.09 
 
 		 261 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  40.54 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  36.8 
 
 		 265 aa  125  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  36.84 
 
 		 275 aa  125  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  36.92 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  36.29 
 
 		 285 aa  122  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  35.75 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  36.49 
 
 		 267 aa  119  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  37.1 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2119  ATP synthase F0, A subunit  36.87 
 
 		 270 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00507952  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  34.45 
 
 		 263 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  33.2 
 
 		 261 aa  115  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  35.62 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  35.65 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  36.27 
 
 		 373 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  37.39 
 
 		 272 aa  112  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  36.07 
 
 		 283 aa  111  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2611  F0F1 ATP synthase subunit A  39.66 
 
 		 266 aa  111  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  34.4 
 
 		 364 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  38.35 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  38.07 
 
 		 400 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0330  ATP synthase F0, A subunit  34.13 
 
 		 280 aa  108  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  35.29 
 
 		 261 aa  108  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  34.86 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  33.77 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  32.61 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2344  F0F1 ATP synthase subunit A  38.36 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801138 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  29.02 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  33.94 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  32.47 
 
 		 234 aa  105  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  31.93 
 
 		 373 aa  105  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  35.87 
 
 		 281 aa  105  9e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  36.61 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  37.24 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  35.68 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0061  ATP synthase F0 subunit A  34.62 
 
 		 339 aa  102  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2502  F0F1 ATP synthase subunit A  29.17 
 
 		 338 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  29.6 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  30.92 
 
 		 233 aa  101  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  32.74 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  34.47 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  31.08 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  32.91 
 
 		 233 aa  99  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  35.56 
 
 		 294 aa  99  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 		 234 aa  98.6  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  33.18 
 
 		 241 aa  98.6  9e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  34.8 
 
 		 229 aa  98.6  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  31.2 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  31.28 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  30.34 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  33.17 
 
 		 355 aa  97.8  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  32.19 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1515  ATP synthase F0, A subunit  33.49 
 
 		 248 aa  96.3  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  33.02 
 
 		 229 aa  96.3  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>