More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1893 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1893  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 		 249 aa  478  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0190421 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  57.26 
 
 		 251 aa  271  9e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  48.54 
 
 		 249 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  46.59 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  46.22 
 
 		 241 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  47.35 
 
 		 247 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  46.99 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  46.94 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  46.31 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  46.09 
 
 		 248 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  47.33 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  46.91 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  46.91 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  47.13 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  47.13 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  47.13 
 
 		 251 aa  202  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  46.53 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  45.71 
 
 		 250 aa  198  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  47.11 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  44.44 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  44.03 
 
 		 249 aa  194  9e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  43.44 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  43.62 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  46.72 
 
 		 249 aa  191  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  45.08 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  44.67 
 
 		 251 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  40.08 
 
 		 252 aa  188  5.999999999999999e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  44.89 
 
 		 250 aa  188  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  44.26 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  43.32 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  41.63 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  42.97 
 
 		 253 aa  182  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  41 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  49 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  45.21 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  45.21 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  45.66 
 
 		 261 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  37.96 
 
 		 241 aa  178  5.999999999999999e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  39.21 
 
 		 243 aa  176  4e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  36.84 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  42.29 
 
 		 257 aa  165  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  36.84 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  38.13 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  39.38 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2594  F0F1 ATP synthase subunit A  41.56 
 
 		 267 aa  161  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  41.13 
 
 		 268 aa  155  7e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2879  F0F1 ATP synthase subunit A  41.06 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.775771  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  39.83 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2119  ATP synthase F0, A subunit  39.83 
 
 		 270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00507952  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  38.82 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  38.5 
 
 		 373 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  35.74 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  37.5 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  35.51 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  38.14 
 
 		 284 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  33.19 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  33.48 
 
 		 207 aa  117  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  36.25 
 
 		 261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  35.75 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  37.56 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  34.57 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  33.04 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  32.77 
 
 		 342 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  39.35 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  36.82 
 
 		 283 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  34.98 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  36.08 
 
 		 230 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  33.47 
 
 		 345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1301  ATP synthase F0, A subunit  36.55 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2611  F0F1 ATP synthase subunit A  36.29 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  31.25 
 
 		 263 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  34.87 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  36.79 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  36.05 
 
 		 281 aa  108  7.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  35.2 
 
 		 233 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  33.19 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  37.76 
 
 		 400 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2502  F0F1 ATP synthase subunit A  32.8 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  35.57 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  32.62 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  36.92 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  34.24 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  36.41 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  32.46 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  33.16 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  36.51 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  33.05 
 
 		 340 aa  105  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677372  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  35.84 
 
 		 229 aa  105  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  35.98 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0330  ATP synthase F0, A subunit  33.18 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  30.38 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  34.02 
 
 		 229 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  34.62 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  35.93 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1515  ATP synthase F0, A subunit  35.2 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  34.65 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  35.96 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0061  ATP synthase F0 subunit A  38.46 
 
 		 339 aa  101  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  33.19 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  29.52 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>