More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18260 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  100 
 
 		 261 aa  518  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  51.74 
 
 		 262 aa  249  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  43.14 
 
 		 283 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  43.8 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  41.47 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  41.2 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  38.49 
 
 		 265 aa  175  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  42.21 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  41.88 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  43.48 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  40.48 
 
 		 261 aa  168  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  37.6 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  39.1 
 
 		 272 aa  162  7e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2119  ATP synthase F0, A subunit  41.67 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00507952  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  38.25 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  42.41 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  38.52 
 
 		 295 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  36.74 
 
 		 285 aa  158  8e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  41.29 
 
 		 263 aa  158  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2344  F0F1 ATP synthase subunit A  41.86 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  41.02 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2611  F0F1 ATP synthase subunit A  40.32 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  38.74 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  36.6 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1301  ATP synthase F0, A subunit  34.78 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  38.4 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  39.84 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  34.48 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0142  ATP synthase F0, A subunit  36.65 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0330  ATP synthase F0, A subunit  37.61 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  34.35 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  36.99 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  36.99 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  36.25 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  29.77 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  31.83 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  34.02 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  38.6 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  36.91 
 
 		 252 aa  115  6e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  35.69 
 
 		 257 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  33.2 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  33.2 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  37.76 
 
 		 249 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  32.79 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  33.06 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  33.47 
 
 		 250 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  33.61 
 
 		 251 aa  111  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  33.07 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  31.93 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  35.93 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  33.89 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  35.27 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  36.53 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  33.76 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  32.4 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  34.84 
 
 		 250 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  34.14 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  31.02 
 
 		 253 aa  106  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  31.95 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  33.88 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  32.63 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  34.84 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  36.41 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  34.75 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  33.47 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  32.13 
 
 		 247 aa  99.4  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  35.29 
 
 		 258 aa  99  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1938  F0F1 ATP synthase subunit A  33.9 
 
 		 237 aa  98.2  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00021369  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  32.46 
 
 		 251 aa  97.8  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0858  F0F1 ATP synthase subunit A  32.57 
 
 		 238 aa  97.1  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  33.49 
 
 		 373 aa  96.3  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  27.27 
 
 		 243 aa  95.9  6e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  28.1 
 
 		 243 aa  95.5  7e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  29.34 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  32.21 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  31.3 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  29.39 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1515  ATP synthase F0, A subunit  35.64 
 
 		 248 aa  94.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  32.42 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  29.39 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  35.98 
 
 		 194 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  33.18 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  33.18 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  33.05 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  28.76 
 
 		 243 aa  91.3  2e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  34.12 
 
 		 207 aa  90.9  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  35.58 
 
 		 373 aa  91.3  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  26.84 
 
 		 241 aa  89.7  5e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  31.75 
 
 		 229 aa  89  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  33.05 
 
 		 229 aa  89  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03040  putative ATP synthase A chain  33.82 
 
 		 361 aa  87.8  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  33.18 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  31.49 
 
 		 217 aa  87  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  33.71 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  32.88 
 
 		 355 aa  85.5  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  29.48 
 
 		 342 aa  85.5  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  32.13 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>