More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0951 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 
234 aa  455  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  74.79 
 
 
234 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  62.03 
 
 
229 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  61.18 
 
 
229 aa  279  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  58.12 
 
 
230 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  58.23 
 
 
229 aa  259  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  57.45 
 
 
229 aa  257  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  57.02 
 
 
229 aa  257  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  56.12 
 
 
229 aa  255  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  55.7 
 
 
229 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  50.63 
 
 
239 aa  229  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  51.06 
 
 
229 aa  225  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  50.73 
 
 
233 aa  204  7e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  50.74 
 
 
234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  43.97 
 
 
233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  46.34 
 
 
233 aa  189  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  44.75 
 
 
226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  44.75 
 
 
226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  44.75 
 
 
226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  43.63 
 
 
207 aa  181  9.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  44.84 
 
 
226 aa  176  3e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  44.06 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  49.51 
 
 
226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000656805  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  41.7 
 
 
226 aa  170  1e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  41.74 
 
 
225 aa  170  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  40.38 
 
 
227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  42.5 
 
 
218 aa  161  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  43.35 
 
 
225 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4472  ATP synthase F0, A subunit  50.26 
 
 
258 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  42.11 
 
 
224 aa  155  6e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0723  F0F1 ATP synthase subunit A  43.06 
 
 
228 aa  150  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  40.1 
 
 
232 aa  148  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  40.89 
 
 
232 aa  141  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  38.5 
 
 
231 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1299  ATP synthase F0, A subunit  41.01 
 
 
245 aa  134  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  37.61 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  38.42 
 
 
217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  33.04 
 
 
223 aa  132  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  36.19 
 
 
239 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  36.95 
 
 
232 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  37.44 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  32.24 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  40.69 
 
 
227 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  40.69 
 
 
227 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  35.92 
 
 
227 aa  129  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  37.31 
 
 
228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  38.66 
 
 
216 aa  128  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  36.99 
 
 
241 aa  128  6e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  32.86 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  40.39 
 
 
228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  40.19 
 
 
231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  37.69 
 
 
230 aa  125  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  38.07 
 
 
230 aa  125  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  35.96 
 
 
249 aa  124  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  37.19 
 
 
224 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  35.05 
 
 
241 aa  123  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  35.42 
 
 
194 aa  122  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  38.32 
 
 
251 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  38.32 
 
 
251 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  34.69 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  35.59 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  32.55 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  32.56 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  43.18 
 
 
220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  33.02 
 
 
243 aa  118  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  37.85 
 
 
252 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  34 
 
 
246 aa  119  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  38.77 
 
 
257 aa  118  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  37.62 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  37.62 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  36.36 
 
 
271 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0892  F0F1 ATP synthase subunit A  32.85 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.546785  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  37.14 
 
 
241 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  35.41 
 
 
246 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  38.94 
 
 
253 aa  116  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3102  F0F1 ATP synthase subunit A  31.63 
 
 
229 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00224256  normal  0.218622 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  34.43 
 
 
251 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  34.8 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  38.46 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0467  F0F1 ATP synthase subunit A  33.81 
 
 
233 aa  113  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.104154 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  36.55 
 
 
250 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  34.93 
 
 
247 aa  111  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  34.8 
 
 
249 aa  111  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  36.04 
 
 
248 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  36.55 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16351  F0F1 ATP synthase subunit A  39.89 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0986  F0F1 ATP synthase subunit A  36.67 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18541  F0F1 ATP synthase subunit A  36.67 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0228025  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
247 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
248 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15751  F0F1 ATP synthase subunit A  36.67 
 
 
241 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  32.44 
 
 
249 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0423  F0F1 ATP synthase subunit A  36.89 
 
 
233 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  32.38 
 
 
235 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  34.69 
 
 
251 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
250 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  35.78 
 
 
249 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  36.45 
 
 
250 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  29.95 
 
 
229 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>