More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0970 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 
207 aa  402  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  50.93 
 
 
217 aa  212  2.9999999999999995e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  46.31 
 
 
234 aa  189  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  48.09 
 
 
229 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  45.77 
 
 
229 aa  185  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  45.77 
 
 
229 aa  184  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  48.88 
 
 
229 aa  184  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  45 
 
 
225 aa  181  6e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  43.63 
 
 
234 aa  181  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  46.63 
 
 
230 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  45.15 
 
 
227 aa  180  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  43.72 
 
 
229 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  48.11 
 
 
225 aa  177  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  43.17 
 
 
229 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  41.18 
 
 
233 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  39.71 
 
 
233 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  45.83 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  45.83 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  45.31 
 
 
226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  44.86 
 
 
226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  42.86 
 
 
226 aa  169  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  40.89 
 
 
234 aa  167  9e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  42.08 
 
 
229 aa  164  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0723  F0F1 ATP synthase subunit A  46.38 
 
 
228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  37.25 
 
 
233 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  38.54 
 
 
234 aa  160  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  41.06 
 
 
239 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  46.74 
 
 
224 aa  159  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  39.22 
 
 
229 aa  153  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  39.71 
 
 
226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000656805  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1299  ATP synthase F0, A subunit  38.76 
 
 
245 aa  138  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  40.45 
 
 
218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4472  ATP synthase F0, A subunit  38.43 
 
 
258 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  37.38 
 
 
241 aa  125  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  34.48 
 
 
228 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  35.87 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  40.68 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  35.65 
 
 
284 aa  118  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  33.49 
 
 
251 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  35.35 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  37.57 
 
 
241 aa  115  6e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  37.57 
 
 
241 aa  115  6e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  37.79 
 
 
251 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  38.22 
 
 
268 aa  114  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  35.81 
 
 
245 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  37.44 
 
 
295 aa  114  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  37.2 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  33.7 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  37.2 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  32.84 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0858  F0F1 ATP synthase subunit A  34.53 
 
 
238 aa  112  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  31.86 
 
 
231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  32.69 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  36.22 
 
 
243 aa  112  5e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  38.29 
 
 
223 aa  112  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  30.85 
 
 
216 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  35.89 
 
 
235 aa  111  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  34.98 
 
 
249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  34.98 
 
 
249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
249 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  33.65 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  36.14 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  35.64 
 
 
250 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  33.18 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  33.65 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  33.66 
 
 
250 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  39.47 
 
 
249 aa  109  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  32.22 
 
 
194 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  34.16 
 
 
248 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  36.51 
 
 
262 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  32.6 
 
 
342 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  37.57 
 
 
252 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  33.94 
 
 
247 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  34.9 
 
 
243 aa  107  9.000000000000001e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  35.33 
 
 
230 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  37.88 
 
 
247 aa  107  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  37.87 
 
 
231 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  34.48 
 
 
249 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  37.71 
 
 
243 aa  106  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  33.91 
 
 
283 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  34.39 
 
 
241 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  32.68 
 
 
252 aa  106  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  34.17 
 
 
217 aa  105  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  34.25 
 
 
241 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  32.97 
 
 
232 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  35.64 
 
 
241 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  36.45 
 
 
247 aa  105  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  35.64 
 
 
241 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  33.95 
 
 
235 aa  104  9e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  32.16 
 
 
340 aa  104  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677372  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 
303 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  34.64 
 
 
230 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  36.26 
 
 
236 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  35.35 
 
 
250 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  33.5 
 
 
248 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  33.17 
 
 
249 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  31.98 
 
 
220 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  34.69 
 
 
243 aa  102  3e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  32.52 
 
 
227 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0467  F0F1 ATP synthase subunit A  38.29 
 
 
233 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.104154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>