More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0630 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 
229 aa  447  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  59 
 
 
239 aa  281  8.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  56.9 
 
 
229 aa  262  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  56.47 
 
 
229 aa  261  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  53.45 
 
 
229 aa  245  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  53.02 
 
 
229 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  54.08 
 
 
230 aa  244  9e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  56.65 
 
 
229 aa  241  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  54.31 
 
 
229 aa  240  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  54.35 
 
 
229 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  51.06 
 
 
234 aa  225  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  50.64 
 
 
234 aa  217  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  49.13 
 
 
234 aa  207  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  48.53 
 
 
233 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  48.04 
 
 
233 aa  198  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  48.53 
 
 
233 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  50.22 
 
 
226 aa  179  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000656805  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  42.52 
 
 
226 aa  167  1e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  44.78 
 
 
234 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  42.52 
 
 
226 aa  167  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  42.52 
 
 
226 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  42.2 
 
 
226 aa  158  6e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  39.45 
 
 
224 aa  157  9e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  40.58 
 
 
226 aa  156  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  41.35 
 
 
225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  39.22 
 
 
207 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  40.58 
 
 
225 aa  151  7e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  38.6 
 
 
227 aa  150  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4472  ATP synthase F0, A subunit  46.11 
 
 
258 aa  138  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0723  F0F1 ATP synthase subunit A  39.23 
 
 
228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  37.56 
 
 
217 aa  131  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  33.99 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  37.25 
 
 
218 aa  129  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  37.68 
 
 
239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  39.15 
 
 
271 aa  126  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1299  ATP synthase F0, A subunit  42.94 
 
 
245 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  34.42 
 
 
217 aa  122  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  35.81 
 
 
251 aa  122  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  36.87 
 
 
216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  34.91 
 
 
257 aa  118  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  35.36 
 
 
194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  35.71 
 
 
224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  33.18 
 
 
227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  35.19 
 
 
251 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  35.19 
 
 
251 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  31.43 
 
 
231 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  33.01 
 
 
227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  33.01 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  32.38 
 
 
231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
228 aa  108  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  33.02 
 
 
246 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  31.92 
 
 
243 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3102  F0F1 ATP synthase subunit A  32.11 
 
 
229 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00224256  normal  0.218622 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  30.69 
 
 
232 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0467  F0F1 ATP synthase subunit A  32.21 
 
 
233 aa  106  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.104154 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  34.12 
 
 
241 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  29.76 
 
 
230 aa  105  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  34.43 
 
 
249 aa  106  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  31.75 
 
 
246 aa  105  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  32.37 
 
 
232 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  30.62 
 
 
236 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3831  F0F1 ATP synthase subunit A  32.94 
 
 
239 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000137067  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  33.66 
 
 
230 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  33.8 
 
 
252 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  31.9 
 
 
223 aa  102  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  34.45 
 
 
237 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  31.37 
 
 
229 aa  102  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  37.14 
 
 
257 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  31.6 
 
 
241 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  31.6 
 
 
241 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  32.23 
 
 
241 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  32.23 
 
 
241 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  32.27 
 
 
243 aa  99  6e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  35.38 
 
 
251 aa  99  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  30.92 
 
 
231 aa  98.6  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  31.75 
 
 
241 aa  98.6  8e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 
284 aa  98.2  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  28.69 
 
 
235 aa  98.2  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  33.19 
 
 
295 aa  97.1  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  32.58 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  32.13 
 
 
268 aa  97.1  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0423  F0F1 ATP synthase subunit A  32.2 
 
 
233 aa  96.3  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  32.17 
 
 
245 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  34.8 
 
 
250 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5433  F0F1 ATP synthase subunit A  32.16 
 
 
239 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  35.19 
 
 
220 aa  95.9  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5161  F0F1 ATP synthase subunit A  32.27 
 
 
239 aa  95.1  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4994  F0F1 ATP synthase subunit A  32.27 
 
 
239 aa  95.1  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000342727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5402  F0F1 ATP synthase subunit A  32.27 
 
 
239 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.39849e-58 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  32.95 
 
 
228 aa  95.1  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2993  F0F1 ATP synthase subunit A  31.68 
 
 
239 aa  95.1  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5553  F0F1 ATP synthase subunit A  32.27 
 
 
239 aa  95.1  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000158416  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15751  F0F1 ATP synthase subunit A  33.18 
 
 
241 aa  95.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5436  F0F1 ATP synthase subunit A  32.27 
 
 
239 aa  94.7  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0528964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5011  F0F1 ATP synthase subunit A  32.27 
 
 
239 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5489  F0F1 ATP synthase subunit A  32.27 
 
 
239 aa  94.7  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5518  F0F1 ATP synthase subunit A  32.27 
 
 
239 aa  94.7  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000410336  hitchhiker  3.2870800000000003e-19 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  34.26 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>