More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2254 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 		 234 aa  470  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  64.78 
 
 		 233 aa  308  4e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  62.17 
 
 		 233 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  60 
 
 		 233 aa  294  8e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  52.59 
 
 		 234 aa  240  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  54.73 
 
 		 226 aa  207  9e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000656805  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  49.75 
 
 		 230 aa  188  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  50.25 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  48.24 
 
 		 229 aa  184  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  47.21 
 
 		 229 aa  184  9e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  46.19 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  48.24 
 
 		 229 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  47.74 
 
 		 229 aa  180  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  47.21 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  44.06 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  43.78 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  45.5 
 
 		 234 aa  168  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  42.38 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  44.78 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  41.43 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  38.54 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  41.63 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  41.35 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  41.63 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  43.63 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  41.63 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  37.28 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  41.4 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  37.56 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0723  F0F1 ATP synthase subunit A  39.42 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  37.04 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  37.38 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  36.63 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  36.61 
 
 		 216 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  31.38 
 
 		 257 aa  111  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  34.29 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  33.96 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  38.14 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  33.98 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  33.98 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  32.47 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  33.65 
 
 		 241 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4472  ATP synthase F0, A subunit  37.79 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  32.47 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  32.38 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  32.38 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  35.29 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  32.03 
 
 		 251 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  32.02 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  33.82 
 
 		 232 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  32.1 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  30.56 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  32 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  32.23 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  33.99 
 
 		 232 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  32.03 
 
 		 251 aa  99  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002024  ATP synthase A chain  33.47 
 
 		 270 aa  99  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  31.16 
 
 		 251 aa  98.6  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  31.16 
 
 		 251 aa  98.6  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  33.8 
 
 		 268 aa  98.6  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 228 aa  98.2  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2436  F0F1 ATP synthase subunit A  35.91 
 
 		 266 aa  97.1  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.393005  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  29.87 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  32.29 
 
 		 194 aa  97.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  31.4 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3290  F0F1 ATP synthase subunit A  35.91 
 
 		 287 aa  96.7  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481233  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  30.5 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  32.91 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  30.81 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  30.81 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18541  F0F1 ATP synthase subunit A  32.7 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0228025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0986  F0F1 ATP synthase subunit A  32.7 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  33.48 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  30.81 
 
 		 241 aa  95.5  7e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15751  F0F1 ATP synthase subunit A  31.9 
 
 		 241 aa  95.5  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00428  F0F1 ATP synthase subunit A  33.05 
 
 		 270 aa  95.1  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  30 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  28.1 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  31.98 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  31.75 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  30.3 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  31.7 
 
 		 253 aa  93.6  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11331  F0F1 ATP synthase subunit A  31.88 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3065  F0F1 ATP synthase subunit A  34.27 
 
 		 270 aa  93.2  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2875  F0F1 ATP synthase subunit A  34.74 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.870432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16351  F0F1 ATP synthase subunit A  32.8 
 
 		 188 aa  92.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  31.58 
 
 		 230 aa  92  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0423  F0F1 ATP synthase subunit A  35.78 
 
 		 233 aa  92  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  31.68 
 
 		 229 aa  91.7  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  31.88 
 
 		 257 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  36.31 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  30.18 
 
 		 284 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  30.69 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  31.33 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  29.13 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  31.86 
 
 		 231 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1299  ATP synthase F0, A subunit  31.21 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  28.37 
 
 		 246 aa  88.6  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3956  F0F1 ATP synthase subunit A  30.3 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0660881 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3868  F0F1 ATP synthase subunit A  30.3 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal  0.0791726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>