More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11331 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11331  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
250 aa  501  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3868  F0F1 ATP synthase subunit A  78.09 
 
 
251 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal  0.0791726 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3956  F0F1 ATP synthase subunit A  78.09 
 
 
251 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0660881 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3882  F0F1 ATP synthase subunit A  78.09 
 
 
251 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4334  F0F1 ATP synthase subunit A  73.54 
 
 
256 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442286  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2312  F0F1 ATP synthase subunit A  71.98 
 
 
259 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1915  ATP synthase F0, A subunit  71.03 
 
 
251 aa  351  5e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1249  ATP synthase F0, A subunit  57.61 
 
 
250 aa  282  4.0000000000000003e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  50 
 
 
271 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  36.96 
 
 
246 aa  121  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  33.2 
 
 
262 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  34.63 
 
 
216 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002024  ATP synthase A chain  34.43 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000182901  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3065  F0F1 ATP synthase subunit A  32.81 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00428  F0F1 ATP synthase subunit A  34.6 
 
 
270 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3311  F0F1 ATP synthase subunit A  34.21 
 
 
257 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.374489  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06110  F0F1 ATP synthase subunit A  33.85 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4613  F0F1 ATP synthase subunit A  33.19 
 
 
272 aa  109  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0187  F0F1 ATP synthase subunit A  31.68 
 
 
288 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.666395  hitchhiker  0.00551328 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  36.04 
 
 
284 aa  106  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2436  F0F1 ATP synthase subunit A  32.48 
 
 
266 aa  106  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.393005  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2333  F0F1 ATP synthase subunit A  30.65 
 
 
288 aa  105  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000306591  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2030  F0F1 ATP synthase subunit A  30.65 
 
 
288 aa  105  9e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175167  normal  0.027211 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4108  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
266 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  8.0507200000000005e-19  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3736  F0F1 ATP synthase subunit A  33.05 
 
 
267 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.584992  normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3080  F0F1 ATP synthase subunit A  35.1 
 
 
267 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00958832  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4126  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
271 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000492327  normal  0.286838 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2875  F0F1 ATP synthase subunit A  30.38 
 
 
255 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.870432  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2522  F0F1 ATP synthase subunit A  32.07 
 
 
270 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145329  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2171  F0F1 ATP synthase subunit A  34.34 
 
 
270 aa  102  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000816174  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2331  ATP synthase F0, A subunit  31.02 
 
 
273 aa  102  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000417448  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4468  F0F1 ATP synthase subunit A  31.09 
 
 
282 aa  101  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000195299  hitchhiker  0.00000000198513 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3962  F0F1 ATP synthase subunit A  33.47 
 
 
273 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4152  F0F1 ATP synthase subunit A  31.65 
 
 
271 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00217219  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4202  F0F1 ATP synthase subunit A  31.65 
 
 
271 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109875  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4081  F0F1 ATP synthase subunit A  31.65 
 
 
271 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00982626  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4096  F0F1 ATP synthase subunit A  31.65 
 
 
271 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000520187  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4261  F0F1 ATP synthase subunit A  31.65 
 
 
271 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0537303  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4051  F0F1 ATP synthase subunit A  33.61 
 
 
264 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2142  F0F1 ATP synthase subunit A  33.91 
 
 
264 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0182  F0F1 ATP synthase subunit A  33.91 
 
 
264 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.147393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4182  F0F1 ATP synthase subunit A  32.53 
 
 
274 aa  99.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000085941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4220  F0F1 ATP synthase subunit A  32.53 
 
 
274 aa  99.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000114872  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4208  F0F1 ATP synthase subunit A  32.53 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000900849  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4188  F0F1 ATP synthase subunit A  30.53 
 
 
263 aa  99.8  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000118373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4246  F0F1 ATP synthase subunit A  35.34 
 
 
276 aa  99.4  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000111234  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0858  F0F1 ATP synthase subunit A  30.12 
 
 
238 aa  99  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3987  ATP synthase F0, A subunit  31.8 
 
 
260 aa  98.6  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  31.96 
 
 
224 aa  98.2  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0002  F0F1 ATP synthase subunit A  32.4 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000755904  hitchhiker  0.00410129 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3881  F0F1 ATP synthase subunit A  30.04 
 
 
284 aa  98.2  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.011466  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0659  F0F1-type ATP synthase, subunit a  30.8 
 
 
241 aa  98.2  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.320134  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52220  F0F1 ATP synthase subunit A  30.93 
 
 
272 aa  97.1  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4251  F0F1 ATP synthase subunit A  31.13 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000620558  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4541  F0F1 ATP synthase subunit A  30.74 
 
 
266 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000389155  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0304  F0F1 ATP synthase subunit A  31.58 
 
 
268 aa  96.3  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000278138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  32.63 
 
 
237 aa  95.9  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4136  F0F1 ATP synthase subunit A  33.03 
 
 
264 aa  95.1  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000152507  hitchhiker  0.00113608 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1875  F0F1-type ATP synthase, subunit a  31.25 
 
 
241 aa  95.1  9e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.257614  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2813  ATP synthase F0, A subunit  28.45 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0159651  normal  0.290047 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  33.61 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3650  F0F1 ATP synthase subunit A  32.11 
 
 
264 aa  94.4  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000146441  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3209  ATP synthase F0, A subunit  28.45 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116746  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3931  F0F1 ATP synthase subunit A  32.57 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000907169  hitchhiker  0.00676688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4023  F0F1 ATP synthase subunit A  32.57 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.040016  normal  0.910655 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03622  F0F1 ATP synthase subunit A  34.91 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000418206  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4229  ATP synthase F0, A subunit  34.91 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000742751  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  29.83 
 
 
225 aa  94  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03566  hypothetical protein  34.91 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000247558  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0461  ATP synthase F0, A subunit  31.33 
 
 
235 aa  94  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000814456  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  31.88 
 
 
234 aa  94  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3831  F0F1 ATP synthase subunit A  31.69 
 
 
239 aa  94  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000137067  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3954  F0F1 ATP synthase subunit A  34.91 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000890174  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  30.04 
 
 
245 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4256  F0F1 ATP synthase subunit A  34.91 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000769313  hitchhiker  0.00779566 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5174  F0F1 ATP synthase subunit A  34.91 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000580293  normal  0.0140934 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4106  F0F1 ATP synthase subunit A  34.91 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000706624  normal  0.0652596 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4254  F0F1 ATP synthase subunit A  34.91 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000253888  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4183  F0F1 ATP synthase subunit A  34.91 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000018126  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5419  F0F1 ATP synthase subunit A  32.67 
 
 
289 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171484 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3314  F0F1 ATP synthase subunit A  31.73 
 
 
283 aa  93.6  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000501735  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4904  F0F1 ATP synthase subunit A  32.24 
 
 
264 aa  92.8  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000512006  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2951  F0F1 ATP synthase subunit A  32.13 
 
 
283 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643382  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2803  F0F1 ATP synthase subunit A  31.02 
 
 
280 aa  92.8  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00368483  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0185  F0F1 ATP synthase subunit A  32.13 
 
 
283 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.690271  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5736  F0F1 ATP synthase subunit A  32 
 
 
289 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000306084  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3361  F0F1 ATP synthase subunit A  32.13 
 
 
289 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.148624  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3009  F0F1 ATP synthase subunit A  32.13 
 
 
289 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0278836  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5301  F0F1 ATP synthase subunit A  32.67 
 
 
289 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3851  F0F1 ATP synthase subunit A  34.72 
 
 
264 aa  93.2  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000751121  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1593  F0F1 ATP synthase subunit A  32.13 
 
 
289 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000136963  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4753  F0F1 ATP synthase subunit A  31.65 
 
 
264 aa  92.4  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3974  F0F1 ATP synthase subunit A  32.13 
 
 
289 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338825  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4048  F0F1 ATP synthase subunit A  32.13 
 
 
289 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4371  F0F1 ATP synthase subunit A  34.25 
 
 
278 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000324643  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3059  F0F1 ATP synthase subunit A  31.08 
 
 
278 aa  92  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2916  F0F1 ATP synthase subunit A  31.08 
 
 
278 aa  92  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4372  F0F1 ATP synthase subunit A  34.25 
 
 
264 aa  92  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000188927  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4513  F0F1 ATP synthase subunit A  34.25 
 
 
264 aa  92  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00041275  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4316  F0F1 ATP synthase subunit A  34.25 
 
 
264 aa  92  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00103283  hitchhiker  0.000000000108391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>