More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3156 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 
262 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  54.84 
 
 
246 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  45.53 
 
 
271 aa  204  9e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  42.8 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  38.43 
 
 
245 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2183  F0F1 ATP synthase subunit A  37.77 
 
 
242 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.22629  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2145  F0F1 ATP synthase subunit A  37.77 
 
 
242 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.186735  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  40 
 
 
271 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3831  F0F1 ATP synthase subunit A  35.29 
 
 
239 aa  136  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000137067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  35.24 
 
 
237 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  33.97 
 
 
224 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  35.05 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5433  F0F1 ATP synthase subunit A  34.03 
 
 
239 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5436  F0F1 ATP synthase subunit A  34.03 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0528964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5402  F0F1 ATP synthase subunit A  34.03 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.39849e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5161  F0F1 ATP synthase subunit A  34.03 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4994  F0F1 ATP synthase subunit A  34.03 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000342727  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5011  F0F1 ATP synthase subunit A  34.03 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5489  F0F1 ATP synthase subunit A  34.03 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5518  F0F1 ATP synthase subunit A  34.03 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000410336  hitchhiker  3.2870800000000003e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5553  F0F1 ATP synthase subunit A  34.03 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000158416  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0197  ATP synthase F0, A subunit  33.19 
 
 
301 aa  125  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000520668  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5109  F0F1 ATP synthase subunit A  33.19 
 
 
239 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00506372  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  34.15 
 
 
284 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1915  ATP synthase F0, A subunit  38.12 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3309  F0F1 ATP synthase subunit A  35.37 
 
 
236 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000902841  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11331  F0F1 ATP synthase subunit A  33.2 
 
 
250 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2331  ATP synthase F0, A subunit  32.71 
 
 
273 aa  118  7.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000417448  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1715  F0F1 ATP synthase subunit A  37.13 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  33.82 
 
 
217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  34.78 
 
 
218 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4334  F0F1 ATP synthase subunit A  32.49 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442286  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0858  F0F1 ATP synthase subunit A  29.41 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2312  F0F1 ATP synthase subunit A  31.65 
 
 
259 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  36.51 
 
 
207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3742  ATP synthase F0, A subunit  32.58 
 
 
247 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  28.07 
 
 
235 aa  108  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  35.27 
 
 
251 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  35.27 
 
 
251 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3868  F0F1 ATP synthase subunit A  32.63 
 
 
251 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal  0.0791726 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3956  F0F1 ATP synthase subunit A  32.63 
 
 
251 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0660881 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3882  F0F1 ATP synthase subunit A  32.63 
 
 
251 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  31.09 
 
 
258 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1875  F0F1-type ATP synthase, subunit a  30.9 
 
 
241 aa  105  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.257614  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  32.21 
 
 
229 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0461  ATP synthase F0, A subunit  31.56 
 
 
235 aa  105  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000814456  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0296  F0F1 ATP synthase subunit A  31.15 
 
 
280 aa  104  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2458  F0F1 ATP synthase subunit A  34.06 
 
 
224 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  34.82 
 
 
252 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  30.18 
 
 
230 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0304  F0F1 ATP synthase subunit A  33.62 
 
 
268 aa  102  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000278138  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0751  F0F1 ATP synthase subunit A  30.13 
 
 
272 aa  102  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.146612  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  31.78 
 
 
257 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3080  F0F1 ATP synthase subunit A  30.71 
 
 
267 aa  102  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00958832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2168  F0F1 ATP synthase subunit A  34.42 
 
 
218 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03107  F0F1 ATP synthase subunit A  32.48 
 
 
251 aa  101  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  29.54 
 
 
295 aa  101  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3851  F0F1 ATP synthase subunit A  31.83 
 
 
264 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000751121  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  28.5 
 
 
227 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  28.97 
 
 
227 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1702  F0F1 ATP synthase subunit A  32.64 
 
 
265 aa  100  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.223985  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  31.47 
 
 
241 aa  99.8  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4372  F0F1 ATP synthase subunit A  31.25 
 
 
264 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000188927  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1249  ATP synthase F0, A subunit  30.83 
 
 
250 aa  99.8  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4316  F0F1 ATP synthase subunit A  31.25 
 
 
264 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00103283  hitchhiker  0.000000000108391 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4513  F0F1 ATP synthase subunit A  31.25 
 
 
264 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00041275  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3650  F0F1 ATP synthase subunit A  31.83 
 
 
264 aa  99.4  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000146441  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4753  F0F1 ATP synthase subunit A  31.94 
 
 
264 aa  99.4  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3931  F0F1 ATP synthase subunit A  31.6 
 
 
264 aa  99.4  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000907169  hitchhiker  0.00676688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4023  F0F1 ATP synthase subunit A  31.6 
 
 
264 aa  99.4  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.040016  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3517  F0F1 ATP synthase subunit A  33.48 
 
 
266 aa  98.6  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279643  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4371  F0F1 ATP synthase subunit A  33.62 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000324643  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4051  F0F1 ATP synthase subunit A  34.33 
 
 
264 aa  98.6  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4136  F0F1 ATP synthase subunit A  31.25 
 
 
264 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000152507  hitchhiker  0.00113608 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5605  ATP synthase F0, A subunit  32.91 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  31.47 
 
 
241 aa  97.4  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4904  F0F1 ATP synthase subunit A  30.21 
 
 
264 aa  97.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000512006  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2750  F0F1 ATP synthase subunit A  32.77 
 
 
267 aa  97.8  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000190697  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  28.3 
 
 
231 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  30.08 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4492  F0F1 ATP synthase subunit A  30.45 
 
 
264 aa  97.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000647119  hitchhiker  0.00000648141 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3059  F0F1 ATP synthase subunit A  35 
 
 
278 aa  96.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2916  F0F1 ATP synthase subunit A  35 
 
 
278 aa  96.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3758  F0F1 ATP synthase subunit A  31.6 
 
 
264 aa  97.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000113424  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2616  F0F1 ATP synthase subunit A  30.04 
 
 
251 aa  96.3  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68842  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1938  F0F1 ATP synthase subunit A  29.25 
 
 
237 aa  95.9  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00021369  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0430  F0F1 ATP synthase subunit A  31.88 
 
 
265 aa  95.9  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000235432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5127  F0F1 ATP synthase subunit A  32.91 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00619657  normal  0.911189 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0659  F0F1-type ATP synthase, subunit a  30.25 
 
 
241 aa  95.1  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.320134  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3736  F0F1 ATP synthase subunit A  35.1 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.584992  normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2142  F0F1 ATP synthase subunit A  29.52 
 
 
264 aa  94  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  26.91 
 
 
232 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  32.21 
 
 
239 aa  94  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  30.7 
 
 
223 aa  93.2  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  29.9 
 
 
194 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  30.08 
 
 
249 aa  93.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0056  F0F1 ATP synthase subunit A  32.59 
 
 
261 aa  93.2  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3065  F0F1 ATP synthase subunit A  29.18 
 
 
270 aa  92.8  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  30.48 
 
 
217 aa  92.8  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1031  ATP synthase F0, A subunit  29.1 
 
 
307 aa  92.8  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>