More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0461 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0461  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 
235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000814456  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0659  F0F1-type ATP synthase, subunit a  46.44 
 
 
241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.320134  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1875  F0F1-type ATP synthase, subunit a  47.68 
 
 
241 aa  209  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.257614  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  42.13 
 
 
237 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3309  F0F1 ATP synthase subunit A  42.86 
 
 
236 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000902841  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3831  F0F1 ATP synthase subunit A  42.54 
 
 
239 aa  179  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000137067  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1938  F0F1 ATP synthase subunit A  43.48 
 
 
237 aa  176  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00021369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2183  F0F1 ATP synthase subunit A  40.61 
 
 
242 aa  174  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.22629  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2145  F0F1 ATP synthase subunit A  40.61 
 
 
242 aa  174  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.186735  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5433  F0F1 ATP synthase subunit A  41.56 
 
 
239 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5436  F0F1 ATP synthase subunit A  41.56 
 
 
239 aa  165  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0528964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5518  F0F1 ATP synthase subunit A  41.56 
 
 
239 aa  165  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000410336  hitchhiker  3.2870800000000003e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5489  F0F1 ATP synthase subunit A  41.56 
 
 
239 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5011  F0F1 ATP synthase subunit A  41.56 
 
 
239 aa  164  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110706  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1244  F0F1-type ATP synthase, subunit a  53.59 
 
 
154 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000114749  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5161  F0F1 ATP synthase subunit A  41.56 
 
 
239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4994  F0F1 ATP synthase subunit A  41.56 
 
 
239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000342727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5553  F0F1 ATP synthase subunit A  41.56 
 
 
239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000158416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5402  F0F1 ATP synthase subunit A  41.56 
 
 
239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.39849e-58 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  39.74 
 
 
235 aa  162  6e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5109  F0F1 ATP synthase subunit A  40.69 
 
 
239 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00506372  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0858  F0F1 ATP synthase subunit A  37.83 
 
 
238 aa  153  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1715  F0F1 ATP synthase subunit A  41.74 
 
 
242 aa  151  7e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  32.26 
 
 
245 aa  122  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  33.62 
 
 
235 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  32.19 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  32.31 
 
 
246 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  31.56 
 
 
262 aa  104  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2763  ATP synthase F0, A subunit  31.35 
 
 
254 aa  102  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  34.05 
 
 
241 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  29.52 
 
 
284 aa  99.4  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  31.33 
 
 
249 aa  98.6  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2616  F0F1 ATP synthase subunit A  32.02 
 
 
251 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68842  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  32.76 
 
 
241 aa  97.1  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  30.68 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  32.05 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0197  ATP synthase F0, A subunit  32.5 
 
 
301 aa  97.1  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000520668  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  32.5 
 
 
257 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  30.84 
 
 
252 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  32.47 
 
 
241 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0986  F0F1 ATP synthase subunit A  31.25 
 
 
241 aa  95.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18541  F0F1 ATP synthase subunit A  31.25 
 
 
241 aa  95.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0228025  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1702  F0F1 ATP synthase subunit A  33.04 
 
 
265 aa  95.1  9e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.223985  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3209  ATP synthase F0, A subunit  33.91 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116746  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2813  ATP synthase F0, A subunit  33.91 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0159651  normal  0.290047 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  33.19 
 
 
241 aa  94.4  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  32.47 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  32.47 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11331  F0F1 ATP synthase subunit A  31.33 
 
 
250 aa  94  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  31.96 
 
 
251 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  31.96 
 
 
251 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  30.74 
 
 
253 aa  93.2  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  30.94 
 
 
224 aa  93.6  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15751  F0F1 ATP synthase subunit A  32.16 
 
 
241 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4334  F0F1 ATP synthase subunit A  29.39 
 
 
256 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442286  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  29.82 
 
 
216 aa  92.8  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2312  F0F1 ATP synthase subunit A  28.98 
 
 
259 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  29.96 
 
 
257 aa  92.4  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3868  F0F1 ATP synthase subunit A  32.61 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal  0.0791726 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  29.39 
 
 
232 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3956  F0F1 ATP synthase subunit A  32.61 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0660881 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3882  F0F1 ATP synthase subunit A  32.61 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  29.17 
 
 
295 aa  90.1  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  33.69 
 
 
228 aa  89  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  32.29 
 
 
227 aa  89  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16351  F0F1 ATP synthase subunit A  32.84 
 
 
188 aa  88.6  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1915  ATP synthase F0, A subunit  32.51 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2803  F0F1 ATP synthase subunit A  32.68 
 
 
280 aa  86.7  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00368483  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0296  F0F1 ATP synthase subunit A  31.16 
 
 
280 aa  86.3  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  28.57 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3080  F0F1 ATP synthase subunit A  30.77 
 
 
267 aa  86.3  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00958832  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
223 aa  86.3  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2458  F0F1 ATP synthase subunit A  32.44 
 
 
224 aa  85.5  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4081  F0F1 ATP synthase subunit A  31.15 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00982626  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4261  F0F1 ATP synthase subunit A  31.15 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0537303  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4202  F0F1 ATP synthase subunit A  31.15 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109875  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4096  F0F1 ATP synthase subunit A  31.15 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000520187  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1031  ATP synthase F0, A subunit  35.85 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4152  F0F1 ATP synthase subunit A  31.15 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00217219  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5419  F0F1 ATP synthase subunit A  32.46 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171484 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5605  ATP synthase F0, A subunit  32.31 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  28.63 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2168  F0F1 ATP synthase subunit A  31.56 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4251  F0F1 ATP synthase subunit A  30.91 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000620558  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5301  F0F1 ATP synthase subunit A  32.02 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4541  F0F1 ATP synthase subunit A  31.36 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000389155  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0002  F0F1 ATP synthase subunit A  32.52 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000755904  hitchhiker  0.00410129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5437  F0F1 ATP synthase subunit A  32.02 
 
 
289 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5206  F0F1 ATP synthase subunit A  32.02 
 
 
289 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.391657  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  33.06 
 
 
261 aa  82  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  27.98 
 
 
194 aa  82  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03622  F0F1 ATP synthase subunit A  33.01 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000418206  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4229  ATP synthase F0, A subunit  33.01 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000742751  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3954  F0F1 ATP synthase subunit A  33.01 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000890174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4256  F0F1 ATP synthase subunit A  33.01 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000769313  hitchhiker  0.00779566 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4254  F0F1 ATP synthase subunit A  33.01 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000253888  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5174  F0F1 ATP synthase subunit A  33.01 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000580293  normal  0.0140934 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3987  ATP synthase F0, A subunit  32.52 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4183  F0F1 ATP synthase subunit A  33.01 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000018126  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  32.72 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>