More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0516 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
235 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0858  F0F1 ATP synthase subunit A  71.91 
 
 
238 aa  355  2.9999999999999997e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1938  F0F1 ATP synthase subunit A  42.86 
 
 
237 aa  196  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00021369  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3831  F0F1 ATP synthase subunit A  37.07 
 
 
239 aa  162  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000137067  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0461  ATP synthase F0, A subunit  39.74 
 
 
235 aa  162  6e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000814456  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2183  F0F1 ATP synthase subunit A  39.67 
 
 
242 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.22629  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2145  F0F1 ATP synthase subunit A  39.67 
 
 
242 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.186735  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0659  F0F1-type ATP synthase, subunit a  37.6 
 
 
241 aa  156  3e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.320134  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1875  F0F1-type ATP synthase, subunit a  37.3 
 
 
241 aa  155  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.257614  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  36.36 
 
 
237 aa  154  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5433  F0F1 ATP synthase subunit A  35.15 
 
 
239 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5436  F0F1 ATP synthase subunit A  34.73 
 
 
239 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0528964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5489  F0F1 ATP synthase subunit A  34.73 
 
 
239 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5518  F0F1 ATP synthase subunit A  34.73 
 
 
239 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000410336  hitchhiker  3.2870800000000003e-19 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5011  F0F1 ATP synthase subunit A  34.31 
 
 
239 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5402  F0F1 ATP synthase subunit A  35.44 
 
 
239 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.39849e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5161  F0F1 ATP synthase subunit A  35.44 
 
 
239 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4994  F0F1 ATP synthase subunit A  35.44 
 
 
239 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000342727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5553  F0F1 ATP synthase subunit A  35.44 
 
 
239 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000158416  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3309  F0F1 ATP synthase subunit A  34.78 
 
 
236 aa  148  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000902841  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5109  F0F1 ATP synthase subunit A  35.34 
 
 
239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00506372  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1715  F0F1 ATP synthase subunit A  35.86 
 
 
242 aa  135  7.000000000000001e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1244  F0F1-type ATP synthase, subunit a  45.75 
 
 
154 aa  122  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000114749  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  33.62 
 
 
246 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  32.07 
 
 
235 aa  113  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  28.07 
 
 
262 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  32.92 
 
 
245 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  31.54 
 
 
251 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  33.5 
 
 
194 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  33.95 
 
 
207 aa  104  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0197  ATP synthase F0, A subunit  30.38 
 
 
301 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000520668  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2763  ATP synthase F0, A subunit  30.08 
 
 
254 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  31.25 
 
 
241 aa  102  7e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  26.84 
 
 
271 aa  102  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0296  F0F1 ATP synthase subunit A  30.95 
 
 
280 aa  100  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  32.49 
 
 
230 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  30.29 
 
 
241 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  27.67 
 
 
218 aa  99.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  28.97 
 
 
284 aa  99.4  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  34.5 
 
 
227 aa  98.6  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  29.95 
 
 
231 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  29.88 
 
 
243 aa  97.4  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  31.6 
 
 
241 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  29.27 
 
 
232 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1279  F0F1 ATP synthase subunit A  29.78 
 
 
280 aa  95.9  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0786025  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1175  F0F1 ATP synthase subunit A  29.78 
 
 
280 aa  95.9  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.108763  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  26.61 
 
 
224 aa  95.5  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  30.53 
 
 
241 aa  95.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  32.09 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  32.09 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  29.25 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  30 
 
 
295 aa  94.7  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2458  F0F1 ATP synthase subunit A  33 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  31.96 
 
 
249 aa  93.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  32.42 
 
 
261 aa  94  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15751  F0F1 ATP synthase subunit A  30.59 
 
 
241 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  30.41 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  30.29 
 
 
243 aa  93.2  3e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  30.41 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  29.86 
 
 
225 aa  92.8  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  29.95 
 
 
226 aa  92  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0986  F0F1 ATP synthase subunit A  29.68 
 
 
241 aa  92  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18541  F0F1 ATP synthase subunit A  29.68 
 
 
241 aa  92  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0228025  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  32.34 
 
 
261 aa  91.7  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  32.02 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16351  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
188 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2312  F0F1 ATP synthase subunit A  29.69 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  30.26 
 
 
227 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  30.61 
 
 
231 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  30.81 
 
 
251 aa  90.1  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  30.26 
 
 
227 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4334  F0F1 ATP synthase subunit A  29.69 
 
 
256 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442286  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  31.66 
 
 
257 aa  89.4  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0423  F0F1 ATP synthase subunit A  31.41 
 
 
233 aa  88.6  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  30.09 
 
 
225 aa  88.6  7e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  28.78 
 
 
226 aa  88.6  8e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2648  F0F1 ATP synthase subunit A  31.41 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0127  F0F1 ATP synthase subunit A  31.41 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2790  F0F1 ATP synthase subunit A  31.41 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1052  F0F1 ATP synthase subunit A  31.41 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  29.67 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1294  F0F1 ATP synthase subunit A  31.41 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.322594  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0151  F0F1 ATP synthase subunit A  31.41 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.158772  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  29.09 
 
 
226 aa  88.2  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2168  F0F1 ATP synthase subunit A  31.34 
 
 
218 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0512  ATP synthase F0, A subunit  27.87 
 
 
312 aa  87  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  29.27 
 
 
342 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2616  F0F1 ATP synthase subunit A  32.83 
 
 
251 aa  86.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68842  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1031  ATP synthase F0, A subunit  29.58 
 
 
307 aa  86.3  4e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2436  F0F1 ATP synthase subunit A  29.28 
 
 
266 aa  86.3  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.393005  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  28.26 
 
 
271 aa  85.9  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  29.78 
 
 
251 aa  85.9  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  30.81 
 
 
228 aa  85.9  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3956  F0F1 ATP synthase subunit A  28.7 
 
 
251 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0660881 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0751  F0F1 ATP synthase subunit A  37.9 
 
 
272 aa  85.5  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.146612  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  32.32 
 
 
253 aa  85.9  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3868  F0F1 ATP synthase subunit A  28.7 
 
 
251 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal  0.0791726 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3882  F0F1 ATP synthase subunit A  28.7 
 
 
251 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  29.49 
 
 
217 aa  85.1  9e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  29.96 
 
 
253 aa  85.1  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>