More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1279 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1279  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
280 aa  557  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0786025  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1175  F0F1 ATP synthase subunit A  98.57 
 
 
280 aa  553  1e-157  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.108763  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0296  F0F1 ATP synthase subunit A  58.01 
 
 
280 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  52.56 
 
 
295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0751  F0F1 ATP synthase subunit A  55.14 
 
 
272 aa  264  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.146612  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  38.07 
 
 
216 aa  132  9e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  34.26 
 
 
224 aa  126  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3831  F0F1 ATP synthase subunit A  31.97 
 
 
239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000137067  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  34.54 
 
 
271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  29.36 
 
 
237 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5161  F0F1 ATP synthase subunit A  32.49 
 
 
239 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4994  F0F1 ATP synthase subunit A  32.49 
 
 
239 aa  106  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000342727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5553  F0F1 ATP synthase subunit A  32.49 
 
 
239 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000158416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5402  F0F1 ATP synthase subunit A  32.49 
 
 
239 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.39849e-58 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5011  F0F1 ATP synthase subunit A  31.65 
 
 
239 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110706  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5436  F0F1 ATP synthase subunit A  31.65 
 
 
239 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0528964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5489  F0F1 ATP synthase subunit A  31.65 
 
 
239 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5518  F0F1 ATP synthase subunit A  31.65 
 
 
239 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000410336  hitchhiker  3.2870800000000003e-19 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  32.63 
 
 
218 aa  105  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0197  ATP synthase F0, A subunit  34.68 
 
 
301 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000520668  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5109  F0F1 ATP synthase subunit A  32.07 
 
 
239 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00506372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5433  F0F1 ATP synthase subunit A  31.22 
 
 
239 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  35.07 
 
 
235 aa  102  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  28.95 
 
 
257 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3309  F0F1 ATP synthase subunit A  31.65 
 
 
236 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000902841  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2145  F0F1 ATP synthase subunit A  29.96 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.186735  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2183  F0F1 ATP synthase subunit A  29.96 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.22629  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  33.94 
 
 
229 aa  96.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  33.7 
 
 
239 aa  96.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  29.78 
 
 
235 aa  95.9  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  33.9 
 
 
271 aa  95.5  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  33.03 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0858  F0F1 ATP synthase subunit A  29.6 
 
 
238 aa  94  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  31.96 
 
 
229 aa  93.2  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3956  F0F1 ATP synthase subunit A  33.61 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0660881 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3868  F0F1 ATP synthase subunit A  33.61 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal  0.0791726 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3882  F0F1 ATP synthase subunit A  33.61 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  31.55 
 
 
234 aa  90.1  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  30.87 
 
 
284 aa  90.1  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  30.7 
 
 
246 aa  89.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  28.44 
 
 
243 aa  89.4  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1875  F0F1-type ATP synthase, subunit a  30.83 
 
 
241 aa  89  7e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.257614  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  28.34 
 
 
262 aa  89  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  33.01 
 
 
229 aa  88.6  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  31.55 
 
 
230 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  32.2 
 
 
229 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11331  F0F1 ATP synthase subunit A  34.32 
 
 
250 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  26.54 
 
 
194 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  29.13 
 
 
251 aa  87  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  27.62 
 
 
230 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3102  F0F1 ATP synthase subunit A  34.11 
 
 
229 aa  87.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00224256  normal  0.218622 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  36.75 
 
 
231 aa  87  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4334  F0F1 ATP synthase subunit A  31.95 
 
 
256 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442286  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  33.17 
 
 
229 aa  86.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  28.64 
 
 
236 aa  86.3  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2312  F0F1 ATP synthase subunit A  31.54 
 
 
259 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  30.73 
 
 
229 aa  85.9  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  29.17 
 
 
231 aa  85.9  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  32.68 
 
 
229 aa  85.9  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  28.94 
 
 
251 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  33.5 
 
 
229 aa  85.5  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  28.94 
 
 
251 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  30.5 
 
 
228 aa  85.1  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
223 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  30.1 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0304  F0F1 ATP synthase subunit A  31.43 
 
 
268 aa  84  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000278138  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  30.52 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1938  F0F1 ATP synthase subunit A  26.97 
 
 
237 aa  84  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00021369  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  28.02 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  25.38 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1915  ATP synthase F0, A subunit  33.17 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  32.43 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  26.25 
 
 
245 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0892  F0F1 ATP synthase subunit A  29.74 
 
 
223 aa  82  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.546785  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1715  F0F1 ATP synthase subunit A  28.51 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2750  F0F1 ATP synthase subunit A  30.95 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000190697  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  27.52 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06110  F0F1 ATP synthase subunit A  29.06 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  31.03 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  28.51 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  26.61 
 
 
226 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  28.92 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  26.86 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  27.27 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  28.18 
 
 
241 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  29.44 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0461  ATP synthase F0, A subunit  27.98 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000814456  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  28.23 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  28.22 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  28.22 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  27.44 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  25.69 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  25.69 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0659  F0F1-type ATP synthase, subunit a  27 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.320134  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  27.86 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04089  F0F1 ATP synthase subunit A  31.25 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0056302  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1271  ATP synthase F0, A subunit  26.8 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0518  ATP synthase F0, A subunit  25.37 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  29.03 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  28.92 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>