More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3053 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 		 246 aa  494  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  75.73 
 
 		 243 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  75.22 
 
 		 231 aa  359  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  73.89 
 
 		 231 aa  349  2e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  71.3 
 
 		 236 aa  336  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0467  F0F1 ATP synthase subunit A  74.77 
 
 		 233 aa  327  9e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.104154 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  60.67 
 
 		 239 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3102  F0F1 ATP synthase subunit A  67.69 
 
 		 229 aa  310  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00224256  normal  0.218622 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  60.82 
 
 		 251 aa  310  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  66.22 
 
 		 223 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0892  F0F1 ATP synthase subunit A  64.84 
 
 		 223 aa  293  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.546785  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2993  F0F1 ATP synthase subunit A  57.56 
 
 		 239 aa  260  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  54.82 
 
 		 229 aa  236  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  44.95 
 
 		 232 aa  185  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  42.53 
 
 		 232 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  42.79 
 
 		 230 aa  174  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  44.29 
 
 		 227 aa  168  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  39.01 
 
 		 231 aa  168  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  43.81 
 
 		 227 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  42.58 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  40.57 
 
 		 232 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  41.33 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  44.69 
 
 		 194 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0423  F0F1 ATP synthase subunit A  40.37 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2790  F0F1 ATP synthase subunit A  40.37 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0127  F0F1 ATP synthase subunit A  40.37 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1052  F0F1 ATP synthase subunit A  40.37 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0151  F0F1 ATP synthase subunit A  40.37 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.158772  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2648  F0F1 ATP synthase subunit A  40.37 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1294  F0F1 ATP synthase subunit A  40.37 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.322594  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  37.04 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  40.93 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  36.92 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  39.82 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  41.67 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  35.86 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  35.35 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  34 
 
 		 234 aa  119  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  35 
 
 		 234 aa  118  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  34.34 
 
 		 229 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  33.84 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  34.83 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  33.01 
 
 		 235 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  35.86 
 
 		 230 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  34.53 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  33.18 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  31.75 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  31.84 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  34.6 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  31.8 
 
 		 217 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  32.83 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  30.58 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  31.68 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  31.76 
 
 		 241 aa  101  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0197  ATP synthase F0, A subunit  29.7 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000520668  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  37.28 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  34.12 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  33.78 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  33.78 
 
 		 257 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  32.02 
 
 		 241 aa  99  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  31 
 
 		 233 aa  99  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  32.02 
 
 		 241 aa  99  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  32.37 
 
 		 239 aa  99  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  32.48 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  33.05 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  31.58 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  31.96 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  31.96 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  31.51 
 
 		 226 aa  95.9  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  30.63 
 
 		 226 aa  95.9  6e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15751  F0F1 ATP synthase subunit A  30.9 
 
 		 241 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2616  F0F1 ATP synthase subunit A  33.63 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  29.47 
 
 		 224 aa  94.4  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  29.9 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  28.7 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 252 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0986  F0F1 ATP synthase subunit A  30.9 
 
 		 241 aa  92.4  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18541  F0F1 ATP synthase subunit A  30.9 
 
 		 241 aa  92.4  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0228025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  31.53 
 
 		 251 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  31.53 
 
 		 251 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  30.21 
 
 		 267 aa  90.5  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0858  F0F1 ATP synthase subunit A  33.04 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  30.59 
 
 		 227 aa  89.7  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  29.33 
 
 		 225 aa  89  7e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  28.37 
 
 		 234 aa  88.6  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  28.5 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  34.67 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2458  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  32.29 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  25.1 
 
 		 284 aa  86.3  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0723  F0F1 ATP synthase subunit A  30.87 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2168  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 218 aa  85.1  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  28.22 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1299  ATP synthase F0, A subunit  31.18 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  30 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0296  F0F1 ATP synthase subunit A  29.74 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16351  F0F1 ATP synthase subunit A  33.7 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  29.5 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1031  ATP synthase F0, A subunit  28.11 
 
 		 307 aa  82  0.000000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1279  F0F1 ATP synthase subunit A  27.52 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0786025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>