More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4797 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 
245 aa  489  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  43.04 
 
 
246 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  39.43 
 
 
257 aa  181  8.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  38.43 
 
 
262 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  39.22 
 
 
271 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3831  F0F1 ATP synthase subunit A  37.66 
 
 
239 aa  146  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000137067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  36.14 
 
 
237 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3309  F0F1 ATP synthase subunit A  38 
 
 
236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000902841  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  35.15 
 
 
241 aa  139  6e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  34.31 
 
 
241 aa  135  5e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5402  F0F1 ATP synthase subunit A  36.14 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.39849e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5161  F0F1 ATP synthase subunit A  36.14 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4994  F0F1 ATP synthase subunit A  36.14 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000342727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5553  F0F1 ATP synthase subunit A  36.14 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000158416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5433  F0F1 ATP synthase subunit A  36.55 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  34.03 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5518  F0F1 ATP synthase subunit A  36.14 
 
 
239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000410336  hitchhiker  3.2870800000000003e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5436  F0F1 ATP synthase subunit A  36.14 
 
 
239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0528964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5011  F0F1 ATP synthase subunit A  36.14 
 
 
239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5489  F0F1 ATP synthase subunit A  36.14 
 
 
239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5109  F0F1 ATP synthase subunit A  36.14 
 
 
239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00506372  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  36.05 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  35.44 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  36.05 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  32.92 
 
 
241 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  34.31 
 
 
261 aa  129  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  36.36 
 
 
249 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  32.92 
 
 
241 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  32.92 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  34.33 
 
 
252 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2616  F0F1 ATP synthase subunit A  34.58 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68842  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0659  F0F1-type ATP synthase, subunit a  33.33 
 
 
241 aa  123  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.320134  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0461  ATP synthase F0, A subunit  32.26 
 
 
235 aa  122  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000814456  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0986  F0F1 ATP synthase subunit A  31.28 
 
 
241 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18541  F0F1 ATP synthase subunit A  31.28 
 
 
241 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0228025  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15751  F0F1 ATP synthase subunit A  30.45 
 
 
241 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1875  F0F1-type ATP synthase, subunit a  31.97 
 
 
241 aa  118  7.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.257614  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  31.43 
 
 
271 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2145  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.186735  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2183  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.22629  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  35.81 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0197  ATP synthase F0, A subunit  31.18 
 
 
301 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000520668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  35.62 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  33.62 
 
 
224 aa  112  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  30.61 
 
 
235 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3209  ATP synthase F0, A subunit  29.92 
 
 
249 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116746  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2813  ATP synthase F0, A subunit  29.92 
 
 
249 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0159651  normal  0.290047 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  32.92 
 
 
235 aa  107  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1715  F0F1 ATP synthase subunit A  33.76 
 
 
242 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  30.43 
 
 
227 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3080  F0F1 ATP synthase subunit A  36.49 
 
 
267 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00958832  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002024  ATP synthase A chain  34.66 
 
 
270 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00428  F0F1 ATP synthase subunit A  34.85 
 
 
270 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4334  F0F1 ATP synthase subunit A  30.31 
 
 
256 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442286  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0858  F0F1 ATP synthase subunit A  32.76 
 
 
238 aa  102  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2312  F0F1 ATP synthase subunit A  30.2 
 
 
259 aa  101  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2522  F0F1 ATP synthase subunit A  37.27 
 
 
270 aa  101  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145329  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2436  F0F1 ATP synthase subunit A  29.92 
 
 
266 aa  101  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.393005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  30.61 
 
 
217 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1702  F0F1 ATP synthase subunit A  33.87 
 
 
265 aa  101  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.223985  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16351  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
188 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2875  F0F1 ATP synthase subunit A  31.12 
 
 
255 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.870432  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  29.75 
 
 
231 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  29.52 
 
 
229 aa  99  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  29.52 
 
 
229 aa  98.6  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  32.33 
 
 
234 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  30.13 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  31.47 
 
 
234 aa  97.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  27.42 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  32.02 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2171  F0F1 ATP synthase subunit A  30.28 
 
 
270 aa  96.7  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000816174  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  29.65 
 
 
216 aa  97.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1938  F0F1 ATP synthase subunit A  27.34 
 
 
237 aa  97.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00021369  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4188  F0F1 ATP synthase subunit A  35.19 
 
 
263 aa  96.7  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000118373  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  31.4 
 
 
234 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  32.17 
 
 
229 aa  96.7  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3742  ATP synthase F0, A subunit  30.6 
 
 
247 aa  96.3  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4541  F0F1 ATP synthase subunit A  35.19 
 
 
266 aa  95.9  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000389155  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4251  F0F1 ATP synthase subunit A  35.45 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000620558  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3311  F0F1 ATP synthase subunit A  28.22 
 
 
257 aa  93.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.374489  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0147  F0F1 ATP synthase subunit A  34.72 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0584066  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11331  F0F1 ATP synthase subunit A  30.04 
 
 
250 aa  94  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3065  F0F1 ATP synthase subunit A  35.16 
 
 
270 aa  93.2  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  30.4 
 
 
229 aa  93.2  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3987  ATP synthase F0, A subunit  34.4 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3758  F0F1 ATP synthase subunit A  31.96 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000113424  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  31.33 
 
 
284 aa  92.8  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  32.86 
 
 
241 aa  93.2  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0751  F0F1 ATP synthase subunit A  29.87 
 
 
272 aa  92.8  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.146612  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  29.13 
 
 
229 aa  92.8  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06110  F0F1 ATP synthase subunit A  30.67 
 
 
255 aa  92.4  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52220  F0F1 ATP synthase subunit A  31.87 
 
 
272 aa  92.4  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5437  F0F1 ATP synthase subunit A  30.17 
 
 
289 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1915  ATP synthase F0, A subunit  30.28 
 
 
251 aa  92  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5206  F0F1 ATP synthase subunit A  30.17 
 
 
289 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.391657  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0474  F0F1 ATP synthase subunit A  28.02 
 
 
287 aa  92  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.152355  normal  0.66197 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4261  F0F1 ATP synthase subunit A  30.86 
 
 
271 aa  92  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0537303  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4202  F0F1 ATP synthase subunit A  30.86 
 
 
271 aa  92  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109875  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4096  F0F1 ATP synthase subunit A  30.86 
 
 
271 aa  92  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000520187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>