More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3421 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
237 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3831  F0F1 ATP synthase subunit A  71.37 
 
 
239 aa  346  1e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000137067  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3309  F0F1 ATP synthase subunit A  72.57 
 
 
236 aa  344  6e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000902841  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5433  F0F1 ATP synthase subunit A  70.95 
 
 
239 aa  335  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5436  F0F1 ATP synthase subunit A  70.54 
 
 
239 aa  333  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0528964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5489  F0F1 ATP synthase subunit A  70.54 
 
 
239 aa  333  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5518  F0F1 ATP synthase subunit A  70.54 
 
 
239 aa  333  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000410336  hitchhiker  3.2870800000000003e-19 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5011  F0F1 ATP synthase subunit A  70.54 
 
 
239 aa  332  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5161  F0F1 ATP synthase subunit A  70.54 
 
 
239 aa  332  4e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4994  F0F1 ATP synthase subunit A  70.54 
 
 
239 aa  332  4e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000342727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5553  F0F1 ATP synthase subunit A  70.54 
 
 
239 aa  332  4e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000158416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5402  F0F1 ATP synthase subunit A  70.54 
 
 
239 aa  332  4e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.39849e-58 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5109  F0F1 ATP synthase subunit A  69.71 
 
 
239 aa  329  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00506372  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2145  F0F1 ATP synthase subunit A  57.44 
 
 
242 aa  279  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.186735  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2183  F0F1 ATP synthase subunit A  57.44 
 
 
242 aa  279  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.22629  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1715  F0F1 ATP synthase subunit A  57.85 
 
 
242 aa  254  9e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0461  ATP synthase F0, A subunit  42.13 
 
 
235 aa  194  1e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000814456  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1875  F0F1-type ATP synthase, subunit a  39.42 
 
 
241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.257614  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0858  F0F1 ATP synthase subunit A  37.07 
 
 
238 aa  161  7e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1938  F0F1 ATP synthase subunit A  39.65 
 
 
237 aa  160  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00021369  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0659  F0F1-type ATP synthase, subunit a  37.77 
 
 
241 aa  155  7e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.320134  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  36.36 
 
 
235 aa  154  9e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  36.14 
 
 
245 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1244  F0F1-type ATP synthase, subunit a  44.81 
 
 
154 aa  142  5e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000114749  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  35.71 
 
 
246 aa  136  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  35.24 
 
 
262 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  34.33 
 
 
257 aa  126  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  31.6 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  32.92 
 
 
271 aa  113  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  34.38 
 
 
271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  36.18 
 
 
217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2763  ATP synthase F0, A subunit  32.37 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  33.78 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2312  F0F1 ATP synthase subunit A  33.74 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0296  F0F1 ATP synthase subunit A  32.55 
 
 
280 aa  109  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2803  F0F1 ATP synthase subunit A  35.17 
 
 
280 aa  109  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00368483  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4334  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442286  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1279  F0F1 ATP synthase subunit A  29.36 
 
 
280 aa  108  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0786025  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1175  F0F1 ATP synthase subunit A  29.36 
 
 
280 aa  108  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.108763  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  32.29 
 
 
216 aa  105  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 
229 aa  105  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  32.86 
 
 
229 aa  104  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  30.77 
 
 
284 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0751  F0F1 ATP synthase subunit A  30.53 
 
 
272 aa  103  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.146612  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  34.27 
 
 
226 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  34.27 
 
 
226 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  34.45 
 
 
229 aa  102  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  32.34 
 
 
218 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  33.81 
 
 
229 aa  102  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  34.11 
 
 
226 aa  101  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  33.8 
 
 
229 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  35.44 
 
 
239 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  33.66 
 
 
251 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  33.66 
 
 
251 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4108  F0F1 ATP synthase subunit A  32.63 
 
 
266 aa  99.8  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  8.0507200000000005e-19  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  35.41 
 
 
234 aa  99.4  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  33.67 
 
 
194 aa  99.4  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3080  F0F1 ATP synthase subunit A  38.5 
 
 
267 aa  98.6  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00958832  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  32.55 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  31.17 
 
 
225 aa  97.4  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  30.81 
 
 
241 aa  97.4  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  33.17 
 
 
230 aa  97.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  32.35 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1915  ATP synthase F0, A subunit  33.06 
 
 
251 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  31.34 
 
 
241 aa  96.7  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  32.05 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11331  F0F1 ATP synthase subunit A  32.63 
 
 
250 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0209  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
283 aa  95.9  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  32.68 
 
 
229 aa  95.1  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  30.54 
 
 
252 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6362  F0F1 ATP synthase subunit A  33.19 
 
 
289 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2875  F0F1 ATP synthase subunit A  31.8 
 
 
255 aa  94.4  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.870432  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73310  F0F1 ATP synthase subunit A  33.19 
 
 
289 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.529883  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2593  ATP synthase F0, A subunit  32.19 
 
 
289 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37726  normal  0.0949349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3956  F0F1 ATP synthase subunit A  32.91 
 
 
251 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0660881 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3868  F0F1 ATP synthase subunit A  32.91 
 
 
251 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal  0.0791726 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3882  F0F1 ATP synthase subunit A  32.91 
 
 
251 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  32.54 
 
 
234 aa  94  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  32.2 
 
 
229 aa  92.8  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0034  F0F1 ATP synthase subunit A  34.62 
 
 
283 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0259709  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  26.05 
 
 
235 aa  92.8  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  30.66 
 
 
241 aa  92  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2142  F0F1 ATP synthase subunit A  33.9 
 
 
264 aa  92.4  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  29.65 
 
 
227 aa  92  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3742  ATP synthase F0, A subunit  31.46 
 
 
247 aa  92  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 
234 aa  92  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2616  F0F1 ATP synthase subunit A  30.92 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68842  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4876  F0F1 ATP synthase subunit A  30.31 
 
 
289 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  31.25 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2168  F0F1 ATP synthase subunit A  29.28 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4753  F0F1 ATP synthase subunit A  33.49 
 
 
264 aa  90.1  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5605  ATP synthase F0, A subunit  31.91 
 
 
289 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5437  F0F1 ATP synthase subunit A  31.2 
 
 
289 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0182  F0F1 ATP synthase subunit A  33.47 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.147393  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4048  F0F1 ATP synthase subunit A  32.53 
 
 
289 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3974  F0F1 ATP synthase subunit A  32.53 
 
 
289 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338825  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3361  F0F1 ATP synthase subunit A  32.53 
 
 
289 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.148624  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1593  F0F1 ATP synthase subunit A  32.53 
 
 
289 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000136963  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2458  F0F1 ATP synthase subunit A  29.52 
 
 
224 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2436  F0F1 ATP synthase subunit A  32.26 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.393005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>