More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2143 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 
257 aa  523  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  56 
 
 
271 aa  276  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  42.39 
 
 
246 aa  215  7e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  42.52 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  39.43 
 
 
245 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  32.24 
 
 
234 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3831  F0F1 ATP synthase subunit A  34.71 
 
 
239 aa  129  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000137067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5161  F0F1 ATP synthase subunit A  35.68 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4994  F0F1 ATP synthase subunit A  35.68 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000342727  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5011  F0F1 ATP synthase subunit A  35.68 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110706  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5553  F0F1 ATP synthase subunit A  35.68 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000158416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5402  F0F1 ATP synthase subunit A  35.68 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.39849e-58 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5433  F0F1 ATP synthase subunit A  35.27 
 
 
239 aa  126  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5436  F0F1 ATP synthase subunit A  35.27 
 
 
239 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0528964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5518  F0F1 ATP synthase subunit A  35.27 
 
 
239 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000410336  hitchhiker  3.2870800000000003e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5489  F0F1 ATP synthase subunit A  35.27 
 
 
239 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  34.33 
 
 
237 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  33.81 
 
 
234 aa  123  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5109  F0F1 ATP synthase subunit A  34.44 
 
 
239 aa  123  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00506372  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  34.78 
 
 
218 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  32.9 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  33.04 
 
 
224 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0751  F0F1 ATP synthase subunit A  32.55 
 
 
272 aa  119  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.146612  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  34.91 
 
 
229 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2813  ATP synthase F0, A subunit  34.5 
 
 
249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0159651  normal  0.290047 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3209  ATP synthase F0, A subunit  34.5 
 
 
249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116746  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  32.41 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  31.19 
 
 
229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  37.3 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3309  F0F1 ATP synthase subunit A  33.47 
 
 
236 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000902841  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  33.17 
 
 
228 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
241 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  29.36 
 
 
229 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15751  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
241 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  31.38 
 
 
234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  32.08 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  30.09 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0986  F0F1 ATP synthase subunit A  32.49 
 
 
241 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18541  F0F1 ATP synthase subunit A  32.49 
 
 
241 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0228025  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3080  F0F1 ATP synthase subunit A  31.99 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00958832  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  33.74 
 
 
295 aa  109  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  31.19 
 
 
229 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  30.73 
 
 
229 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  31.65 
 
 
241 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  34.18 
 
 
257 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  28.44 
 
 
229 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  31.48 
 
 
230 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  30.8 
 
 
241 aa  106  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  31.65 
 
 
241 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  31.65 
 
 
241 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  31.49 
 
 
227 aa  106  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  27.98 
 
 
229 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  31.65 
 
 
241 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2183  F0F1 ATP synthase subunit A  32.23 
 
 
242 aa  105  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.22629  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  33.94 
 
 
233 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2145  F0F1 ATP synthase subunit A  32.23 
 
 
242 aa  105  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.186735  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  31.06 
 
 
261 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  30.28 
 
 
229 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  34.43 
 
 
226 aa  104  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000656805  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  32.5 
 
 
249 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  36.67 
 
 
251 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  36.67 
 
 
251 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  30.14 
 
 
207 aa  102  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  34.74 
 
 
220 aa  102  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0296  F0F1 ATP synthase subunit A  29.6 
 
 
280 aa  100  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1175  F0F1 ATP synthase subunit A  28.95 
 
 
280 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.108763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1279  F0F1 ATP synthase subunit A  28.95 
 
 
280 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0786025  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  32.76 
 
 
253 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  31.48 
 
 
233 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0197  ATP synthase F0, A subunit  30.17 
 
 
301 aa  99.8  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000520668  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3059  F0F1 ATP synthase subunit A  31.02 
 
 
278 aa  99.4  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2916  F0F1 ATP synthase subunit A  31.02 
 
 
278 aa  99.4  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16351  F0F1 ATP synthase subunit A  35.38 
 
 
188 aa  98.6  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  33.62 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1875  F0F1-type ATP synthase, subunit a  33.77 
 
 
241 aa  98.2  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.257614  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  28.37 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  28.37 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2951  F0F1 ATP synthase subunit A  30.77 
 
 
283 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643382  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1593  F0F1 ATP synthase subunit A  30.77 
 
 
289 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000136963  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0185  F0F1 ATP synthase subunit A  30.77 
 
 
283 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.690271  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3009  F0F1 ATP synthase subunit A  30.77 
 
 
289 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0278836  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3361  F0F1 ATP synthase subunit A  30.77 
 
 
289 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.148624  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4048  F0F1 ATP synthase subunit A  30.77 
 
 
289 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3974  F0F1 ATP synthase subunit A  30.77 
 
 
289 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338825  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3650  F0F1 ATP synthase subunit A  34.62 
 
 
264 aa  95.5  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000146441  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3314  F0F1 ATP synthase subunit A  29.96 
 
 
283 aa  94.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000501735  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  28.71 
 
 
231 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2616  F0F1 ATP synthase subunit A  32 
 
 
251 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68842  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  29.22 
 
 
217 aa  93.6  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4753  F0F1 ATP synthase subunit A  34.13 
 
 
264 aa  93.2  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4371  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
278 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000324643  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4334  F0F1 ATP synthase subunit A  30.67 
 
 
256 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442286  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4372  F0F1 ATP synthase subunit A  34.13 
 
 
264 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000188927  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4316  F0F1 ATP synthase subunit A  34.13 
 
 
264 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00103283  hitchhiker  0.000000000108391 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3900  F0F1 ATP synthase subunit A  30.36 
 
 
283 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4513  F0F1 ATP synthase subunit A  34.13 
 
 
264 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00041275  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3851  F0F1 ATP synthase subunit A  33.02 
 
 
264 aa  92.4  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000751121  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0461  ATP synthase F0, A subunit  29.96 
 
 
235 aa  92.4  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000814456  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3931  F0F1 ATP synthase subunit A  34.13 
 
 
264 aa  92.4  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000907169  hitchhiker  0.00676688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>