More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0801 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 
224 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  40.85 
 
 
216 aa  156  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  37.5 
 
 
295 aa  151  8e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  38.21 
 
 
246 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0751  F0F1 ATP synthase subunit A  36.44 
 
 
272 aa  136  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.146612  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0296  F0F1 ATP synthase subunit A  37.27 
 
 
280 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  33.97 
 
 
262 aa  131  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3831  F0F1 ATP synthase subunit A  33.76 
 
 
239 aa  128  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000137067  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1175  F0F1 ATP synthase subunit A  34.26 
 
 
280 aa  126  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.108763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1279  F0F1 ATP synthase subunit A  34.26 
 
 
280 aa  126  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0786025  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  33.62 
 
 
251 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5433  F0F1 ATP synthase subunit A  34.18 
 
 
239 aa  125  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5436  F0F1 ATP synthase subunit A  34.6 
 
 
239 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0528964  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5161  F0F1 ATP synthase subunit A  34.18 
 
 
239 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4994  F0F1 ATP synthase subunit A  34.18 
 
 
239 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000342727  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5011  F0F1 ATP synthase subunit A  34.18 
 
 
239 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5489  F0F1 ATP synthase subunit A  34.6 
 
 
239 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  37.19 
 
 
234 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5553  F0F1 ATP synthase subunit A  34.18 
 
 
239 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000158416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5518  F0F1 ATP synthase subunit A  34.6 
 
 
239 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000410336  hitchhiker  3.2870800000000003e-19 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  37.08 
 
 
271 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5402  F0F1 ATP synthase subunit A  34.18 
 
 
239 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.39849e-58 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  34.01 
 
 
218 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5109  F0F1 ATP synthase subunit A  34.18 
 
 
239 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00506372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  35.08 
 
 
194 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  33.02 
 
 
235 aa  122  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  33.04 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3309  F0F1 ATP synthase subunit A  32.43 
 
 
236 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000902841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2458  F0F1 ATP synthase subunit A  35.86 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  32.47 
 
 
232 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  35.71 
 
 
229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  35.92 
 
 
226 aa  115  5e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  35.92 
 
 
226 aa  115  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  32.47 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  35.32 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  31.6 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  31.84 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  31.84 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3742  ATP synthase F0, A subunit  37.67 
 
 
247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2168  F0F1 ATP synthase subunit A  35.86 
 
 
218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  33.62 
 
 
245 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0197  ATP synthase F0, A subunit  36.75 
 
 
301 aa  112  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000520668  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  34.8 
 
 
230 aa  111  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  34.72 
 
 
239 aa  111  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  33.66 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  34.47 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4334  F0F1 ATP synthase subunit A  33.47 
 
 
256 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442286  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  31.1 
 
 
227 aa  109  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1875  F0F1-type ATP synthase, subunit a  30.94 
 
 
241 aa  108  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.257614  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  32.68 
 
 
231 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2312  F0F1 ATP synthase subunit A  32.63 
 
 
259 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3102  F0F1 ATP synthase subunit A  33 
 
 
229 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00224256  normal  0.218622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  33.33 
 
 
229 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  32.67 
 
 
229 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  32.02 
 
 
231 aa  106  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0892  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
223 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.546785  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  29.9 
 
 
231 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  32.02 
 
 
239 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2145  F0F1 ATP synthase subunit A  29.52 
 
 
242 aa  106  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.186735  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2183  F0F1 ATP synthase subunit A  29.52 
 
 
242 aa  106  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.22629  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  32.66 
 
 
234 aa  105  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  31.63 
 
 
251 aa  105  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 
234 aa  105  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  29.35 
 
 
228 aa  105  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  31.84 
 
 
229 aa  105  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  30.7 
 
 
271 aa  104  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  31.1 
 
 
243 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  28.06 
 
 
231 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  28.06 
 
 
232 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  32.43 
 
 
241 aa  102  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  32.66 
 
 
225 aa  102  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  31.68 
 
 
246 aa  102  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  33.5 
 
 
251 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  34.18 
 
 
226 aa  102  5e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3956  F0F1 ATP synthase subunit A  31.4 
 
 
251 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0660881 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3868  F0F1 ATP synthase subunit A  31.4 
 
 
251 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal  0.0791726 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  33.5 
 
 
251 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3882  F0F1 ATP synthase subunit A  31.4 
 
 
251 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  29.82 
 
 
284 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0558  ATP synthase F0, A subunit  28.21 
 
 
314 aa  100  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000487089  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2993  F0F1 ATP synthase subunit A  32.67 
 
 
239 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_497  ATP synthase F0, A subunit  27.78 
 
 
314 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221508  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0467  F0F1 ATP synthase subunit A  32.18 
 
 
233 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.104154 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  31.53 
 
 
236 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  30.81 
 
 
249 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  32.06 
 
 
226 aa  100  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
225 aa  99.8  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  33.98 
 
 
253 aa  99.4  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0532  ATP synthase F0, A subunit  28.81 
 
 
314 aa  99  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000978517  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  33.01 
 
 
252 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0723  F0F1 ATP synthase subunit A  36.41 
 
 
228 aa  98.6  6e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  29.74 
 
 
232 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  31.53 
 
 
241 aa  98.2  8e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11331  F0F1 ATP synthase subunit A  31.96 
 
 
250 aa  98.2  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  31.84 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  27.64 
 
 
230 aa  97.1  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  32.18 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  31.4 
 
 
233 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  28.37 
 
 
229 aa  95.9  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  27.91 
 
 
229 aa  95.5  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>