More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0532 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0532  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 
314 aa  617  1e-176  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000978517  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0558  ATP synthase F0, A subunit  96.82 
 
 
314 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000487089  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_497  ATP synthase F0, A subunit  96.5 
 
 
314 aa  601  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221508  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  34.57 
 
 
284 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0991  ATP synthase F0, A subunit  35.14 
 
 
308 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.773987  normal  0.702007 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0518  ATP synthase F0, A subunit  31.41 
 
 
324 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1271  ATP synthase F0, A subunit  31.02 
 
 
331 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  33.9 
 
 
234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4066  ATP synthase F0, A subunit  44.22 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000333468  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0512  ATP synthase F0, A subunit  33.21 
 
 
312 aa  116  6e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  32.34 
 
 
229 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  32.77 
 
 
229 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  29.37 
 
 
218 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  34.18 
 
 
230 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  29.54 
 
 
216 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  29.92 
 
 
227 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  30.96 
 
 
229 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  31.38 
 
 
229 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  32.34 
 
 
229 aa  99  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  28.81 
 
 
224 aa  99  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  28.91 
 
 
232 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  31.85 
 
 
229 aa  97.1  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  28.09 
 
 
225 aa  94.4  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  29.48 
 
 
241 aa  94  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  32.49 
 
 
229 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  31.8 
 
 
227 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  31.8 
 
 
227 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  29.2 
 
 
241 aa  91.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  30.59 
 
 
232 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  31.03 
 
 
229 aa  90.5  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  31.51 
 
 
261 aa  89.4  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  28.29 
 
 
231 aa  89  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  31.22 
 
 
226 aa  89  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000656805  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0881  ATP synthase F0, A subunit  30.89 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  29.46 
 
 
249 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  30.84 
 
 
251 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  28.4 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  28.51 
 
 
251 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  30.84 
 
 
251 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  29.05 
 
 
207 aa  87.8  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  30.67 
 
 
253 aa  86.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  28.95 
 
 
232 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  30.48 
 
 
194 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  29.12 
 
 
241 aa  86.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  28.57 
 
 
225 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  29.17 
 
 
257 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  29.46 
 
 
226 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  28.12 
 
 
226 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  28.57 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  27.78 
 
 
217 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  28.57 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  29.96 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  29.46 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  29.01 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  26.16 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  30.67 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  29.07 
 
 
226 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  26.03 
 
 
239 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2616  F0F1 ATP synthase subunit A  30.57 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68842  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  31.11 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  28.14 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  27.27 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  30.25 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  28.23 
 
 
241 aa  80.1  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  28.23 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  28.23 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  25.94 
 
 
246 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11331  F0F1 ATP synthase subunit A  27.69 
 
 
250 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15751  F0F1 ATP synthase subunit A  28.35 
 
 
241 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  27.63 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  27.71 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  29.56 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  26.75 
 
 
220 aa  77  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  27.27 
 
 
233 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18541  F0F1 ATP synthase subunit A  28.15 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0228025  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0986  F0F1 ATP synthase subunit A  28.15 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  26.1 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  27.2 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0723  F0F1 ATP synthase subunit A  29.52 
 
 
228 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  26.43 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  24.49 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  24.9 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0751  F0F1 ATP synthase subunit A  28.07 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.146612  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  27.08 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  28.19 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  27.13 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  24.6 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  28.68 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  28.68 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  28.68 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4472  ATP synthase F0, A subunit  28.17 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0423  F0F1 ATP synthase subunit A  30.12 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  29.5 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  28.62 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  28.99 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  26.21 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  30.74 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  25.81 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  29.13 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  26.12 
 
 
345 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>