More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2700 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 		 233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  71.24 
 
 		 233 aa  355  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  70.82 
 
 		 233 aa  347  1e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  60 
 
 		 234 aa  294  8e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  54.51 
 
 		 234 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  53.65 
 
 		 226 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000656805  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  46.98 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  47.28 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  46.98 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  50 
 
 		 229 aa  205  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  49.01 
 
 		 229 aa  204  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  50.5 
 
 		 229 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  48.53 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  43.97 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  44.4 
 
 		 230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  49.5 
 
 		 229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  46.51 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  45.32 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  37.25 
 
 		 207 aa  161  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  39.73 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  44.09 
 
 		 224 aa  151  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  38.6 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  38.6 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  37.5 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  37.09 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  37.09 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  37.56 
 
 		 226 aa  145  5e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  35.58 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  40 
 
 		 217 aa  133  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  34.95 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  36.89 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4472  ATP synthase F0, A subunit  35.86 
 
 		 258 aa  121  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0723  F0F1 ATP synthase subunit A  36.63 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  34.48 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  34.48 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1299  ATP synthase F0, A subunit  40.54 
 
 		 245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  36.08 
 
 		 216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  32.41 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  33.49 
 
 		 230 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  30.23 
 
 		 228 aa  111  9e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  28.51 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  39.24 
 
 		 220 aa  108  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  29.21 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  34.38 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  34.06 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  33.17 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  37.44 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  35.68 
 
 		 217 aa  105  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  31.4 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  30.69 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  30 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  32.84 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  32.17 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  34.35 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  29.2 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  32.86 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  32.75 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  30.92 
 
 		 251 aa  101  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  30.92 
 
 		 251 aa  101  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  30.96 
 
 		 223 aa  101  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  33.03 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  29.5 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  31.48 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  29.76 
 
 		 236 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  31.48 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  31.6 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  30.7 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  30.52 
 
 		 251 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  34.07 
 
 		 257 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  33.03 
 
 		 252 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  32.04 
 
 		 235 aa  99.4  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  30.65 
 
 		 239 aa  99  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0467  F0F1 ATP synthase subunit A  31.07 
 
 		 233 aa  99  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.104154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  32.92 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  31 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  31.73 
 
 		 232 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  30.23 
 
 		 261 aa  98.6  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3102  F0F1 ATP synthase subunit A  31.22 
 
 		 229 aa  98.6  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00224256  normal  0.218622 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  30.23 
 
 		 247 aa  98.2  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  34.35 
 
 		 241 aa  98.2  9e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2879  F0F1 ATP synthase subunit A  33.83 
 
 		 248 aa  98.2  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.775771  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  33.19 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  31.98 
 
 		 261 aa  97.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  33.19 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15751  F0F1 ATP synthase subunit A  33.19 
 
 		 241 aa  95.5  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  29.27 
 
 		 243 aa  95.1  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18541  F0F1 ATP synthase subunit A  33.19 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0228025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0986  F0F1 ATP synthase subunit A  33.19 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  29 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  30.5 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  30.47 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0423  F0F1 ATP synthase subunit A  30.85 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  29.27 
 
 		 224 aa  93.6  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  29.32 
 
 		 251 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  32.16 
 
 		 271 aa  92.8  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2993  F0F1 ATP synthase subunit A  31.72 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  28.57 
 
 		 251 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  32.44 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16351  F0F1 ATP synthase subunit A  34.57 
 
 		 188 aa  91.7  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>