More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1339 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
224 aa  449  1e-125  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  61.78 
 
 
225 aa  287  8e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  61.95 
 
 
226 aa  287  1e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  59.56 
 
 
226 aa  275  4e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  58.67 
 
 
225 aa  271  5.000000000000001e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  59.38 
 
 
226 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  59.38 
 
 
226 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  56 
 
 
227 aa  263  1e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  58.48 
 
 
226 aa  263  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0723  F0F1 ATP synthase subunit A  53.98 
 
 
228 aa  245  4e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  43.65 
 
 
229 aa  160  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  44.44 
 
 
229 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  46.74 
 
 
207 aa  159  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  45.11 
 
 
229 aa  158  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  39.45 
 
 
229 aa  157  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  44.15 
 
 
229 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  40.96 
 
 
230 aa  155  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  42.11 
 
 
234 aa  155  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  42.39 
 
 
229 aa  153  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  44.09 
 
 
233 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  39.53 
 
 
234 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  40.43 
 
 
229 aa  149  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  40.43 
 
 
229 aa  149  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  42.62 
 
 
233 aa  148  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  45.56 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  41.62 
 
 
239 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  39.59 
 
 
234 aa  142  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  41.4 
 
 
234 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  40.28 
 
 
217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1299  ATP synthase F0, A subunit  39.77 
 
 
245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  40.98 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000656805  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  32.42 
 
 
251 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  34.04 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  34.59 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  34.87 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  30.09 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3102  F0F1 ATP synthase subunit A  34.09 
 
 
229 aa  106  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00224256  normal  0.218622 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  34.01 
 
 
232 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  33.52 
 
 
239 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  33.16 
 
 
231 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  32.39 
 
 
223 aa  101  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  34.41 
 
 
230 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  30.48 
 
 
236 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  32.31 
 
 
227 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  35.8 
 
 
220 aa  99.8  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0892  F0F1 ATP synthase subunit A  30.14 
 
 
223 aa  99  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.546785  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  34.59 
 
 
231 aa  98.2  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4472  ATP synthase F0, A subunit  34.29 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  35.5 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  32.96 
 
 
230 aa  97.1  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0467  F0F1 ATP synthase subunit A  28.7 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.104154 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0423  F0F1 ATP synthase subunit A  36.87 
 
 
233 aa  95.9  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  34.13 
 
 
249 aa  94.7  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0127  F0F1 ATP synthase subunit A  36.87 
 
 
233 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1052  F0F1 ATP synthase subunit A  36.87 
 
 
233 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  31.19 
 
 
241 aa  94.4  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  31.19 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2648  F0F1 ATP synthase subunit A  36.87 
 
 
233 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  29.47 
 
 
246 aa  94.4  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1294  F0F1 ATP synthase subunit A  36.87 
 
 
233 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.322594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2790  F0F1 ATP synthase subunit A  36.87 
 
 
233 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0151  F0F1 ATP synthase subunit A  36.87 
 
 
233 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.158772  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  34.33 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  33.82 
 
 
241 aa  92.8  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  27.17 
 
 
224 aa  92.4  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  36.11 
 
 
217 aa  91.7  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  32.16 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  34.31 
 
 
284 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  34.74 
 
 
268 aa  91.3  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2616  F0F1 ATP synthase subunit A  31.19 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68842  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  33.16 
 
 
229 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  27.62 
 
 
243 aa  90.1  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  31.88 
 
 
241 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  31.88 
 
 
241 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  30.52 
 
 
303 aa  89.4  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  31.88 
 
 
241 aa  89  5e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  34.43 
 
 
283 aa  89  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  29 
 
 
271 aa  89  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2993  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
239 aa  88.6  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  29.55 
 
 
246 aa  88.2  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  34.39 
 
 
228 aa  88.2  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  27.88 
 
 
284 aa  87.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18541  F0F1 ATP synthase subunit A  33.64 
 
 
241 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0228025  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0986  F0F1 ATP synthase subunit A  33.64 
 
 
241 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  34.22 
 
 
227 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15751  F0F1 ATP synthase subunit A  33.64 
 
 
241 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  31.22 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  31.22 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  29.58 
 
 
237 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  34.22 
 
 
227 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  30.39 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  31.98 
 
 
261 aa  86.7  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  31.58 
 
 
263 aa  85.9  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  33.92 
 
 
228 aa  85.5  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  29.11 
 
 
261 aa  85.1  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  36.53 
 
 
251 aa  84.7  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  29.63 
 
 
258 aa  85.1  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  29.06 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  30.65 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  34.16 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>