More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3742 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3742  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 
247 aa  498  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  41.41 
 
 
217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2458  F0F1 ATP synthase subunit A  39.62 
 
 
224 aa  135  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2168  F0F1 ATP synthase subunit A  38.43 
 
 
218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  34.63 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  34.21 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  37.2 
 
 
216 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  31.98 
 
 
251 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0197  ATP synthase F0, A subunit  35.59 
 
 
301 aa  113  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000520668  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  37.67 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  37.1 
 
 
234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  32.58 
 
 
262 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  32.24 
 
 
232 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  33.17 
 
 
231 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  36.61 
 
 
229 aa  99.4  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  32.5 
 
 
234 aa  98.6  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  34.87 
 
 
230 aa  96.7  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  33.82 
 
 
229 aa  96.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  30.6 
 
 
245 aa  96.3  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 
229 aa  95.9  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  35.41 
 
 
229 aa  95.5  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  34.08 
 
 
227 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl109  F0F1 ATP synthase subunit A  27.84 
 
 
284 aa  94.7  1e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  34.08 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  34.93 
 
 
229 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2145  F0F1 ATP synthase subunit A  29.71 
 
 
242 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.186735  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2183  F0F1 ATP synthase subunit A  29.71 
 
 
242 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.22629  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  33.85 
 
 
229 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  32.21 
 
 
218 aa  93.2  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  33.66 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  30.88 
 
 
241 aa  92.8  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  30.92 
 
 
232 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  32.57 
 
 
284 aa  92.8  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  31.8 
 
 
249 aa  92.8  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  34.46 
 
 
232 aa  92  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  31.46 
 
 
237 aa  92  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  31.75 
 
 
252 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  34.24 
 
 
234 aa  91.3  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  35.03 
 
 
271 aa  91.3  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3831  F0F1 ATP synthase subunit A  30.94 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000137067  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  30.88 
 
 
241 aa  90.5  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  30.81 
 
 
251 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  30.81 
 
 
251 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  32.46 
 
 
229 aa  90.1  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  32.69 
 
 
239 aa  90.1  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  35.52 
 
 
229 aa  89.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5433  F0F1 ATP synthase subunit A  32.56 
 
 
239 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  29.38 
 
 
261 aa  89  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5011  F0F1 ATP synthase subunit A  32.56 
 
 
239 aa  89  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110706  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  32.31 
 
 
257 aa  88.6  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5161  F0F1 ATP synthase subunit A  32.56 
 
 
239 aa  88.6  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4994  F0F1 ATP synthase subunit A  32.56 
 
 
239 aa  88.6  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000342727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5553  F0F1 ATP synthase subunit A  32.56 
 
 
239 aa  88.6  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000158416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5402  F0F1 ATP synthase subunit A  32.56 
 
 
239 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.39849e-58 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5436  F0F1 ATP synthase subunit A  32.56 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0528964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5489  F0F1 ATP synthase subunit A  32.56 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5518  F0F1 ATP synthase subunit A  32.56 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000410336  hitchhiker  3.2870800000000003e-19 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1715  F0F1 ATP synthase subunit A  31.02 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3868  F0F1 ATP synthase subunit A  38.19 
 
 
251 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal  0.0791726 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3309  F0F1 ATP synthase subunit A  32.09 
 
 
236 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000902841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3956  F0F1 ATP synthase subunit A  38.19 
 
 
251 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0660881 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  32.52 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3882  F0F1 ATP synthase subunit A  38.19 
 
 
251 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0659  F0F1-type ATP synthase, subunit a  30.94 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.320134  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  35.4 
 
 
253 aa  87  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5109  F0F1 ATP synthase subunit A  32.09 
 
 
239 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00506372  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  30.19 
 
 
241 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11331  F0F1 ATP synthase subunit A  30.84 
 
 
250 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4472  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 
258 aa  85.9  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0153  F0F1 ATP synthase subunit A  31.53 
 
 
275 aa  85.5  6e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.909475  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  32.37 
 
 
227 aa  85.9  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  27.67 
 
 
251 aa  85.5  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  33.71 
 
 
231 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  34.34 
 
 
220 aa  85.1  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  34.86 
 
 
228 aa  85.5  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  32.61 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  33.82 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  30.23 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1938  F0F1 ATP synthase subunit A  32.88 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00021369  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  35.06 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1915  ATP synthase F0, A subunit  31.63 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  28.91 
 
 
207 aa  84  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  28.5 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1875  F0F1-type ATP synthase, subunit a  30.97 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.257614  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  33.71 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1430  F0F1 ATP synthase subunit A  35.05 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00694031  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1249  ATP synthase F0, A subunit  29.75 
 
 
250 aa  82  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  35.27 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000656805  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4334  F0F1 ATP synthase subunit A  29.21 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442286  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2312  F0F1 ATP synthase subunit A  29.21 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  29.95 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  34.34 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  26 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  27.47 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  31.75 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0461  ATP synthase F0, A subunit  31.51 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000814456  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  30.95 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2616  F0F1 ATP synthase subunit A  30.19 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68842  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  30.95 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  29.72 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>