More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1244 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1244  F0F1-type ATP synthase, subunit a  100 
 
 
154 aa  307  4e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000114749  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0659  F0F1-type ATP synthase, subunit a  57.86 
 
 
241 aa  168  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.320134  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0461  ATP synthase F0, A subunit  53.59 
 
 
235 aa  164  4e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000814456  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1875  F0F1-type ATP synthase, subunit a  48.1 
 
 
241 aa  147  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.257614  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2145  F0F1 ATP synthase subunit A  47.74 
 
 
242 aa  144  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.186735  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2183  F0F1 ATP synthase subunit A  47.74 
 
 
242 aa  144  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.22629  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  44.81 
 
 
237 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3831  F0F1 ATP synthase subunit A  48.1 
 
 
239 aa  140  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000137067  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3309  F0F1 ATP synthase subunit A  47.4 
 
 
236 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000902841  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1938  F0F1 ATP synthase subunit A  48.72 
 
 
237 aa  130  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00021369  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1715  F0F1 ATP synthase subunit A  48.7 
 
 
242 aa  124  6e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5433  F0F1 ATP synthase subunit A  44.94 
 
 
239 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5518  F0F1 ATP synthase subunit A  44.94 
 
 
239 aa  123  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000410336  hitchhiker  3.2870800000000003e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5436  F0F1 ATP synthase subunit A  44.94 
 
 
239 aa  123  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0528964  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5161  F0F1 ATP synthase subunit A  46.3 
 
 
239 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4994  F0F1 ATP synthase subunit A  46.3 
 
 
239 aa  122  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000342727  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5011  F0F1 ATP synthase subunit A  46.3 
 
 
239 aa  122  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5489  F0F1 ATP synthase subunit A  44.94 
 
 
239 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5402  F0F1 ATP synthase subunit A  46.3 
 
 
239 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.39849e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5553  F0F1 ATP synthase subunit A  46.3 
 
 
239 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000158416  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  45.75 
 
 
235 aa  122  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5109  F0F1 ATP synthase subunit A  43.67 
 
 
239 aa  120  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00506372  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0858  F0F1 ATP synthase subunit A  40 
 
 
238 aa  107  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  37.69 
 
 
245 aa  84.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  35.06 
 
 
262 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  35.06 
 
 
246 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  34.11 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  37.12 
 
 
249 aa  75.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  40 
 
 
216 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  38.28 
 
 
295 aa  74.7  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0197  ATP synthase F0, A subunit  30.91 
 
 
301 aa  73.9  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000520668  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  35.07 
 
 
257 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  31.11 
 
 
231 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  34.35 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  37.69 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  31.3 
 
 
228 aa  71.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1915  ATP synthase F0, A subunit  34.35 
 
 
251 aa  71.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0127  F0F1 ATP synthase subunit A  32.58 
 
 
233 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1052  F0F1 ATP synthase subunit A  32.58 
 
 
233 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0151  F0F1 ATP synthase subunit A  32.58 
 
 
233 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.158772  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2648  F0F1 ATP synthase subunit A  32.58 
 
 
233 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2790  F0F1 ATP synthase subunit A  32.58 
 
 
233 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1294  F0F1 ATP synthase subunit A  32.58 
 
 
233 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.322594  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3742  ATP synthase F0, A subunit  39.37 
 
 
247 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0423  F0F1 ATP synthase subunit A  31.82 
 
 
233 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  31.11 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  30.53 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2616  F0F1 ATP synthase subunit A  34.21 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68842  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  38 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  31.82 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4334  F0F1 ATP synthase subunit A  32.06 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442286  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  28.12 
 
 
224 aa  68.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11331  F0F1 ATP synthase subunit A  32.09 
 
 
250 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1031  ATP synthase F0, A subunit  31.21 
 
 
307 aa  67.8  0.00000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0296  F0F1 ATP synthase subunit A  33.59 
 
 
280 aa  67.8  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  28.79 
 
 
232 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2312  F0F1 ATP synthase subunit A  30.77 
 
 
259 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  27.41 
 
 
227 aa  67.8  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2803  F0F1 ATP synthase subunit A  31.85 
 
 
280 aa  67.8  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00368483  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2763  ATP synthase F0, A subunit  32.57 
 
 
254 aa  67.4  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4108  F0F1 ATP synthase subunit A  35.51 
 
 
266 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  8.0507200000000005e-19  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  27.41 
 
 
227 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  35.66 
 
 
241 aa  67  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  35.66 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06110  F0F1 ATP synthase subunit A  32.61 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  37.04 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  37.78 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0751  F0F1 ATP synthase subunit A  32.8 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.146612  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  32.58 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  29.23 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  26.03 
 
 
271 aa  65.5  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3868  F0F1 ATP synthase subunit A  31.58 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal  0.0791726 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  33.06 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  36.8 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1299  ATP synthase F0, A subunit  27.67 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3882  F0F1 ATP synthase subunit A  31.58 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  31.54 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  36.8 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3956  F0F1 ATP synthase subunit A  31.58 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0660881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  29.63 
 
 
232 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4487  F0F1 ATP synthase subunit A  34.81 
 
 
406 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.553444  normal  0.0963007 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  30.4 
 
 
246 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  30.14 
 
 
229 aa  63.9  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2331  ATP synthase F0, A subunit  36.5 
 
 
273 aa  63.5  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000417448  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  33.07 
 
 
230 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3352  F0F1 ATP synthase subunit A  30.57 
 
 
288 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2171  F0F1 ATP synthase subunit A  34.31 
 
 
270 aa  62.8  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000816174  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1175  F0F1 ATP synthase subunit A  29.69 
 
 
280 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.108763  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0147  F0F1 ATP synthase subunit A  34.09 
 
 
273 aa  63.5  0.000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0584066  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1279  F0F1 ATP synthase subunit A  29.69 
 
 
280 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0786025  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  31.54 
 
 
227 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4220  F0F1 ATP synthase subunit A  31.16 
 
 
274 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000114872  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3500  F0F1 ATP synthase subunit A  29.75 
 
 
289 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000120321  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4208  F0F1 ATP synthase subunit A  31.16 
 
 
252 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000900849  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4182  F0F1 ATP synthase subunit A  31.16 
 
 
274 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000085941  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  32.31 
 
 
241 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4251  F0F1 ATP synthase subunit A  31.16 
 
 
266 aa  62  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000620558  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  33.08 
 
 
241 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  32.31 
 
 
241 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>