More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1229 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1229  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 		 380 aa  766    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.896245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  44.07 
 
 		 364 aa  291  9e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  45.8 
 
 		 373 aa  286  5e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0179  ATP synthase, subunit A (H(+)-transporting two-sector ATPase)  48.45 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.412196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  45.76 
 
 		 373 aa  281  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  41.98 
 
 		 355 aa  260  3e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0061  ATP synthase F0 subunit A  44.17 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03040  putative ATP synthase A chain  41.11 
 
 		 361 aa  233  3e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1055  ATP synthase F0, A subunit  40.06 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  40.21 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  41.61 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  42.4 
 
 		 342 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  43.37 
 
 		 340 aa  172  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677372  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  41.63 
 
 		 341 aa  158  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2502  F0F1 ATP synthase subunit A  41.8 
 
 		 338 aa  146  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2247  F0F1 ATP synthase subunit A  42.11 
 
 		 324 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.608191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4495  F0F1 ATP synthase subunit A  37.5 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4476  F0F1 ATP synthase subunit A  41.63 
 
 		 384 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4340  F0F1 ATP synthase subunit A  40.72 
 
 		 381 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.35318  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  34.53 
 
 		 251 aa  123  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  36.44 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  36.44 
 
 		 251 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  36.44 
 
 		 251 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  35.41 
 
 		 251 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  37.56 
 
 		 251 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  35.98 
 
 		 268 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1515  ATP synthase F0, A subunit  37.14 
 
 		 248 aa  113  5e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  32.79 
 
 		 285 aa  113  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4487  F0F1 ATP synthase subunit A  34.39 
 
 		 406 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.553444  normal  0.0963007 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  30.98 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  33.03 
 
 		 253 aa  106  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  34.39 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  32.43 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 251 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  34.82 
 
 		 258 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  33.47 
 
 		 249 aa  103  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  33.47 
 
 		 249 aa  103  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  31.44 
 
 		 260 aa  102  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  32.17 
 
 		 248 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  28.81 
 
 		 247 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  35.75 
 
 		 234 aa  101  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  33.48 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  31.6 
 
 		 261 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  31.6 
 
 		 261 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  31.6 
 
 		 247 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  32.22 
 
 		 249 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  31.88 
 
 		 249 aa  99.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  35.12 
 
 		 250 aa  99.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  34.15 
 
 		 230 aa  99  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  27.12 
 
 		 247 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  30.88 
 
 		 263 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0330  ATP synthase F0, A subunit  30.77 
 
 		 280 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  32.69 
 
 		 250 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  29.9 
 
 		 247 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  31.51 
 
 		 234 aa  98.2  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  36.27 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  34.07 
 
 		 249 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  34.63 
 
 		 229 aa  98.6  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  34.63 
 
 		 229 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  32.3 
 
 		 283 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  30.91 
 
 		 241 aa  97.8  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  36.84 
 
 		 261 aa  97.4  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  31.37 
 
 		 248 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  30.29 
 
 		 252 aa  96.7  6e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  35.44 
 
 		 248 aa  96.7  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0170  ATP synthase F0, A subunit  36.21 
 
 		 339 aa  95.9  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.222204  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  31.7 
 
 		 250 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  33.47 
 
 		 282 aa  95.9  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  31.37 
 
 		 250 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  34.63 
 
 		 229 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  32.34 
 
 		 241 aa  95.5  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  33.66 
 
 		 243 aa  94.7  2e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  29.66 
 
 		 263 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  32.59 
 
 		 229 aa  94  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  32.59 
 
 		 229 aa  94  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  32.94 
 
 		 265 aa  93.6  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  30.77 
 
 		 295 aa  93.2  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  31.58 
 
 		 250 aa  92.8  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  32.48 
 
 		 270 aa  92.4  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  30.52 
 
 		 266 aa  92  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  34.12 
 
 		 250 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  30.74 
 
 		 258 aa  92.4  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  31.88 
 
 		 241 aa  92  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  29.58 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  30.8 
 
 		 229 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2879  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 248 aa  92  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.775771  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  30.8 
 
 		 229 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  31.44 
 
 		 241 aa  91.3  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  31.88 
 
 		 249 aa  90.5  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  30.04 
 
 		 312 aa  90.1  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  29.53 
 
 		 275 aa  90.1  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  29.96 
 
 		 251 aa  89.7  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  32.86 
 
 		 267 aa  89.7  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  34.47 
 
 		 239 aa  89.7  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  30.96 
 
 		 265 aa  89.7  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  34.98 
 
 		 260 aa  89.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  29.62 
 
 		 259 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  32.04 
 
 		 267 aa  87  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  31.73 
 
 		 250 aa  86.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  31.88 
 
 		 234 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>