252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0029 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0029  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
358 aa  734    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.021133 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  31.88 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
356 aa  67  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0193  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
364 aa  65.1  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 
414 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 
407 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3442  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
337 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 
353 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  32.14 
 
 
405 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
379 aa  57.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0648  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  24.73 
 
 
431 aa  57.8  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.205035  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
409 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1207  glycosyl transferase, group 1  24.39 
 
 
323 aa  57  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  0.0214801 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  22.96 
 
 
350 aa  57.4  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 
348 aa  56.6  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
405 aa  56.2  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
388 aa  56.2  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 
390 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  22.34 
 
 
341 aa  56.2  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  23.01 
 
 
372 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  22.66 
 
 
366 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  25 
 
 
369 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5027  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
856 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2684  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 
328 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.94042 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  26.72 
 
 
362 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.66 
 
 
366 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  27.12 
 
 
340 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2878  glycosyl transferase, group 1  25.11 
 
 
380 aa  54.3  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305782 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  22.66 
 
 
366 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
739 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  27.64 
 
 
371 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
381 aa  53.9  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
436 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  22.66 
 
 
366 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  22.55 
 
 
369 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.37 
 
 
407 aa  53.5  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 
375 aa  53.9  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 
376 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 
406 aa  53.5  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.39 
 
 
373 aa  53.5  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
364 aa  53.5  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
353 aa  53.1  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1851  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.65 
 
 
400 aa  53.1  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 
386 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.66 
 
 
366 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
346 aa  53.1  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 
401 aa  52.8  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
399 aa  52.8  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 
750 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
361 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.17 
 
 
360 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0264  phosphatidylserine decarboxylase  27.65 
 
 
341 aa  52  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
426 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0621  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
342 aa  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.152612  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  22.07 
 
 
391 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
372 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
396 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
385 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
415 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  22.58 
 
 
366 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 
348 aa  50.8  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5545  glycosyltransferase  22.18 
 
 
371 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0040518  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
374 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5045  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 
415 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.74 
 
 
366 aa  50.8  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  21.46 
 
 
343 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  22.96 
 
 
387 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 
369 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05020  glycosyltransferase  26 
 
 
387 aa  50.4  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.55 
 
 
369 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3184  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 
400 aa  50.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.845721  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0236  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
379 aa  50.4  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4810  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 
363 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
395 aa  50.4  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.73 
 
 
385 aa  50.1  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
396 aa  50.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.18 
 
 
369 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13941  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
363 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.164245  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0432  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.04 
 
 
459 aa  50.1  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568874  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
389 aa  50.1  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  33.08 
 
 
388 aa  50.1  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  23.55 
 
 
379 aa  50.1  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0375  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.04 
 
 
462 aa  50.1  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
389 aa  49.7  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
382 aa  49.7  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0690  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 
385 aa  49.7  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.945195  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1068  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 
658 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114697  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
350 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  27.87 
 
 
426 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 
355 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 
419 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003535  glycosyltransferase  20.63 
 
 
394 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  23.94 
 
 
350 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 
368 aa  49.3  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  25.71 
 
 
347 aa  49.3  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  31.07 
 
 
372 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 
393 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
380 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4987  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
363 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>