94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1631 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1631  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  100 
 
 		 289 aa  599  1e-170  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00785835  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3545  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  49.64 
 
 		 280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.164224  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1606  putative adenine-specific DNA methyltransferase  47.31 
 
 		 284 aa  272  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.299391  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1480  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  48.91 
 
 		 293 aa  269  4e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2017  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  40.21 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3299  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  37.59 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0878  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  37.82 
 
 		 296 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0291145  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0050  prophage Lp2 protein 3  36.92 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.287398  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0632  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  39.47 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7315  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.34 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000824248  hitchhiker  0.000000113371 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2016  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.03 
 
 		 306 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.469174 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1989  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.45 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0061  DNA-methyltransferase  29.75 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403537  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2028  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.45 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2134  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.92 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0629434  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.62 
 
 		 287 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.895873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4407  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.12 
 
 		 283 aa  95.5  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.167881 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1749  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.34 
 
 		 280 aa  85.9  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0183349  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0465  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.95 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821976  normal  0.340502 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0503  site-specific DNA methylase-like protein  25.63 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0874  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.4 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2437  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.74 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0384  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.558909  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4215  DNA adenine methylase  22.4 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4254  DNA adenine methylase  22.4 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556419 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4275  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.9 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.020773  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0181  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.05 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3706  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.66 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1098  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  22.45 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000180295 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3649  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.9 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3004  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.74 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1279  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.39 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.230898  hitchhiker  0.0056893 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1790  DNA adenine methylase  23.24 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.557139  normal  0.0298379 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0139  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.39 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1697  hypothetical protein  25.09 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1923  DNA adenine methylase  24.73 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595545  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1068  DNA adenine methylase  24.73 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.859034  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1401  DNA adenine methylase  23.35 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.990942  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0297  adenine-specific DNA methylase, putative  29.06 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00524367  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1568  methyltransferase, putative  27 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3396  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.75 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5555  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.29 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000602778 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.41 
 
 		 673 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3360  adenine specific DNA methyltransferase, D12 class  22.96 
 
 		 262 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1477  DNA adenine methylase  21.83 
 
 		 283 aa  53.1  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0051  putative modification methylase dpniia  21.01 
 
 		 259 aa  53.1  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481115  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3376  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  22.39 
 
 		 268 aa  52.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.684699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3349  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.32 
 
 		 284 aa  52.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.41 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0103783  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3058  retron adenine methylase  25.18 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.99248 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0917  retron adenine methylase  25.44 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000765231  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3388  DNA adenine methylase, putative  22.99 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3635  putative adenine-specific DNA methyltransferase  22.39 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0650243  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3728  DNA adenine methylase  22.48 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0182  adenine-specific DNA methylase, putative  28.21 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1627  putative N-6 adenine-specific DNA methylase  29.27 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  21.74 
 
 		 307 aa  50.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1850  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.81 
 
 		 262 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000906575  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1475  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.9 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1638  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.31 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.355798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1513  DNA adenine methylase  22.75 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971855  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  24.62 
 
 		 280 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3140  DNA adenine methylase  21.71 
 
 		 638 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0220  DNA adenine methylase  23.24 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0233  DNA adenine methylase  22.05 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.793505 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3839  DNA adenine methylase  21.53 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.236937  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0743  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.11 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0512045  hitchhiker  0.00111999 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3769  adenine-specific DNA methyltransferase  26.83 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307242  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0884  DNA adenine methylase  22.22 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1221  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  20.38 
 
 		 265 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0898175  hitchhiker  0.0000277159 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0179  DNA adenine methylase  22.56 
 
 		 278 aa  47  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000431718  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2052  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  21.62 
 
 		 268 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0637864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4539  DNA adenine methylase  21.29 
 
 		 264 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0828  DNA adenine methylase  27.23 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.90544  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2682  DNA adenine methylase  22.35 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0690  type II DNA modification methyltransferase, putative  20.08 
 
 		 253 aa  45.8  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0888  DNA adenine methylase  22.71 
 
 		 290 aa  45.8  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2979  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  20.45 
 
 		 254 aa  45.8  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0836  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.72 
 
 		 348 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2112  DNA adenine methylase  21.72 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000292224  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2898  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.68 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160115 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1499  DNA adenine methylase  20.87 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.142483 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2787  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.11 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113292  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.68 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  hitchhiker  0.00000213835 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1093  DNA adenine methylase  22.32 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  hitchhiker  0.000226621 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2158  DNA adenine methylase  21.35 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000173496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  22.73 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0517  DNA adenine methylase  22.97 
 
 		 332 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13128  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2199  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.79 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608262 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0151  DNA adenine methylase  22.57 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.851887  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0463  putative N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  23.02 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3758  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.78 
 
 		 275 aa  42.7  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98981  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0677  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.01 
 
 		 271 aa  42.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1464  DNA adenine methylase  20.59 
 
 		 266 aa  42.4  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000122278  normal  0.830812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>