42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1098 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1098  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  100 
 
 
332 aa  693    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000180295 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0874  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  63.9 
 
 
313 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0503  site-specific DNA methylase-like protein  47.44 
 
 
297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1915  hypothetical protein  56.34 
 
 
258 aa  92  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0050  prophage Lp2 protein 3  26 
 
 
290 aa  86.3  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.287398  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1480  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.46 
 
 
293 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0878  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.36 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0291145  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2017  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.42 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0061  DNA-methyltransferase  29.11 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403537  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7315  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.21 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000824248  hitchhiker  0.000000113371 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1606  putative adenine-specific DNA methyltransferase  26.07 
 
 
284 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.299391  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3299  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2747  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.8 
 
 
303 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.356078 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1631  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  22.45 
 
 
289 aa  62.4  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00785835  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3545  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.48 
 
 
280 aa  62  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.164224  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.42 
 
 
287 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.895873 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4254  DNA adenine methylase  25.73 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000556419 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4215  DNA adenine methylase  25.73 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2016  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.23 
 
 
306 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.469174 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3706  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.69 
 
 
248 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1749  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  22.5 
 
 
280 aa  56.2  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0183349  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2134  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.29 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0629434  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1989  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.82 
 
 
306 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2028  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.18 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1110  retron adenine methylase  24.65 
 
 
289 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.588496 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1477  DNA adenine methylase  27.11 
 
 
283 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0632  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.81 
 
 
281 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2282  retron adenine methylase  24.45 
 
 
293 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.619879  hitchhiker  2.98029e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2376  DNA adenine methyltransferase  26.83 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00648987  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0308  DNA adenine methylase  24.67 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0432416  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5555  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.39 
 
 
304 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000602778 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1499  DNA adenine methylase  22.89 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.142483 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0465  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.83 
 
 
284 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821976  normal  0.340502 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1513  DNA adenine methylase  24.09 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971855  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3365  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  23.12 
 
 
280 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2656  DNA adenine methylase  24.78 
 
 
283 aa  44.3  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119155  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3313  DNA adenine methylase  24.1 
 
 
271 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.35 
 
 
273 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0103783  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1945  DNA adenine methylase  22.75 
 
 
324 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4407  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.58 
 
 
283 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.167881 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2437  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.64 
 
 
279 aa  43.1  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1790  DNA adenine methylase  22.18 
 
 
263 aa  42.4  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.557139  normal  0.0298379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>