36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0874 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0874  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  100 
 
 
313 aa  653    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1098  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  63.9 
 
 
332 aa  429  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000180295 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0503  site-specific DNA methylase-like protein  49.66 
 
 
297 aa  316  3e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1915  hypothetical protein  61.97 
 
 
258 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1480  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.45 
 
 
293 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0050  prophage Lp2 protein 3  26.29 
 
 
290 aa  86.3  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.287398  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0061  DNA-methyltransferase  27.74 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403537  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1606  putative adenine-specific DNA methyltransferase  27.82 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.299391  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2017  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.49 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1631  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.4 
 
 
289 aa  77  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00785835  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0878  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.28 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0291145  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3299  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.81 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3706  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.32 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4254  DNA adenine methylase  28.81 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000556419 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4215  DNA adenine methylase  28.81 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7315  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.67 
 
 
314 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000824248  hitchhiker  0.000000113371 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3545  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.29 
 
 
280 aa  63.9  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.164224  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0465  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.72 
 
 
284 aa  60.5  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821976  normal  0.340502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2028  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.77 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1749  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.46 
 
 
280 aa  55.8  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0183349  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2016  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.17 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.469174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3758  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.4 
 
 
275 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98981  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2134  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.27 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0629434  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1989  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.48 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2376  DNA adenine methyltransferase  24.68 
 
 
285 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00648987  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.17 
 
 
287 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.895873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4452  DNA adenine methyltransferase  23.87 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0632  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.8 
 
 
281 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4407  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.98 
 
 
283 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.167881 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0647  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  21.21 
 
 
704 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0051  putative modification methylase dpniia  22.63 
 
 
259 aa  46.6  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481115  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5555  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.22 
 
 
304 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000602778 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1477  DNA adenine methylase  25.76 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1513  DNA adenine methylase  22.45 
 
 
313 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971855  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3313  DNA adenine methylase  25.62 
 
 
271 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2282  retron adenine methylase  25 
 
 
293 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.619879  hitchhiker  2.98029e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>