144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2376 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2376  DNA adenine methyltransferase  100 
 
 		 285 aa  584  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00648987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4452  DNA adenine methyltransferase  85.09 
 
 		 296 aa  494  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3758  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  59.48 
 
 		 275 aa  314  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98981  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0261  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  60.38 
 
 		 264 aa  305  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5102  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  56.29 
 
 		 301 aa  295  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4115  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  57.09 
 
 		 530 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5496  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  52.31 
 
 		 286 aa  287  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4704  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  52.57 
 
 		 286 aa  272  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0118751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2646  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  51.36 
 
 		 297 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2747  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  47.46 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.356078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2199  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  49.11 
 
 		 288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608262 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3755  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  44.01 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2173  DNA adenine methyltransferase  48.29 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.134955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1897  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  46.1 
 
 		 294 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1163  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  40.15 
 
 		 277 aa  180  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0677  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  40.33 
 
 		 271 aa  165  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  37.12 
 
 		 673 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0743  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  38.89 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0512045  hitchhiker  0.00111999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  39.93 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0103783  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5555  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.53 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000602778 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3349  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.07 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0139  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.07 
 
 		 296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1279  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.07 
 
 		 296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.230898  hitchhiker  0.0056893 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1568  methyltransferase, putative  32.38 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3649  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.46 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0465  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.96 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821976  normal  0.340502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3396  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.28 
 
 		 263 aa  99.4  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1401  DNA adenine methylase  30.54 
 
 		 253 aa  97.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.990942  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0690  type II DNA modification methyltransferase, putative  30.08 
 
 		 253 aa  96.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3388  DNA adenine methylase, putative  29.96 
 
 		 264 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2112  DNA adenine methylase  30.8 
 
 		 253 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000292224  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2158  DNA adenine methylase  30.8 
 
 		 253 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000173496  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0220  DNA adenine methylase  29.96 
 
 		 271 aa  95.5  9e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0177  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.76 
 
 		 263 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.044334 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3635  putative adenine-specific DNA methyltransferase  31.52 
 
 		 268 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0650243  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0834  DNA adenine methylase  31.02 
 
 		 251 aa  94  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000010943  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0181  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.63 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3376  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.16 
 
 		 268 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.684699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1638  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.2 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.355798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0463  putative N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  27.88 
 
 		 263 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1627  putative N-6 adenine-specific DNA methylase  30.43 
 
 		 268 aa  89.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2898  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.52 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.52 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  hitchhiker  0.00000213835 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1923  DNA adenine methylase  27.39 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595545  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1221  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.69 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0898175  hitchhiker  0.0000277159 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2052  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  30.43 
 
 		 268 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0637864  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3769  adenine-specific DNA methyltransferase  30.43 
 
 		 268 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307242  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1068  DNA adenine methylase  27.39 
 
 		 262 aa  86.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.859034  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1697  hypothetical protein  27.39 
 
 		 262 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1850  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.32 
 
 		 262 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000906575  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0051  putative modification methylase dpniia  28.07 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481115  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2682  DNA adenine methylase  33.52 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3728  DNA adenine methylase  28.19 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3004  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.57 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2979  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.2 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1475  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.92 
 
 		 310 aa  79  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3360  adenine specific DNA methyltransferase, D12 class  33.16 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4275  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.94 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.020773  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2787  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.22 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113292  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4215  DNA adenine methylase  26.05 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4254  DNA adenine methylase  26.05 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556419 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1835  DNA adenine methylase  27 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0660  prophage PSPPH06, putative adenine modification methytransferase  32.65 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2656  DNA adenine methylase  26.09 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0836  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.55 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0647  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.61 
 
 		 704 aa  63.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4258  phage DNA methylase  37.17 
 
 		 224 aa  62  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0105966 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6518  phage DNA methylase  36.94 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0216  DNA adenine methylase  25.89 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213822 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  27.73 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3085  Site-specific DNA methylase protein  34.44 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0343  DNA adenine methylase  27.34 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1737  DNA adenine methylase  24.9 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00929025  normal  0.808648 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3800  DNA adenine methylase  27.08 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2087  DNA adenine methylase  24.71 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.674044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  27.45 
 
 		 280 aa  53.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3663  DNA adenine methylase  25.43 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.208265  normal  0.0250573 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03239  DNA adenine methylase  25.43 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0326  DNA adenine methylase  25.43 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03191  hypothetical protein  25.43 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277924  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3583  DNA adenine methylase  25.43 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0033886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3857  DNA adenine methylase  25.43 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00206502  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0326  DNA adenine methylase  25.43 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.168189  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3764  DNA adenine methylase  25.43 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0637881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4691  DNA adenine methylase  25.43 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.368907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0264  DNA adenine methylase  24.6 
 
 		 279 aa  52.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0659762  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0874  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.68 
 
 		 313 aa  52.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002330  methyl-directed repair DNA adenine methylase  24.87 
 
 		 279 aa  52.4  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.455912  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0344  DNA adenine methylase  25.54 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3365  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.79 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00025  DNA adenine methylase  24.81 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4262  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.8 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349455 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0241  DNA adenine methylase  24.51 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.808773  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  22.58 
 
 		 275 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4000  DNA adenine methylase  24.1 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4110  DNA adenine methylase  24.1 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.395819  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3703  DNA adenine methylase  24.1 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4081  DNA adenine methylase  24.1 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4199  DNA adenine methylase  24.1 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.246501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0378  DNA adenine methylase  25.5 
 
 		 278 aa  50.4  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>