155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3313 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3313  DNA adenine methylase  100 
 
 		 271 aa  567  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1368  DNA adenine methylase  53.79 
 
 		 270 aa  310  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544834  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0821  DNA adenine methylase  51.42 
 
 		 251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  38.26 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  39.71 
 
 		 277 aa  195  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  38.32 
 
 		 280 aa  191  9e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  39.48 
 
 		 275 aa  189  5e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3347  DNA adenine methylase  36.03 
 
 		 303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.758382 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3991  DNA adenine methylase  36.9 
 
 		 280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.075904  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3363  DNA adenine methylase  35.13 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.757208  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2739  DNA adenine methylase  35.13 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  38.52 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1737  DNA adenine methylase  38.58 
 
 		 270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00929025  normal  0.808648 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0828  DNA adenine methylase  36.26 
 
 		 277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.90544  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0233  DNA adenine methylase  37.11 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.793505 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1003  DNA adenine methylase  39.68 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0410349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0884  DNA adenine methylase  37.1 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3140  DNA adenine methylase  35.69 
 
 		 638 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1281  DNA adenine methylase  38.79 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329872  normal  0.126066 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0179  DNA adenine methylase  35.64 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000431718  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0308  DNA adenine methylase  35.42 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0432416  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1499  DNA adenine methylase  33.69 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.142483 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1093  DNA adenine methylase  35.74 
 
 		 286 aa  158  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  hitchhiker  0.000226621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1945  DNA adenine methylase  34.68 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04430  DNA adenine methylase  34.03 
 
 		 306 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2087  DNA adenine methylase  34.91 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.674044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0703  DNA adenine methylase  33.12 
 
 		 325 aa  152  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0202559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3321  DNA adenine methylase  33.94 
 
 		 289 aa  149  7e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  38.22 
 
 		 307 aa  145  8.000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0458  DNA adenine methylase  35.2 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0922232  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1790  DNA adenine methylase  36.36 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.557139  normal  0.0298379 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1822  DNA adenine methylase  33.58 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1835  DNA adenine methylase  32.12 
 
 		 302 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1513  DNA adenine methylase  35.2 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971855  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3365  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  34.34 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3905  DNA adenine methylase  34.62 
 
 		 235 aa  139  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1477  DNA adenine methylase  33.6 
 
 		 283 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0517  DNA adenine methylase  31.23 
 
 		 332 aa  137  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13128  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00025  DNA adenine methylase  34.21 
 
 		 279 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1464  DNA adenine methylase  37.3 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000122278  normal  0.830812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3351  DNA adenine methylase  34.8 
 
 		 274 aa  135  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4110  DNA adenine methylase  33.08 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.395819  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4081  DNA adenine methylase  33.08 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4199  DNA adenine methylase  33.08 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.246501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4000  DNA adenine methylase  33.08 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0241  DNA adenine methylase  35.09 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.808773  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002330  methyl-directed repair DNA adenine methylase  33.08 
 
 		 279 aa  132  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.455912  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1756  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  31.77 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.663014  normal  0.0339487 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3703  DNA adenine methylase  32.83 
 
 		 279 aa  131  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0847  DNA adenine methylase  31.8 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4262  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  33.96 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349455 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0151  DNA adenine methylase  32.45 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.851887  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0475  DNA adenine methylase  31.82 
 
 		 273 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1588  DNA adenine methylase  32 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0216  DNA adenine methylase  32.83 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213822 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1115  DNA adenine methylase Dam  34.2 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.664514  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0343  DNA adenine methylase  33.21 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0264  DNA adenine methylase  32.2 
 
 		 279 aa  129  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0659762  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2203  DNA adenine methylase  32.2 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.446235  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2725  DNA adenine methylase  34.09 
 
 		 276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1929  DNA adenine methylase  31.58 
 
 		 306 aa  126  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0539  DNA adenine methylase  29.3 
 
 		 272 aa  125  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1110  retron adenine methylase  31.23 
 
 		 289 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.588496 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3695  DNA adenine methylase  31.7 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0263  DNA adenine methylase  31.37 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.262484  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0250  DNA adenine methylase  32.08 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3891  DNA adenine methylase  31.7 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.728671 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0378  DNA adenine methylase  31.32 
 
 		 278 aa  123  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0663  DNA adenine methylase  31.18 
 
 		 277 aa  122  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2656  DNA adenine methylase  32.97 
 
 		 283 aa  122  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119155  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0289  DNA adenine methylase  31.32 
 
 		 279 aa  122  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2282  retron adenine methylase  30.11 
 
 		 293 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.619879  hitchhiker  2.98029e-22 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1136  DNA adenine methylase  29.85 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0690  DNA adenine methylase  32.3 
 
 		 272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0708  DNA adenine methylase  31.78 
 
 		 272 aa  119  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3880  DNA adenine methylase  34.75 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33854  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4602  DNA adenine methylase  31.84 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0997785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3800  DNA adenine methylase  30.71 
 
 		 288 aa  115  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4057  DNA adenine methylase  33.9 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000515222  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1090  DNA adenine methylase  30.97 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0344  DNA adenine methylase  29.5 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3963  DNA adenine methylase  32.2 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3724  DNA adenine methylase  32.2 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00179541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0228  DNA adenine methylase  32.2 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0459983  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03239  DNA adenine methylase  29.81 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0326  DNA adenine methylase  29.81 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3681  DNA adenine methylase  29.81 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03191  hypothetical protein  29.81 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277924  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3852  DNA adenine methylase  29.81 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4691  DNA adenine methylase  29.81 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.368907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3583  DNA adenine methylase  29.81 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0033886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3857  DNA adenine methylase  29.81 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00206502  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3683  DNA adenine methylase  29.81 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00514879  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0326  DNA adenine methylase  29.81 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.168189  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3663  DNA adenine methylase  29.81 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.208265  normal  0.0250573 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3764  DNA adenine methylase  29.81 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0637881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3756  DNA adenine methylase  29.81 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3790  DNA adenine methylase  29.81 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0828962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2942  retron adenine methylase  32.85 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0304018  hitchhiker  1.0655700000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0166  DNA adenine methylase  32.42 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>