182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1513 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1513  DNA adenine methylase  100 
 
 		 313 aa  644    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971855  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0458  DNA adenine methylase  55.73 
 
 		 317 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0922232  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1945  DNA adenine methylase  53.18 
 
 		 324 aa  317  1e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0703  DNA adenine methylase  51.51 
 
 		 325 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0202559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0517  DNA adenine methylase  50.17 
 
 		 332 aa  311  7.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13128  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0308  DNA adenine methylase  54.76 
 
 		 310 aa  310  2e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0432416  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1003  DNA adenine methylase  51.51 
 
 		 309 aa  309  4e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0410349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0847  DNA adenine methylase  48.33 
 
 		 306 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0151  DNA adenine methylase  48 
 
 		 306 aa  275  6e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.851887  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1756  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  47 
 
 		 306 aa  275  9e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.663014  normal  0.0339487 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  45.36 
 
 		 307 aa  266  5e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  41.08 
 
 		 279 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04430  DNA adenine methylase  43.31 
 
 		 306 aa  230  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  41.78 
 
 		 275 aa  229  6e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3991  DNA adenine methylase  45.97 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.075904  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1499  DNA adenine methylase  41.67 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.142483 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  41.69 
 
 		 280 aa  218  8.999999999999998e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1737  DNA adenine methylase  43.69 
 
 		 270 aa  216  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00929025  normal  0.808648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3347  DNA adenine methylase  39.46 
 
 		 303 aa  216  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.758382 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0233  DNA adenine methylase  39.56 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.793505 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0179  DNA adenine methylase  41.36 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000431718  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0884  DNA adenine methylase  40.58 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  38.89 
 
 		 277 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0828  DNA adenine methylase  42.37 
 
 		 277 aa  205  9e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.90544  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2087  DNA adenine methylase  38.18 
 
 		 292 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.674044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1588  DNA adenine methylase  38.85 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  39.8 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3363  DNA adenine methylase  39.26 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.757208  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2739  DNA adenine methylase  39.26 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3140  DNA adenine methylase  37.81 
 
 		 638 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3321  DNA adenine methylase  34.68 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3905  DNA adenine methylase  40.08 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1281  DNA adenine methylase  36.45 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329872  normal  0.126066 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4199  DNA adenine methylase  35.88 
 
 		 279 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.246501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4000  DNA adenine methylase  35.55 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4110  DNA adenine methylase  35.55 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.395819  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0289  DNA adenine methylase  35.57 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0250  DNA adenine methylase  35.55 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3365  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  34.8 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0263  DNA adenine methylase  34.36 
 
 		 275 aa  153  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.262484  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2656  DNA adenine methylase  33.79 
 
 		 283 aa  153  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119155  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1929  DNA adenine methylase  34.85 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3703  DNA adenine methylase  34.22 
 
 		 279 aa  153  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3695  DNA adenine methylase  34.88 
 
 		 279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3891  DNA adenine methylase  35.22 
 
 		 279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.728671 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4081  DNA adenine methylase  35.33 
 
 		 279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2203  DNA adenine methylase  33.68 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.446235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3663  DNA adenine methylase  34.02 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.208265  normal  0.0250573 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4057  DNA adenine methylase  33.79 
 
 		 270 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000515222  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1110  retron adenine methylase  31.74 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.588496 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3852  DNA adenine methylase  33.33 
 
 		 278 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3681  DNA adenine methylase  33.33 
 
 		 278 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3790  DNA adenine methylase  33.33 
 
 		 278 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0828962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3683  DNA adenine methylase  33.33 
 
 		 278 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00514879  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3756  DNA adenine methylase  33.33 
 
 		 278 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03239  DNA adenine methylase  33.68 
 
 		 278 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0326  DNA adenine methylase  33.68 
 
 		 278 aa  145  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4691  DNA adenine methylase  33.68 
 
 		 278 aa  145  9e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.368907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0326  DNA adenine methylase  33.68 
 
 		 278 aa  145  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.168189  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3764  DNA adenine methylase  33.68 
 
 		 278 aa  145  9e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0637881  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3583  DNA adenine methylase  33.68 
 
 		 278 aa  145  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0033886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3857  DNA adenine methylase  33.68 
 
 		 278 aa  145  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00206502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03191  hypothetical protein  33.68 
 
 		 278 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277924  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2282  retron adenine methylase  31.6 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.619879  hitchhiker  2.98029e-22 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1368  DNA adenine methylase  31.76 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544834  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3313  DNA adenine methylase  35.2 
 
 		 271 aa  142  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1115  DNA adenine methylase Dam  33.45 
 
 		 277 aa  142  8e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.664514  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0475  DNA adenine methylase  32.19 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3880  DNA adenine methylase  32.76 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33854  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0241  DNA adenine methylase  33.33 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.808773  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0264  DNA adenine methylase  34.35 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0659762  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00025  DNA adenine methylase  34.93 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0888  DNA adenine methylase  29.86 
 
 		 290 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0216  DNA adenine methylase  32.65 
 
 		 279 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213822 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3800  DNA adenine methylase  32.46 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0166  DNA adenine methylase  33.68 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4602  DNA adenine methylase  31.62 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0997785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002330  methyl-directed repair DNA adenine methylase  34.59 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.455912  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2320  DNA adenine methylase  32.29 
 
 		 272 aa  136  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.3975  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0821  DNA adenine methylase  34.59 
 
 		 251 aa  136  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2725  DNA adenine methylase  32.09 
 
 		 276 aa  135  8e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2636  DNA adenine methylase  32.99 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0410463  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0343  DNA adenine methylase  31.96 
 
 		 279 aa  132  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0228  DNA adenine methylase  31.27 
 
 		 271 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0459983  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3963  DNA adenine methylase  31.27 
 
 		 271 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3724  DNA adenine methylase  31.27 
 
 		 271 aa  133  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00179541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2876  retron adenine methylase  31.6 
 
 		 285 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.672134  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0341  DNA adenine methylase  32.42 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0378  DNA adenine methylase  30.93 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3058  retron adenine methylase  29.76 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.99248 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4262  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  31.62 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349455 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2786  DNA adenine methylase  29.51 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0697189  normal  0.0136814 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0917  retron adenine methylase  29.41 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000765231  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3839  DNA adenine methylase  29.67 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.236937  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0344  DNA adenine methylase  29.67 
 
 		 277 aa  125  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3351  DNA adenine methylase  29.53 
 
 		 274 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0539  DNA adenine methylase  30.14 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1090  DNA adenine methylase  33.88 
 
 		 264 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0663  DNA adenine methylase  31.16 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00507  DNA adenine methylase  29.55 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>