191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3321 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3321  DNA adenine methylase  100 
 
 
289 aa  594  1e-169  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1929  DNA adenine methylase  54.69 
 
 
306 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168288  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2739  DNA adenine methylase  44.4 
 
 
279 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3363  DNA adenine methylase  44.4 
 
 
279 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.757208  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3991  DNA adenine methylase  44.77 
 
 
280 aa  249  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.075904  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0828  DNA adenine methylase  43.57 
 
 
277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.90544  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  43.73 
 
 
280 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0179  DNA adenine methylase  41.49 
 
 
278 aa  229  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000431718  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  42.24 
 
 
279 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3347  DNA adenine methylase  44.53 
 
 
303 aa  222  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.758382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  41.45 
 
 
277 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1737  DNA adenine methylase  45.99 
 
 
270 aa  219  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00929025  normal  0.808648 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  42.55 
 
 
275 aa  217  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1499  DNA adenine methylase  40.85 
 
 
280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.142483 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  41.82 
 
 
279 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0884  DNA adenine methylase  42.55 
 
 
294 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0233  DNA adenine methylase  41.4 
 
 
293 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.793505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04430  DNA adenine methylase  38.14 
 
 
306 aa  203  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1588  DNA adenine methylase  40.14 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2087  DNA adenine methylase  39.36 
 
 
292 aa  192  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.674044  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1945  DNA adenine methylase  38.82 
 
 
324 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0703  DNA adenine methylase  38.82 
 
 
325 aa  190  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0202559  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1003  DNA adenine methylase  39.07 
 
 
309 aa  187  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0410349  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3140  DNA adenine methylase  40 
 
 
638 aa  186  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  36.75 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0308  DNA adenine methylase  36.58 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0432416  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0517  DNA adenine methylase  36.21 
 
 
332 aa  171  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13128  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3905  DNA adenine methylase  40.17 
 
 
235 aa  170  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2282  retron adenine methylase  36.84 
 
 
293 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.619879  hitchhiker  2.98029e-22 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0458  DNA adenine methylase  37.75 
 
 
317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0922232  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1110  retron adenine methylase  36 
 
 
289 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.588496 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0263  DNA adenine methylase  36.9 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.262484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1513  DNA adenine methylase  34.68 
 
 
313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971855  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2656  DNA adenine methylase  36.2 
 
 
283 aa  163  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1368  DNA adenine methylase  32.97 
 
 
270 aa  158  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544834  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00507  DNA adenine methylase  37.36 
 
 
293 aa  158  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0847  DNA adenine methylase  33.66 
 
 
306 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0151  DNA adenine methylase  33.89 
 
 
306 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.851887  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0378  DNA adenine methylase  36.63 
 
 
278 aa  155  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3880  DNA adenine methylase  35.16 
 
 
270 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33854  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1756  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  33.55 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.663014  normal  0.0339487 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1281  DNA adenine methylase  32.07 
 
 
288 aa  151  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329872  normal  0.126066 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3800  DNA adenine methylase  35.74 
 
 
288 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4057  DNA adenine methylase  33.7 
 
 
270 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000515222  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03239  DNA adenine methylase  34.42 
 
 
278 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0326  DNA adenine methylase  34.42 
 
 
278 aa  149  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0341  DNA adenine methylase  35.06 
 
 
271 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0326  DNA adenine methylase  34.42 
 
 
278 aa  149  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.168189  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4691  DNA adenine methylase  34.42 
 
 
278 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.368907  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3764  DNA adenine methylase  34.42 
 
 
278 aa  149  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0637881  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03191  hypothetical protein  34.42 
 
 
278 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277924  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3583  DNA adenine methylase  34.42 
 
 
278 aa  149  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0033886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3857  DNA adenine methylase  34.42 
 
 
278 aa  149  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00206502  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3313  DNA adenine methylase  33.94 
 
 
271 aa  149  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3756  DNA adenine methylase  34.06 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3681  DNA adenine methylase  34.06 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3852  DNA adenine methylase  34.06 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3683  DNA adenine methylase  34.06 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00514879  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3790  DNA adenine methylase  34.06 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0828962  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0475  DNA adenine methylase  32.97 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3663  DNA adenine methylase  34.06 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.208265  normal  0.0250573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4000  DNA adenine methylase  35.16 
 
 
279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0241  DNA adenine methylase  35.51 
 
 
279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.808773  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0888  DNA adenine methylase  34.42 
 
 
290 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4081  DNA adenine methylase  35.16 
 
 
279 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4199  DNA adenine methylase  35.16 
 
 
279 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.246501  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0289  DNA adenine methylase  34.8 
 
 
279 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0228  DNA adenine methylase  35.04 
 
 
271 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0459983  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4110  DNA adenine methylase  34.8 
 
 
279 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.395819  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0216  DNA adenine methylase  35.87 
 
 
279 aa  144  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0213822 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2203  DNA adenine methylase  33.81 
 
 
277 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.446235  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3963  DNA adenine methylase  35.04 
 
 
271 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3724  DNA adenine methylase  35.04 
 
 
271 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00179541  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3891  DNA adenine methylase  34.43 
 
 
279 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.728671 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3703  DNA adenine methylase  34.43 
 
 
279 aa  143  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3365  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  34.78 
 
 
280 aa  142  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3695  DNA adenine methylase  34.07 
 
 
279 aa  142  8e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0250  DNA adenine methylase  34.07 
 
 
279 aa  142  8e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2320  DNA adenine methylase  34.93 
 
 
272 aa  142  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.3975  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0343  DNA adenine methylase  34.78 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0264  DNA adenine methylase  35.16 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0659762  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002330  methyl-directed repair DNA adenine methylase  33.33 
 
 
279 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.455912  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0344  DNA adenine methylase  33.57 
 
 
277 aa  140  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1835  DNA adenine methylase  35.31 
 
 
302 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0166  DNA adenine methylase  34.18 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4602  DNA adenine methylase  36.03 
 
 
270 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0997785  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00025  DNA adenine methylase  32.97 
 
 
279 aa  139  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0821  DNA adenine methylase  33.2 
 
 
251 aa  139  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1822  DNA adenine methylase  31.18 
 
 
273 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1090  DNA adenine methylase  32.49 
 
 
264 aa  138  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1477  DNA adenine methylase  31.85 
 
 
283 aa  138  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0663  DNA adenine methylase  32.97 
 
 
277 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4262  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  34.78 
 
 
279 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0349455 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2725  DNA adenine methylase  33.7 
 
 
276 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1115  DNA adenine methylase Dam  32 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.664514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2636  DNA adenine methylase  33.45 
 
 
280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0410463  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1093  DNA adenine methylase  30.88 
 
 
286 aa  132  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  hitchhiker  0.000226621 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0539  DNA adenine methylase  32.97 
 
 
272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3351  DNA adenine methylase  31.16 
 
 
274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28151  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1136  DNA adenine methylase  33.33 
 
 
272 aa  125  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>