181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2282 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2282  retron adenine methylase  100 
 
 		 293 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.619879  hitchhiker  2.98029e-22 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1110  retron adenine methylase  86.32 
 
 		 289 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.588496 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0241  DNA adenine methylase  46.84 
 
 		 279 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.808773  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0378  DNA adenine methylase  47.01 
 
 		 278 aa  240  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0216  DNA adenine methylase  46.84 
 
 		 279 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213822 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3365  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  46.1 
 
 		 280 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0343  DNA adenine methylase  46.47 
 
 		 279 aa  238  9e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0264  DNA adenine methylase  45.9 
 
 		 279 aa  238  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0659762  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4262  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  46.1 
 
 		 279 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4110  DNA adenine methylase  45.9 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.395819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4000  DNA adenine methylase  45.52 
 
 		 279 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4081  DNA adenine methylase  45.52 
 
 		 279 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4199  DNA adenine methylase  45.52 
 
 		 279 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.246501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3703  DNA adenine methylase  45.52 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00025  DNA adenine methylase  45.19 
 
 		 279 aa  230  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002330  methyl-directed repair DNA adenine methylase  45.19 
 
 		 279 aa  229  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.455912  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2203  DNA adenine methylase  44.44 
 
 		 277 aa  227  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.446235  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00507  DNA adenine methylase  44.94 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4602  DNA adenine methylase  45.02 
 
 		 270 aa  226  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0997785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0263  DNA adenine methylase  44.03 
 
 		 275 aa  225  7e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.262484  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3695  DNA adenine methylase  44.03 
 
 		 279 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0250  DNA adenine methylase  44.03 
 
 		 279 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3891  DNA adenine methylase  44.03 
 
 		 279 aa  223  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.728671 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2725  DNA adenine methylase  44.61 
 
 		 276 aa  222  6e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2656  DNA adenine methylase  44.78 
 
 		 283 aa  221  9e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119155  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0289  DNA adenine methylase  44.03 
 
 		 279 aa  220  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3963  DNA adenine methylase  43.66 
 
 		 271 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3724  DNA adenine methylase  43.66 
 
 		 271 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00179541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0228  DNA adenine methylase  43.66 
 
 		 271 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0459983  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03239  DNA adenine methylase  43.07 
 
 		 278 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0326  DNA adenine methylase  43.07 
 
 		 278 aa  216  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03191  hypothetical protein  43.07 
 
 		 278 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277924  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0326  DNA adenine methylase  43.07 
 
 		 278 aa  216  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.168189  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3764  DNA adenine methylase  43.07 
 
 		 278 aa  216  5e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0637881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4691  DNA adenine methylase  43.07 
 
 		 278 aa  216  5e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.368907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3583  DNA adenine methylase  43.07 
 
 		 278 aa  216  5e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0033886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3857  DNA adenine methylase  43.07 
 
 		 278 aa  216  5e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00206502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3663  DNA adenine methylase  43.07 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.208265  normal  0.0250573 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3880  DNA adenine methylase  42.54 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33854  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4057  DNA adenine methylase  42.16 
 
 		 270 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000515222  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1090  DNA adenine methylase  41.48 
 
 		 264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0663  DNA adenine methylase  42.54 
 
 		 277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3852  DNA adenine methylase  42.32 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3756  DNA adenine methylase  42.32 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3683  DNA adenine methylase  42.32 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00514879  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3790  DNA adenine methylase  42.32 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0828962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3800  DNA adenine methylase  41.67 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2320  DNA adenine methylase  41.67 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.3975  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3681  DNA adenine methylase  42.32 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0341  DNA adenine methylase  42.32 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2636  DNA adenine methylase  45.99 
 
 		 280 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0410463  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0888  DNA adenine methylase  43.02 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3058  retron adenine methylase  41.51 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.99248 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0917  retron adenine methylase  41.13 
 
 		 285 aa  202  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000765231  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0475  DNA adenine methylase  38.97 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0690  DNA adenine methylase  39.18 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0708  DNA adenine methylase  39.11 
 
 		 272 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0166  DNA adenine methylase  40.67 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0344  DNA adenine methylase  40.07 
 
 		 277 aa  200  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2876  retron adenine methylase  41.98 
 
 		 285 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.672134  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1136  DNA adenine methylase  43.33 
 
 		 272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0539  DNA adenine methylase  42.75 
 
 		 272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2786  DNA adenine methylase  41.29 
 
 		 284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0697189  normal  0.0136814 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3839  DNA adenine methylase  42.37 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.236937  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2942  retron adenine methylase  41.29 
 
 		 277 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0304018  hitchhiker  1.0655700000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1115  DNA adenine methylase Dam  38.24 
 
 		 277 aa  188  8e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.664514  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5483  DNA adenine methylase  39.15 
 
 		 265 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3347  DNA adenine methylase  39.33 
 
 		 303 aa  176  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.758382 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3321  DNA adenine methylase  36.84 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04430  DNA adenine methylase  29.69 
 
 		 306 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1588  DNA adenine methylase  32.61 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  33.82 
 
 		 277 aa  155  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3991  DNA adenine methylase  33.09 
 
 		 280 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.075904  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0233  DNA adenine methylase  34.17 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.793505 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3363  DNA adenine methylase  32.36 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.757208  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  32.95 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2739  DNA adenine methylase  32.36 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0884  DNA adenine methylase  33.7 
 
 		 294 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3140  DNA adenine methylase  34.62 
 
 		 638 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0828  DNA adenine methylase  32.36 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.90544  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  32.6 
 
 		 279 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1499  DNA adenine methylase  33.08 
 
 		 280 aa  147  3e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.142483 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1737  DNA adenine methylase  38.06 
 
 		 270 aa  145  9e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00929025  normal  0.808648 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1513  DNA adenine methylase  31.6 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971855  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0179  DNA adenine methylase  31.62 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000431718  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1929  DNA adenine methylase  35.07 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0308  DNA adenine methylase  32.87 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0432416  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1790  DNA adenine methylase  32.84 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.557139  normal  0.0298379 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0458  DNA adenine methylase  32.08 
 
 		 317 aa  139  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0922232  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0847  DNA adenine methylase  31.42 
 
 		 306 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0517  DNA adenine methylase  31.21 
 
 		 332 aa  137  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13128  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0703  DNA adenine methylase  31.13 
 
 		 325 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0202559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1003  DNA adenine methylase  31.65 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0410349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  29.79 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2087  DNA adenine methylase  33.58 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.674044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1945  DNA adenine methylase  31.6 
 
 		 324 aa  132  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1477  DNA adenine methylase  32.16 
 
 		 283 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0151  DNA adenine methylase  30.07 
 
 		 306 aa  132  9e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.851887  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1281  DNA adenine methylase  31.95 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329872  normal  0.126066 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1756  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.53 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.663014  normal  0.0339487 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>