185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1093 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1093  DNA adenine methylase  100 
 
 
286 aa  591  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  hitchhiker  0.000226621 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1822  DNA adenine methylase  42.37 
 
 
273 aa  206  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3351  DNA adenine methylase  37.08 
 
 
274 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28151  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1737  DNA adenine methylase  38.78 
 
 
270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00929025  normal  0.808648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3313  DNA adenine methylase  35.74 
 
 
271 aa  158  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3347  DNA adenine methylase  35.14 
 
 
303 aa  156  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.758382 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  36.18 
 
 
275 aa  151  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3140  DNA adenine methylase  35.34 
 
 
638 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1835  DNA adenine methylase  36.98 
 
 
302 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1281  DNA adenine methylase  31.94 
 
 
288 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329872  normal  0.126066 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  34.18 
 
 
279 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1368  DNA adenine methylase  33.08 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544834  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0828  DNA adenine methylase  31.37 
 
 
277 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.90544  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  37.13 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2739  DNA adenine methylase  34.65 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3363  DNA adenine methylase  34.65 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.757208  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0821  DNA adenine methylase  32.67 
 
 
251 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  33.46 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3991  DNA adenine methylase  31.34 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.075904  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0216  DNA adenine methylase  33.46 
 
 
279 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0213822 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0241  DNA adenine methylase  33.84 
 
 
279 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.808773  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3703  DNA adenine methylase  33.46 
 
 
279 aa  136  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04430  DNA adenine methylase  30.9 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3321  DNA adenine methylase  30.88 
 
 
289 aa  132  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3695  DNA adenine methylase  32.95 
 
 
279 aa  132  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3891  DNA adenine methylase  32.95 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.728671 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4262  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  33.84 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0349455 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4199  DNA adenine methylase  35.06 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.246501  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0690  DNA adenine methylase  31.46 
 
 
272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4000  DNA adenine methylase  34.66 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0250  DNA adenine methylase  32.58 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4110  DNA adenine methylase  34.4 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.395819  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4081  DNA adenine methylase  34.66 
 
 
279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0884  DNA adenine methylase  34.6 
 
 
294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0343  DNA adenine methylase  32.32 
 
 
279 aa  129  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1929  DNA adenine methylase  32.53 
 
 
306 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168288  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0289  DNA adenine methylase  32.58 
 
 
279 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0708  DNA adenine methylase  31.09 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1945  DNA adenine methylase  31.99 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2087  DNA adenine methylase  34.07 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.674044  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2942  retron adenine methylase  31.75 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0304018  hitchhiker  1.0655700000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0308  DNA adenine methylase  29.49 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0432416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0179  DNA adenine methylase  31.62 
 
 
278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000431718  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  31.25 
 
 
280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0264  DNA adenine methylase  32.7 
 
 
279 aa  125  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0659762  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1499  DNA adenine methylase  30.18 
 
 
280 aa  125  9e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.142483 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1477  DNA adenine methylase  34.17 
 
 
283 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2876  retron adenine methylase  31.82 
 
 
285 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.672134  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3365  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  34 
 
 
280 aa  123  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0378  DNA adenine methylase  30.8 
 
 
278 aa  123  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0917  retron adenine methylase  32.82 
 
 
285 aa  123  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000765231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0233  DNA adenine methylase  33.73 
 
 
293 aa  122  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.793505 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0344  DNA adenine methylase  32.47 
 
 
277 aa  122  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3058  retron adenine methylase  31.6 
 
 
285 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.99248 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1003  DNA adenine methylase  31 
 
 
309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0410349  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2786  DNA adenine methylase  30.94 
 
 
284 aa  119  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0697189  normal  0.0136814 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  31.3 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3839  DNA adenine methylase  31.27 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.236937  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1588  DNA adenine methylase  28.83 
 
 
278 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0663  DNA adenine methylase  31.34 
 
 
277 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2656  DNA adenine methylase  32.71 
 
 
283 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119155  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00507  DNA adenine methylase  31.42 
 
 
293 aa  116  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1110  retron adenine methylase  31.36 
 
 
289 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.588496 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0703  DNA adenine methylase  32.36 
 
 
325 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0202559  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20420  DNA adenine methylase Dam  33.63 
 
 
305 aa  113  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.180762 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0263  DNA adenine methylase  30.74 
 
 
275 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.262484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1513  DNA adenine methylase  28.19 
 
 
313 aa  112  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971855  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2320  DNA adenine methylase  31.85 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.3975  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1090  DNA adenine methylase  33.04 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2282  retron adenine methylase  32.77 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.619879  hitchhiker  2.98029e-22 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0151  DNA adenine methylase  29.51 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.851887  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0888  DNA adenine methylase  29.74 
 
 
290 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0475  DNA adenine methylase  29.61 
 
 
273 aa  109  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0847  DNA adenine methylase  29.23 
 
 
306 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0166  DNA adenine methylase  29.39 
 
 
275 aa  109  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3663  DNA adenine methylase  30.8 
 
 
278 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.208265  normal  0.0250573 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1756  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.3 
 
 
306 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.663014  normal  0.0339487 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0341  DNA adenine methylase  35.29 
 
 
271 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03239  DNA adenine methylase  30.8 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0326  DNA adenine methylase  30.8 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03191  hypothetical protein  30.8 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277924  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4691  DNA adenine methylase  30.8 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.368907  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0326  DNA adenine methylase  30.8 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.168189  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3764  DNA adenine methylase  30.8 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0637881  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3583  DNA adenine methylase  30.8 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0033886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3857  DNA adenine methylase  30.8 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00206502  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0539  DNA adenine methylase  31.11 
 
 
272 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0517  DNA adenine methylase  32.17 
 
 
332 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13128  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2725  DNA adenine methylase  30 
 
 
276 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3800  DNA adenine methylase  28.73 
 
 
288 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3683  DNA adenine methylase  31.09 
 
 
278 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00514879  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3681  DNA adenine methylase  31.09 
 
 
278 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3852  DNA adenine methylase  31.09 
 
 
278 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3790  DNA adenine methylase  31.09 
 
 
278 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0828962  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3756  DNA adenine methylase  31.09 
 
 
278 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4057  DNA adenine methylase  34.31 
 
 
270 aa  105  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000515222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0458  DNA adenine methylase  28.71 
 
 
317 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0922232  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5483  DNA adenine methylase  31.2 
 
 
265 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3880  DNA adenine methylase  32.51 
 
 
270 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33854  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1115  DNA adenine methylase Dam  27.01 
 
 
277 aa  103  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.664514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>