167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0821 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0821  DNA adenine methylase  100 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1368  DNA adenine methylase  54.18 
 
 		 270 aa  295  4e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544834  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3313  DNA adenine methylase  51.42 
 
 		 271 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  40.71 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  39.53 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  38.19 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1737  DNA adenine methylase  37.6 
 
 		 270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00929025  normal  0.808648 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  34.87 
 
 		 280 aa  158  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1499  DNA adenine methylase  39.46 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.142483 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0828  DNA adenine methylase  35.25 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.90544  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04430  DNA adenine methylase  37.13 
 
 		 306 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  37.45 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0884  DNA adenine methylase  35.98 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3347  DNA adenine methylase  33.06 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.758382 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3363  DNA adenine methylase  36.22 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.757208  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3991  DNA adenine methylase  35.04 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.075904  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2739  DNA adenine methylase  36.22 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1477  DNA adenine methylase  39.45 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0233  DNA adenine methylase  33.09 
 
 		 293 aa  152  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.793505 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3140  DNA adenine methylase  37.87 
 
 		 638 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1281  DNA adenine methylase  33.46 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329872  normal  0.126066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2087  DNA adenine methylase  35.41 
 
 		 292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.674044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3351  DNA adenine methylase  33.6 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0308  DNA adenine methylase  39.92 
 
 		 310 aa  143  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0432416  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1822  DNA adenine methylase  36.59 
 
 		 273 aa  142  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1093  DNA adenine methylase  32.67 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  hitchhiker  0.000226621 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1588  DNA adenine methylase  36.33 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  35.88 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3321  DNA adenine methylase  33.2 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1513  DNA adenine methylase  34.59 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971855  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0179  DNA adenine methylase  33.07 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000431718  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3905  DNA adenine methylase  33.05 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0703  DNA adenine methylase  34.19 
 
 		 325 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0202559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1945  DNA adenine methylase  29.97 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1003  DNA adenine methylase  32.33 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0410349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0517  DNA adenine methylase  30.97 
 
 		 332 aa  126  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13128  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1835  DNA adenine methylase  32.63 
 
 		 302 aa  125  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1929  DNA adenine methylase  29.78 
 
 		 306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1756  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.62 
 
 		 306 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.663014  normal  0.0339487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1110  retron adenine methylase  28.74 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.588496 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2282  retron adenine methylase  28.46 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.619879  hitchhiker  2.98029e-22 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0847  DNA adenine methylase  29.97 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0708  DNA adenine methylase  29.75 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0458  DNA adenine methylase  33.09 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0922232  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0151  DNA adenine methylase  30.31 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.851887  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0690  DNA adenine methylase  29.75 
 
 		 272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3365  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.75 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0263  DNA adenine methylase  26.38 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.262484  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1115  DNA adenine methylase Dam  29.84 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.664514  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0539  DNA adenine methylase  26.07 
 
 		 272 aa  102  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1464  DNA adenine methylase  34.13 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000122278  normal  0.830812 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0378  DNA adenine methylase  29.17 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1090  DNA adenine methylase  29.41 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3963  DNA adenine methylase  28.51 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102575  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0241  DNA adenine methylase  30.38 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.808773  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3724  DNA adenine methylase  28.51 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00179541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0228  DNA adenine methylase  28.51 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0459983  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1790  DNA adenine methylase  32.74 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.557139  normal  0.0298379 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0475  DNA adenine methylase  28.17 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3891  DNA adenine methylase  28.46 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.728671 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4199  DNA adenine methylase  29.11 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.246501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4057  DNA adenine methylase  30.54 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000515222  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3703  DNA adenine methylase  29.64 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3880  DNA adenine methylase  30.54 
 
 		 270 aa  99.4  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33854  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4000  DNA adenine methylase  28.69 
 
 		 279 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4081  DNA adenine methylase  28.69 
 
 		 279 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0250  DNA adenine methylase  28.46 
 
 		 279 aa  98.6  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4110  DNA adenine methylase  28.69 
 
 		 279 aa  98.6  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.395819  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3695  DNA adenine methylase  28.46 
 
 		 279 aa  98.6  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4602  DNA adenine methylase  30.5 
 
 		 270 aa  97.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0997785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2656  DNA adenine methylase  30.65 
 
 		 283 aa  97.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119155  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4539  DNA adenine methylase  32.61 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2203  DNA adenine methylase  29.03 
 
 		 277 aa  96.3  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.446235  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2890  DNA adenine methylase  29.02 
 
 		 295 aa  95.9  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0166  DNA adenine methylase  28.19 
 
 		 275 aa  94.4  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0344  DNA adenine methylase  27.68 
 
 		 277 aa  92.8  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0663  DNA adenine methylase  26.64 
 
 		 277 aa  93.2  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4262  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28.57 
 
 		 279 aa  92.8  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349455 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0343  DNA adenine methylase  28.51 
 
 		 279 aa  92.4  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0289  DNA adenine methylase  27.27 
 
 		 279 aa  92.8  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00507  DNA adenine methylase  27.43 
 
 		 293 aa  92.8  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0216  DNA adenine methylase  26.86 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213822 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2236  DNA adenine methylase  33.14 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00406547  hitchhiker  0.0000680943 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20420  DNA adenine methylase Dam  31.41 
 
 		 305 aa  89.7  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.180762 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0264  DNA adenine methylase  29.67 
 
 		 279 aa  89.4  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0659762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0341  DNA adenine methylase  26.05 
 
 		 271 aa  89.4  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0202  DNA adenine methylase  26.94 
 
 		 304 aa  89  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.790639  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2786  DNA adenine methylase  26.25 
 
 		 284 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0697189  normal  0.0136814 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1136  DNA adenine methylase  23.43 
 
 		 272 aa  88.6  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03239  DNA adenine methylase  28.57 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0326  DNA adenine methylase  28.57 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03191  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277924  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3764  DNA adenine methylase  28.57 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0637881  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3800  DNA adenine methylase  25.85 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4691  DNA adenine methylase  28.57 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.368907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3583  DNA adenine methylase  28.57 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0033886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3857  DNA adenine methylase  28.57 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00206502  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0326  DNA adenine methylase  28.57 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.168189  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3663  DNA adenine methylase  28.57 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.208265  normal  0.0250573 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00025  DNA adenine methylase  26.25 
 
 		 279 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>