166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_20420 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_20420  DNA adenine methylase Dam  100 
 
 		 305 aa  627  1e-179  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.180762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3347  DNA adenine methylase  34.42 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.758382 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1281  DNA adenine methylase  32.95 
 
 		 288 aa  123  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329872  normal  0.126066 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3140  DNA adenine methylase  34.22 
 
 		 638 aa  122  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2739  DNA adenine methylase  29.64 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3363  DNA adenine methylase  29.64 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.757208  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  30.31 
 
 		 280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1093  DNA adenine methylase  33.63 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  hitchhiker  0.000226621 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2087  DNA adenine methylase  35.08 
 
 		 292 aa  112  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.674044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  30.4 
 
 		 279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0828  DNA adenine methylase  29.53 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.90544  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1477  DNA adenine methylase  33.88 
 
 		 283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1464  DNA adenine methylase  31.78 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000122278  normal  0.830812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1822  DNA adenine methylase  33.65 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  31.54 
 
 		 275 aa  106  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  31.44 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3991  DNA adenine methylase  29.57 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.075904  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  31.75 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1003  DNA adenine methylase  29.92 
 
 		 309 aa  102  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0410349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0458  DNA adenine methylase  32.81 
 
 		 317 aa  102  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0922232  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0884  DNA adenine methylase  31.68 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1737  DNA adenine methylase  34.02 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00929025  normal  0.808648 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1588  DNA adenine methylase  29.5 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  31.14 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1790  DNA adenine methylase  31.06 
 
 		 263 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.557139  normal  0.0298379 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1756  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.56 
 
 		 306 aa  99.4  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.663014  normal  0.0339487 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0151  DNA adenine methylase  30.47 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.851887  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0847  DNA adenine methylase  31.55 
 
 		 306 aa  96.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1368  DNA adenine methylase  32.12 
 
 		 270 aa  96.7  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544834  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0517  DNA adenine methylase  31.08 
 
 		 332 aa  96.3  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13128  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1513  DNA adenine methylase  27.76 
 
 		 313 aa  96.3  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971855  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1929  DNA adenine methylase  32.11 
 
 		 306 aa  93.2  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0308  DNA adenine methylase  27.69 
 
 		 310 aa  92.8  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0432416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3313  DNA adenine methylase  29.63 
 
 		 271 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0233  DNA adenine methylase  30.89 
 
 		 293 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.793505 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2890  DNA adenine methylase  25.97 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0026  DNA adenine methylase  30.37 
 
 		 375 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00842567  hitchhiker  0.0000104087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4539  DNA adenine methylase  31.38 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0202  DNA adenine methylase  28.07 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.790639  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1945  DNA adenine methylase  31.03 
 
 		 324 aa  89.7  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0821  DNA adenine methylase  31.41 
 
 		 251 aa  89.7  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0703  DNA adenine methylase  30.17 
 
 		 325 aa  89  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0202559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0179  DNA adenine methylase  29.22 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000431718  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3351  DNA adenine methylase  30.22 
 
 		 274 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2786  DNA adenine methylase  27.53 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0697189  normal  0.0136814 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1835  DNA adenine methylase  31.19 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1587  DNA adenine methylase Dam  29.18 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.893709 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2236  DNA adenine methylase  29.27 
 
 		 314 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00406547  hitchhiker  0.0000680943 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0264  DNA adenine methylase  27.41 
 
 		 279 aa  86.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0659762  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04430  DNA adenine methylase  25.48 
 
 		 306 aa  86.3  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3321  DNA adenine methylase  27.38 
 
 		 289 aa  85.5  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0888  DNA adenine methylase  27.17 
 
 		 290 aa  85.5  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0917  retron adenine methylase  28.21 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000765231  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3058  retron adenine methylase  28.21 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.99248 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3365  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.17 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1499  DNA adenine methylase  26.69 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.142483 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0663  DNA adenine methylase  28 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2203  DNA adenine methylase  28.14 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.446235  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2876  retron adenine methylase  28.39 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.672134  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00507  DNA adenine methylase  26.97 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00025  DNA adenine methylase  27.84 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002330  methyl-directed repair DNA adenine methylase  28.26 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.455912  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2320  DNA adenine methylase  28.75 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.3975  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5483  DNA adenine methylase  30.17 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0241  DNA adenine methylase  27.2 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.808773  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3800  DNA adenine methylase  25.68 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0216  DNA adenine methylase  28.93 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213822 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0344  DNA adenine methylase  27.19 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0166  DNA adenine methylase  26.47 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0289  DNA adenine methylase  29 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0378  DNA adenine methylase  25.87 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1115  DNA adenine methylase Dam  24.6 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.664514  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3905  DNA adenine methylase  29.41 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2656  DNA adenine methylase  28.51 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4000  DNA adenine methylase  26.54 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4081  DNA adenine methylase  26.54 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4110  DNA adenine methylase  26.54 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.395819  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3703  DNA adenine methylase  27.21 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4199  DNA adenine methylase  27.69 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.246501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1136  DNA adenine methylase  25.98 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3790  DNA adenine methylase  27.07 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0828962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3683  DNA adenine methylase  27.07 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00514879  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2282  retron adenine methylase  27.06 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.619879  hitchhiker  2.98029e-22 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3756  DNA adenine methylase  27.07 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3852  DNA adenine methylase  27.07 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3681  DNA adenine methylase  27.07 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0475  DNA adenine methylase  27.23 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3891  DNA adenine methylase  27.5 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.728671 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.12 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.895873 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0343  DNA adenine methylase  24.71 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0708  DNA adenine methylase  26.09 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1401  DNA adenine methylase  30.26 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.990942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0263  DNA adenine methylase  23.58 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.262484  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4602  DNA adenine methylase  25.95 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0997785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3695  DNA adenine methylase  27.5 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2725  DNA adenine methylase  27 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1090  DNA adenine methylase  23.95 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0539  DNA adenine methylase  28.75 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4262  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.88 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349455 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4057  DNA adenine methylase  25.57 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000515222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>