129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0202 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0202  DNA adenine methylase  100 
 
 		 304 aa  637    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.790639  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2890  DNA adenine methylase  57.61 
 
 		 295 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2236  DNA adenine methylase  49.63 
 
 		 314 aa  286  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00406547  hitchhiker  0.0000680943 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0264  DNA adenine methylase  37.82 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0659762  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3365  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  38.34 
 
 		 280 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0216  DNA adenine methylase  36.92 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213822 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3347  DNA adenine methylase  27.08 
 
 		 303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.758382 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0289  DNA adenine methylase  35.75 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0241  DNA adenine methylase  35.23 
 
 		 279 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.808773  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3695  DNA adenine methylase  36.98 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0250  DNA adenine methylase  35.23 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0475  DNA adenine methylase  31.84 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1790  DNA adenine methylase  33.91 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.557139  normal  0.0298379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3891  DNA adenine methylase  35.75 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.728671 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0343  DNA adenine methylase  36.41 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2876  retron adenine methylase  33.33 
 
 		 285 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.672134  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0378  DNA adenine methylase  35.9 
 
 		 278 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4081  DNA adenine methylase  35.38 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4110  DNA adenine methylase  35.38 
 
 		 279 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.395819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4000  DNA adenine methylase  35.38 
 
 		 279 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3839  DNA adenine methylase  31.2 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.236937  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4199  DNA adenine methylase  35.38 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.246501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3703  DNA adenine methylase  36.6 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0888  DNA adenine methylase  32.64 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2786  DNA adenine methylase  31.9 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0697189  normal  0.0136814 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4262  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  36.55 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349455 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1090  DNA adenine methylase  28.31 
 
 		 264 aa  105  8e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00025  DNA adenine methylase  30.17 
 
 		 279 aa  105  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2203  DNA adenine methylase  35.64 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.446235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  28.87 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0917  retron adenine methylase  31.36 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000765231  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3058  retron adenine methylase  31.36 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.99248 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3991  DNA adenine methylase  26.46 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.075904  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002330  methyl-directed repair DNA adenine methylase  36.14 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.455912  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2656  DNA adenine methylase  32 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0663  DNA adenine methylase  34.54 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2942  retron adenine methylase  32.86 
 
 		 277 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0304018  hitchhiker  1.0655700000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00507  DNA adenine methylase  34.36 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3756  DNA adenine methylase  29.75 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3790  DNA adenine methylase  29.75 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0828962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3681  DNA adenine methylase  29.75 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3683  DNA adenine methylase  29.75 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00514879  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3852  DNA adenine methylase  29.75 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03239  DNA adenine methylase  30.45 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0326  DNA adenine methylase  30.45 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3583  DNA adenine methylase  30.45 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0033886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3857  DNA adenine methylase  30.45 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00206502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03191  hypothetical protein  30.45 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277924  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0326  DNA adenine methylase  30.45 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.168189  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3663  DNA adenine methylase  33.83 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.208265  normal  0.0250573 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3764  DNA adenine methylase  30.45 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0637881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4691  DNA adenine methylase  30.45 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.368907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2725  DNA adenine methylase  35.82 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3880  DNA adenine methylase  29.61 
 
 		 270 aa  96.7  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33854  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3800  DNA adenine methylase  27.11 
 
 		 288 aa  96.7  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1499  DNA adenine methylase  27.88 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.142483 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0308  DNA adenine methylase  29.49 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0432416  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2320  DNA adenine methylase  31.22 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.3975  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0263  DNA adenine methylase  29.79 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.262484  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4057  DNA adenine methylase  28.33 
 
 		 270 aa  94  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000515222  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  29.34 
 
 		 279 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3313  DNA adenine methylase  33.67 
 
 		 271 aa  93.6  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0828  DNA adenine methylase  30.71 
 
 		 277 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.90544  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  27.05 
 
 		 275 aa  93.2  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4602  DNA adenine methylase  30.85 
 
 		 270 aa  92.4  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0997785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1835  DNA adenine methylase  27.49 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2282  retron adenine methylase  30.96 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.619879  hitchhiker  2.98029e-22 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1136  DNA adenine methylase  31.94 
 
 		 272 aa  92  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20420  DNA adenine methylase Dam  28.07 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.180762 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  27.97 
 
 		 277 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1587  DNA adenine methylase Dam  27.59 
 
 		 293 aa  89  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.893709 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0690  DNA adenine methylase  31.79 
 
 		 272 aa  89  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1115  DNA adenine methylase Dam  28.45 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.664514  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0166  DNA adenine methylase  28.02 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0821  DNA adenine methylase  26.94 
 
 		 251 aa  89  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1822  DNA adenine methylase  30 
 
 		 273 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1464  DNA adenine methylase  31.97 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000122278  normal  0.830812 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1110  retron adenine methylase  29.95 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.588496 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0708  DNA adenine methylase  30.77 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3140  DNA adenine methylase  25.08 
 
 		 638 aa  86.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0539  DNA adenine methylase  30.37 
 
 		 272 aa  87  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3963  DNA adenine methylase  32.5 
 
 		 271 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3724  DNA adenine methylase  32.5 
 
 		 271 aa  87  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00179541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0228  DNA adenine methylase  32.5 
 
 		 271 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0459983  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3363  DNA adenine methylase  26.05 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.757208  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1477  DNA adenine methylase  31.39 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4539  DNA adenine methylase  30.3 
 
 		 264 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2739  DNA adenine methylase  26.05 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3321  DNA adenine methylase  28.14 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1281  DNA adenine methylase  29.65 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329872  normal  0.126066 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0341  DNA adenine methylase  29.8 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  31.98 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1737  DNA adenine methylase  24.51 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00929025  normal  0.808648 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0049  DNA adenine methylase  26.77 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0344  DNA adenine methylase  28.21 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0179  DNA adenine methylase  25.51 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000431718  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  26.57 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5483  DNA adenine methylase  33.33 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1093  DNA adenine methylase  24.9 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  hitchhiker  0.000226621 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1368  DNA adenine methylase  26.5 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>