71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3299 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3299  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  100 
 
 		 280 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0632  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  90.36 
 
 		 281 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1606  putative adenine-specific DNA methyltransferase  45.35 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.299391  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3545  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  39.62 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.164224  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1631  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  37.59 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00785835  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1480  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  40.38 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0050  prophage Lp2 protein 3  44.32 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.287398  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2017  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  38.41 
 
 		 290 aa  171  9e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0878  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.74 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0291145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7315  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.45 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000824248  hitchhiker  0.000000113371 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0061  DNA-methyltransferase  32.8 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403537  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4407  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.27 
 
 		 283 aa  86.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.167881 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2028  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.15 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1749  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.9 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0183349  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2134  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.76 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0629434  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2016  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.96 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.469174 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1989  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.96 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.18 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.895873 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0503  site-specific DNA methylase-like protein  24.51 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0384  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.57 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.558909  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3706  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.54 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4254  DNA adenine methylase  26.4 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556419 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4215  DNA adenine methylase  26.4 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1098  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000180295 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0874  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.81 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2437  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.84 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0465  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.74 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821976  normal  0.340502 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1513  DNA adenine methylase  22 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971855  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0888  DNA adenine methylase  23.59 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0917  retron adenine methylase  23.74 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000765231  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1790  DNA adenine methylase  24.39 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.557139  normal  0.0298379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.55 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0103783  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1464  DNA adenine methylase  22.48 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000122278  normal  0.830812 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3058  retron adenine methylase  24.19 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.99248 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2890  DNA adenine methylase  25.83 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1093  DNA adenine methylase  21.92 
 
 		 286 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  hitchhiker  0.000226621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4539  DNA adenine methylase  21.95 
 
 		 264 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  21.83 
 
 		 275 aa  52.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3140  DNA adenine methylase  25.28 
 
 		 638 aa  52.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1477  DNA adenine methylase  23.85 
 
 		 283 aa  52.4  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0834  DNA adenine methylase  31.4 
 
 		 251 aa  52.4  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000010943  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3347  DNA adenine methylase  22.03 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.758382 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3839  DNA adenine methylase  21.13 
 
 		 318 aa  50.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.236937  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3376  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25 
 
 		 268 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.684699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  22.31 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2979  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.42 
 
 		 254 aa  50.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1756  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  23.87 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.663014  normal  0.0339487 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1475  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.57 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0847  DNA adenine methylase  23.27 
 
 		 306 aa  48.9  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3649  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  22.53 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3635  putative adenine-specific DNA methyltransferase  24.25 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0650243  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2052  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  24.63 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0637864  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0151  DNA adenine methylase  22.88 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.851887  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3769  adenine-specific DNA methyltransferase  24.28 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307242  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1279  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.55 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.230898  hitchhiker  0.0056893 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0139  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.55 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2786  DNA adenine methylase  24 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0697189  normal  0.0136814 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3360  adenine specific DNA methyltransferase, D12 class  23.11 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1627  putative N-6 adenine-specific DNA methylase  24.28 
 
 		 268 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2787  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.19 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1588  DNA adenine methylase  21.05 
 
 		 278 aa  45.8  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1568  methyltransferase, putative  21.92 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3004  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.31 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1281  DNA adenine methylase  22.34 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329872  normal  0.126066 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0220  DNA adenine methylase  23.1 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2876  retron adenine methylase  23.08 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.672134  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3085  Site-specific DNA methylase protein  25.54 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  19.35 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5555  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.57 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000602778 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1945  DNA adenine methylase  23.94 
 
 		 324 aa  43.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0670  DNA adenine methylase  26.74 
 
 		 163 aa  42.7  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0429675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>