136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1475 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1475  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  100 
 
 
310 aa  646    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2787  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  71.24 
 
 
305 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113292  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0834  DNA adenine methylase  44.6 
 
 
251 aa  226  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000010943  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0051  putative modification methylase dpniia  32.53 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481115  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0220  DNA adenine methylase  33.22 
 
 
271 aa  133  3e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3649  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.67 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2898  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.85 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.160115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.85 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  hitchhiker  0.00000213835 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2979  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.24 
 
 
254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3769  adenine-specific DNA methyltransferase  30.93 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307242  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1068  DNA adenine methylase  28.34 
 
 
262 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.859034  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1627  putative N-6 adenine-specific DNA methylase  30.58 
 
 
268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1697  hypothetical protein  28.34 
 
 
262 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1923  DNA adenine methylase  29.32 
 
 
323 aa  113  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595545  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2052  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  30.24 
 
 
268 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0637864  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1221  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.33 
 
 
265 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0898175  hitchhiker  0.0000277159 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3635  putative adenine-specific DNA methyltransferase  30.24 
 
 
268 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0650243  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1850  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.97 
 
 
262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000906575  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3376  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.24 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.684699  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3388  DNA adenine methylase, putative  27.33 
 
 
264 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1638  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.21 
 
 
264 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.355798  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3728  DNA adenine methylase  28.12 
 
 
274 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0139  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.07 
 
 
296 aa  102  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1279  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.07 
 
 
296 aa  102  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.230898  hitchhiker  0.0056893 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1568  methyltransferase, putative  29.71 
 
 
296 aa  102  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0463  putative N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  25.99 
 
 
263 aa  99.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2682  DNA adenine methylase  28.73 
 
 
263 aa  99.8  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.19 
 
 
673 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3360  adenine specific DNA methyltransferase, D12 class  27.27 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3396  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.84 
 
 
263 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0670  DNA adenine methylase  35.95 
 
 
163 aa  97.8  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0429675  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0181  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.6 
 
 
251 aa  96.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0177  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.68 
 
 
263 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.044334 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1401  DNA adenine methylase  24.74 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.990942  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3349  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.21 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0660  prophage PSPPH06, putative adenine modification methytransferase  26.07 
 
 
225 aa  91.3  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0690  type II DNA modification methyltransferase, putative  25.35 
 
 
253 aa  90.5  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2158  DNA adenine methylase  25 
 
 
253 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000173496  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3004  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.14 
 
 
321 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2112  DNA adenine methylase  25 
 
 
253 aa  89  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000292224  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0677  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.29 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1163  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.94 
 
 
277 aa  84  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  25.6 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3758  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.47 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98981  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0743  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.69 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0512045  hitchhiker  0.00111999 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3085  Site-specific DNA methylase protein  30.69 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4452  DNA adenine methyltransferase  28.74 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  28.43 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2376  DNA adenine methyltransferase  27.92 
 
 
285 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00648987  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  25.86 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5102  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.08 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1989  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.48 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2646  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.47 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2016  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.6 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.469174 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4275  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.51 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.020773  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4115  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.82 
 
 
530 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0261  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.76 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205482  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.92 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0103783  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2028  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.11 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3321  DNA adenine methylase  26.9 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3991  DNA adenine methylase  25.9 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.075904  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2739  DNA adenine methylase  27.27 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3363  DNA adenine methylase  27.27 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.757208  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4407  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.95 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.167881 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0384  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.57 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.558909  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2437  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.31 
 
 
279 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1822  DNA adenine methylase  25.41 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1588  DNA adenine methylase  26.35 
 
 
278 aa  67  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  27.6 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2199  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.91 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608262 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5496  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.24 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4254  DNA adenine methylase  25.8 
 
 
319 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000556419 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4215  DNA adenine methylase  25.8 
 
 
319 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2890  DNA adenine methylase  24.09 
 
 
295 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0297  adenine-specific DNA methylase, putative  28.07 
 
 
222 aa  64.3  0.000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00524367  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04430  DNA adenine methylase  25.4 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2134  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  22.73 
 
 
289 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0629434  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  26.92 
 
 
307 aa  63.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25 
 
 
287 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.895873 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0465  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.12 
 
 
284 aa  62.4  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821976  normal  0.340502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  24.91 
 
 
277 aa  62.4  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3755  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.29 
 
 
307 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0179  DNA adenine methylase  24.17 
 
 
278 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000431718  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1929  DNA adenine methylase  44.87 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168288  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1737  DNA adenine methylase  25.72 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00929025  normal  0.808648 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1281  DNA adenine methylase  25 
 
 
288 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329872  normal  0.126066 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0828  DNA adenine methylase  26.56 
 
 
277 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.90544  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4704  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.48 
 
 
286 aa  60.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0118751  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1749  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.23 
 
 
280 aa  59.7  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0183349  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0182  adenine-specific DNA methylase, putative  43.08 
 
 
215 aa  58.9  0.00000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0836  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  22.68 
 
 
348 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0647  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  22.88 
 
 
704 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0394  DNA adenine methylase  22.83 
 
 
345 aa  56.6  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2747  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.18 
 
 
303 aa  56.2  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.356078 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3347  DNA adenine methylase  23.45 
 
 
303 aa  55.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.758382 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3140  DNA adenine methylase  23.05 
 
 
638 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0166  DNA adenine methylase  25.71 
 
 
275 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1368  DNA adenine methylase  25.17 
 
 
270 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544834  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0475  DNA adenine methylase  25.36 
 
 
273 aa  52.8  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1945  DNA adenine methylase  26.36 
 
 
324 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>