49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2017 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2017  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  100 
 
 
290 aa  596  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3545  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  44.49 
 
 
280 aa  225  6e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.164224  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1631  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  40.21 
 
 
289 aa  223  3e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00785835  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1480  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  43.97 
 
 
293 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1606  putative adenine-specific DNA methyltransferase  41.33 
 
 
284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.299391  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0878  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  40.94 
 
 
296 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0291145  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0050  prophage Lp2 protein 3  44.36 
 
 
290 aa  207  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.287398  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3299  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  38.41 
 
 
280 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0632  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  39.36 
 
 
281 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7315  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.21 
 
 
314 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000824248  hitchhiker  0.000000113371 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0061  DNA-methyltransferase  30.74 
 
 
324 aa  116  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403537  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1098  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.42 
 
 
332 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000180295 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0874  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.49 
 
 
313 aa  94  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2016  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.53 
 
 
306 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.469174 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1989  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.53 
 
 
306 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4215  DNA adenine methylase  29.1 
 
 
319 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4254  DNA adenine methylase  29.1 
 
 
319 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000556419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4407  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.79 
 
 
283 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.167881 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0503  site-specific DNA methylase-like protein  26.74 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.81 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.895873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2134  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.42 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0629434  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2437  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.59 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1749  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.94 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0183349  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2028  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.81 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0384  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.89 
 
 
277 aa  63.9  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.558909  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3706  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.18 
 
 
248 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  24.8 
 
 
279 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1477  DNA adenine methylase  22.53 
 
 
283 aa  55.8  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0828  DNA adenine methylase  24.52 
 
 
277 aa  53.1  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.90544  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0465  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  22.36 
 
 
284 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821976  normal  0.340502 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3649  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.4 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  27.78 
 
 
275 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1115  DNA adenine methylase Dam  23.41 
 
 
277 aa  49.7  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.664514  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1790  DNA adenine methylase  20.88 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.557139  normal  0.0298379 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2236  DNA adenine methylase  27.31 
 
 
314 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00406547  hitchhiker  0.0000680943 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2747  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  20.55 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.356078 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0220  DNA adenine methylase  25.81 
 
 
271 aa  47  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  25.7 
 
 
307 aa  47  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  25 
 
 
277 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3140  DNA adenine methylase  22.8 
 
 
638 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0308  DNA adenine methylase  26.7 
 
 
310 aa  46.6  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0432416  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00025  DNA adenine methylase  25.68 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4275  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  22.12 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.020773  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2203  DNA adenine methylase  22.97 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.446235  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1136  DNA adenine methylase  19.85 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1464  DNA adenine methylase  22.68 
 
 
266 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000122278  normal  0.830812 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1499  DNA adenine methylase  22.27 
 
 
280 aa  43.5  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.142483 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1093  DNA adenine methylase  23.93 
 
 
286 aa  43.5  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  hitchhiker  0.000226621 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002330  methyl-directed repair DNA adenine methylase  25 
 
 
279 aa  42.7  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.455912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>