86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1606 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1606  putative adenine-specific DNA methyltransferase  100 
 
 		 284 aa  579  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.299391  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1631  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  47.31 
 
 		 289 aa  272  5.000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00785835  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3545  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  47.01 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.164224  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1480  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  45.26 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0050  prophage Lp2 protein 3  47.33 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.287398  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3299  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  45.35 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2017  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  41.18 
 
 		 290 aa  203  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0632  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  44.53 
 
 		 281 aa  202  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0878  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.9 
 
 		 296 aa  175  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0291145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7315  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.98 
 
 		 314 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000824248  hitchhiker  0.000000113371 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0061  DNA-methyltransferase  32.71 
 
 		 324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403537  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1989  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.15 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2016  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.15 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.469174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2028  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.34 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.42 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.895873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4407  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.3 
 
 		 283 aa  93.6  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.167881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2134  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.69 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0629434  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0503  site-specific DNA methylase-like protein  27.92 
 
 		 297 aa  90.1  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3706  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.78 
 
 		 248 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4254  DNA adenine methylase  30.53 
 
 		 319 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556419 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4215  DNA adenine methylase  30.53 
 
 		 319 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1477  DNA adenine methylase  25.88 
 
 		 283 aa  85.5  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0874  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.82 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2437  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.44 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1749  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.96 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0183349  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1098  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.07 
 
 		 332 aa  72.4  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000180295 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3649  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.19 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0384  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.91 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.558909  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1401  DNA adenine methylase  22.39 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.990942  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0465  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.72 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821976  normal  0.340502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.89 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0103783  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0139  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.36 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1279  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.36 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.230898  hitchhiker  0.0056893 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3004  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  20.31 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2979  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.86 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3321  DNA adenine methylase  24.11 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  23.41 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  25.59 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1568  methyltransferase, putative  23.93 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3349  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.46 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3140  DNA adenine methylase  25.76 
 
 		 638 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0690  type II DNA modification methyltransferase, putative  22.31 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3360  adenine specific DNA methyltransferase, D12 class  19.16 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1923  DNA adenine methylase  22.13 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595545  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2942  retron adenine methylase  23.02 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0304018  hitchhiker  1.0655700000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2158  DNA adenine methylase  23.02 
 
 		 253 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000173496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2112  DNA adenine methylase  23.02 
 
 		 253 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000292224  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0828  DNA adenine methylase  27.04 
 
 		 277 aa  52.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.90544  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1850  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.8 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000906575  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1697  hypothetical protein  22.83 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0182  adenine-specific DNA methylase, putative  27.55 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0297  adenine-specific DNA methylase, putative  27.55 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00524367  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1068  DNA adenine methylase  22.83 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.859034  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0884  DNA adenine methylase  21.57 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5555  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  21.78 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000602778 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2087  DNA adenine methylase  27.23 
 
 		 292 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.674044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2682  DNA adenine methylase  22.49 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.79 
 
 		 673 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4452  DNA adenine methyltransferase  25 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1835  DNA adenine methylase  25.32 
 
 		 302 aa  50.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1003  DNA adenine methylase  21.92 
 
 		 309 aa  50.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0410349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2646  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  22.89 
 
 		 297 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1368  DNA adenine methylase  22.98 
 
 		 270 aa  48.9  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544834  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  26.1 
 
 		 275 aa  48.9  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1513  DNA adenine methylase  24.05 
 
 		 313 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971855  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  23.17 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1588  DNA adenine methylase  26.11 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3755  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.26 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0677  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.24 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0233  DNA adenine methylase  21.4 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.793505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0743  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.38 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0512045  hitchhiker  0.00111999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1093  DNA adenine methylase  22.22 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  hitchhiker  0.000226621 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  21.76 
 
 		 280 aa  46.2  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0834  DNA adenine methylase  24.06 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000010943  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0261  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.22 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0308  DNA adenine methylase  24.88 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0432416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0179  DNA adenine methylase  22.84 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000431718  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0181  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  21.4 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2376  DNA adenine methyltransferase  24.07 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00648987  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1756  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  24.23 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.663014  normal  0.0339487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3396  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  20.38 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1281  DNA adenine methylase  23.97 
 
 		 288 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329872  normal  0.126066 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  22.76 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3839  DNA adenine methylase  20.38 
 
 		 318 aa  42.7  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.236937  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1790  DNA adenine methylase  23.08 
 
 		 263 aa  42.7  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.557139  normal  0.0298379 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2199  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.87 
 
 		 288 aa  42.7  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>