36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0297 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0297  adenine-specific DNA methylase, putative  100 
 
 		 222 aa  440  1e-123  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00524367  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0182  adenine-specific DNA methylase, putative  93.49 
 
 		 215 aa  401  1e-111  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0180  hypothetical protein  72.63 
 
 		 106 aa  144  9e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1475  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.07 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3649  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.74 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1989  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.95 
 
 		 306 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2016  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.95 
 
 		 306 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.469174 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1631  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.06 
 
 		 289 aa  54.3  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00785835  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2787  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.33 
 
 		 305 aa  52.4  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113292  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4254  DNA adenine methylase  29.53 
 
 		 319 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556419 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4215  DNA adenine methylase  29.53 
 
 		 319 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04430  DNA adenine methylase  34.35 
 
 		 306 aa  52  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1606  putative adenine-specific DNA methyltransferase  27.55 
 
 		 284 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.299391  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2890  DNA adenine methylase  25.27 
 
 		 295 aa  51.2  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4275  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.89 
 
 		 274 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.020773  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2158  DNA adenine methylase  22.01 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000173496  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0220  DNA adenine methylase  35.58 
 
 		 271 aa  49.3  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2028  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.75 
 
 		 292 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2112  DNA adenine methylase  21.62 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000292224  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0834  DNA adenine methylase  30.38 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000010943  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0051  putative modification methylase dpniia  25.81 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481115  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1281  DNA adenine methylase  31.5 
 
 		 288 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329872  normal  0.126066 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1588  DNA adenine methylase  27.13 
 
 		 278 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.55 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.895873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2979  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.33 
 
 		 254 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3706  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.14 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1401  DNA adenine methylase  22.9 
 
 		 253 aa  45.8  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.990942  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1480  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.26 
 
 		 293 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0670  DNA adenine methylase  36.36 
 
 		 163 aa  45.1  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0429675  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2437  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.28 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0690  type II DNA modification methyltransferase, putative  20.85 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0202  DNA adenine methylase  26.47 
 
 		 304 aa  43.5  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.790639  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1923  DNA adenine methylase  28.92 
 
 		 323 aa  42.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595545  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1697  hypothetical protein  28.92 
 
 		 262 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1513  DNA adenine methylase  29.23 
 
 		 313 aa  42  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971855  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1068  DNA adenine methylase  28.92 
 
 		 262 aa  42  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.859034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>