97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3706 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3706  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  100 
 
 
248 aa  521  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2016  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.8 
 
 
306 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.469174 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1989  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.43 
 
 
306 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2028  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.58 
 
 
292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.4 
 
 
287 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.895873 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2437  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.82 
 
 
279 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4407  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.95 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.167881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2134  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.11 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0629434  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0384  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.7 
 
 
277 aa  125  7e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.558909  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1749  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.46 
 
 
280 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0183349  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1606  putative adenine-specific DNA methyltransferase  27.78 
 
 
284 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.299391  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3299  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.54 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1477  DNA adenine methylase  28.57 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3649  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.77 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0632  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.26 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0051  putative modification methylase dpniia  25.76 
 
 
259 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481115  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0220  DNA adenine methylase  25.1 
 
 
271 aa  68.6  0.00000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0475  DNA adenine methylase  29.57 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0874  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.32 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0465  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.26 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821976  normal  0.340502 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0050  prophage Lp2 protein 3  25.49 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.287398  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0061  DNA-methyltransferase  28.72 
 
 
324 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403537  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1631  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.66 
 
 
289 aa  63.5  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00785835  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0878  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.64 
 
 
296 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0291145  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0503  site-specific DNA methylase-like protein  26.52 
 
 
297 aa  63.5  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7315  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.64 
 
 
314 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000824248  hitchhiker  0.000000113371 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0834  DNA adenine methylase  25.86 
 
 
251 aa  62.4  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000010943  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3545  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.25 
 
 
280 aa  62.4  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.164224  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1480  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.88 
 
 
293 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3140  DNA adenine methylase  25.86 
 
 
638 aa  62  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.09 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0103783  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4215  DNA adenine methylase  23.83 
 
 
319 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4254  DNA adenine methylase  23.83 
 
 
319 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000556419 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3396  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.38 
 
 
263 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1401  DNA adenine methylase  25.37 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.990942  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1098  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.69 
 
 
332 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000180295 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3360  adenine specific DNA methyltransferase, D12 class  26.21 
 
 
262 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0181  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.29 
 
 
251 aa  55.5  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2787  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.96 
 
 
305 aa  55.5  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113292  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1568  methyltransferase, putative  27.4 
 
 
296 aa  55.1  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0139  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.94 
 
 
296 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2158  DNA adenine methylase  24.51 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000173496  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3004  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.4 
 
 
321 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0539  DNA adenine methylase  27.27 
 
 
272 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1279  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.94 
 
 
296 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.230898  hitchhiker  0.0056893 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2112  DNA adenine methylase  24.51 
 
 
253 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000292224  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0690  type II DNA modification methyltransferase, putative  25.3 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3321  DNA adenine methylase  26.18 
 
 
289 aa  53.9  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  23.47 
 
 
280 aa  52.8  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2282  retron adenine methylase  25.65 
 
 
293 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.619879  hitchhiker  2.98029e-22 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0179  DNA adenine methylase  21.9 
 
 
278 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000431718  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3349  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.95 
 
 
284 aa  51.6  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1464  DNA adenine methylase  26.59 
 
 
266 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000122278  normal  0.830812 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1475  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.19 
 
 
310 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0828  DNA adenine methylase  24.18 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.90544  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1790  DNA adenine methylase  24.68 
 
 
263 aa  50.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.557139  normal  0.0298379 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1368  DNA adenine methylase  24.48 
 
 
270 aa  49.7  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544834  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1587  DNA adenine methylase Dam  25.77 
 
 
293 aa  49.7  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.893709 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3991  DNA adenine methylase  21.27 
 
 
280 aa  49.3  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.075904  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  21.55 
 
 
275 aa  49.3  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2017  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.18 
 
 
290 aa  48.9  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0888  DNA adenine methylase  26.83 
 
 
290 aa  48.9  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1115  DNA adenine methylase Dam  26.04 
 
 
277 aa  48.1  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.664514  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3351  DNA adenine methylase  26.05 
 
 
274 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28151  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  23.27 
 
 
307 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3085  Site-specific DNA methylase protein  34.23 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1110  retron adenine methylase  25.21 
 
 
289 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.588496 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0394  DNA adenine methylase  45.24 
 
 
345 aa  46.6  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2203  DNA adenine methylase  25.93 
 
 
277 aa  47  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.446235  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3758  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.02 
 
 
275 aa  46.6  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98981  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.49 
 
 
263 aa  46.2  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  hitchhiker  0.00000213835 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2898  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.49 
 
 
263 aa  46.2  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.160115 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  25.45 
 
 
279 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0297  adenine-specific DNA methylase, putative  32.14 
 
 
222 aa  45.8  0.0006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00524367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1835  DNA adenine methylase  24.69 
 
 
302 aa  45.4  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0836  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.24 
 
 
348 aa  45.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5483  DNA adenine methylase  23.68 
 
 
265 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  21.61 
 
 
279 aa  45.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1093  DNA adenine methylase  24.71 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  hitchhiker  0.000226621 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00507  DNA adenine methylase  27.5 
 
 
293 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0216  DNA adenine methylase  22.01 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0213822 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04430  DNA adenine methylase  22.01 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2320  DNA adenine methylase  26.63 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.3975  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2087  DNA adenine methylase  24.5 
 
 
292 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.674044  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4539  DNA adenine methylase  24.38 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1945  DNA adenine methylase  24.6 
 
 
324 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5555  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.66 
 
 
304 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000602778 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0663  DNA adenine methylase  28.46 
 
 
277 aa  43.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1090  DNA adenine methylase  24.37 
 
 
264 aa  42.7  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3376  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.37 
 
 
268 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.684699  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0182  adenine-specific DNA methylase, putative  33.9 
 
 
215 aa  42.7  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0647  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.55 
 
 
704 aa  42.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1822  DNA adenine methylase  23.38 
 
 
273 aa  42.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0670  DNA adenine methylase  29.01 
 
 
163 aa  42  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0429675  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0166  DNA adenine methylase  27.91 
 
 
275 aa  42.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0847  DNA adenine methylase  22.44 
 
 
306 aa  42  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1513  DNA adenine methylase  23.41 
 
 
313 aa  42  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>