143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0394 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0394  DNA adenine methylase  100 
 
 		 345 aa  670    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0026  DNA adenine methylase  39.3 
 
 		 375 aa  250  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00842567  hitchhiker  0.0000104087 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  35.26 
 
 		 280 aa  92  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1003  DNA adenine methylase  25.68 
 
 		 309 aa  89  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0410349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3905  DNA adenine methylase  33.91 
 
 		 235 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1945  DNA adenine methylase  25.27 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3991  DNA adenine methylase  31.58 
 
 		 280 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.075904  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3347  DNA adenine methylase  23.79 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.758382 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04430  DNA adenine methylase  31.43 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  28.72 
 
 		 275 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20420  DNA adenine methylase Dam  29.19 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.180762 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  27.64 
 
 		 307 aa  75.9  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0828  DNA adenine methylase  30.29 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.90544  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0179  DNA adenine methylase  29.03 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000431718  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  31.21 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0308  DNA adenine methylase  35.03 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0432416  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1588  DNA adenine methylase  28.65 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2739  DNA adenine methylase  33.52 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3363  DNA adenine methylase  33.52 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.757208  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1790  DNA adenine methylase  26.73 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.557139  normal  0.0298379 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0821  DNA adenine methylase  30.06 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2787  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.44 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1737  DNA adenine methylase  26.32 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00929025  normal  0.808648 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  29.03 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1281  DNA adenine methylase  30.41 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329872  normal  0.126066 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3321  DNA adenine methylase  28.07 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1368  DNA adenine methylase  29.94 
 
 		 270 aa  67  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544834  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1475  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  22.83 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1822  DNA adenine methylase  28.24 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1464  DNA adenine methylase  25.82 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000122278  normal  0.830812 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0847  DNA adenine methylase  23.58 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0475  DNA adenine methylase  28 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3313  DNA adenine methylase  32.23 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  28.41 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0166  DNA adenine methylase  27.17 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0703  DNA adenine methylase  25.2 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0202559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4539  DNA adenine methylase  22.01 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0051  putative modification methylase dpniia  28.7 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481115  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1499  DNA adenine methylase  27.75 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.142483 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0888  DNA adenine methylase  23.3 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0708  DNA adenine methylase  29.35 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0690  DNA adenine methylase  29.89 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2203  DNA adenine methylase  38.46 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.446235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0458  DNA adenine methylase  29.28 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0922232  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1115  DNA adenine methylase Dam  27.22 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.664514  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2028  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  37.36 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002330  methyl-directed repair DNA adenine methylase  29.52 
 
 		 279 aa  59.3  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.455912  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1749  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.59 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0183349  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0263  DNA adenine methylase  39.74 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.262484  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2437  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.51 
 
 		 279 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4057  DNA adenine methylase  37.23 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000515222  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1513  DNA adenine methylase  27.45 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971855  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0341  DNA adenine methylase  39.29 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1756  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  23.78 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.663014  normal  0.0339487 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4407  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  50.82 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.167881 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3963  DNA adenine methylase  41.89 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3724  DNA adenine methylase  41.89 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00179541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0228  DNA adenine methylase  41.89 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0459983  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0049  DNA adenine methylase  29.65 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5483  DNA adenine methylase  26.2 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00025  DNA adenine methylase  28.92 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0663  DNA adenine methylase  37.18 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3800  DNA adenine methylase  39.74 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00507  DNA adenine methylase  44.78 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3058  retron adenine methylase  24.7 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.99248 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0220  DNA adenine methylase  35.14 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0289  DNA adenine methylase  36.17 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0917  retron adenine methylase  24.7 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000765231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4602  DNA adenine methylase  39.19 
 
 		 270 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0997785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3880  DNA adenine methylase  35.11 
 
 		 270 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33854  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0343  DNA adenine methylase  35.79 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2016  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  44.26 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.469174 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2725  DNA adenine methylase  40.7 
 
 		 276 aa  55.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1989  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.59 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03239  DNA adenine methylase  34.91 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0326  DNA adenine methylase  34.91 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0344  DNA adenine methylase  25.15 
 
 		 277 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0264  DNA adenine methylase  37.39 
 
 		 279 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0659762  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0216  DNA adenine methylase  34.21 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213822 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0884  DNA adenine methylase  29.86 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3583  DNA adenine methylase  34.91 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0033886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3857  DNA adenine methylase  34.91 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00206502  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0326  DNA adenine methylase  34.91 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.168189  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03191  hypothetical protein  34.91 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277924  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3663  DNA adenine methylase  34.91 
 
 		 278 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.208265  normal  0.0250573 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3764  DNA adenine methylase  34.91 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0637881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3756  DNA adenine methylase  36.84 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3790  DNA adenine methylase  36.84 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0828962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3681  DNA adenine methylase  36.84 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3683  DNA adenine methylase  36.84 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00514879  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3852  DNA adenine methylase  36.84 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4691  DNA adenine methylase  34.91 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.368907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3365  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  34.04 
 
 		 280 aa  54.3  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0517  DNA adenine methylase  25 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13128  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1477  DNA adenine methylase  26.19 
 
 		 283 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2134  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.85 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0629434  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4262  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  33.68 
 
 		 279 aa  54.3  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349455 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0151  DNA adenine methylase  23.91 
 
 		 306 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.851887  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1929  DNA adenine methylase  24.53 
 
 		 306 aa  53.5  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3695  DNA adenine methylase  35.11 
 
 		 279 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>