170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2028 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2028  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  100 
 
 
292 aa  601  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1989  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  67.37 
 
 
306 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2016  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  67.02 
 
 
306 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.469174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4407  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  65.92 
 
 
283 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.167881 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1749  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  55.4 
 
 
280 aa  340  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0183349  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2134  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  58.67 
 
 
289 aa  338  9e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0629434  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0384  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  58.82 
 
 
277 aa  334  9e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.558909  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  56.83 
 
 
287 aa  330  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.895873 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2437  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  56.39 
 
 
279 aa  312  3.9999999999999997e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3706  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.58 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1631  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.45 
 
 
289 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00785835  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1606  putative adenine-specific DNA methyltransferase  31.34 
 
 
284 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.299391  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4254  DNA adenine methylase  28.47 
 
 
319 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000556419 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4215  DNA adenine methylase  28.47 
 
 
319 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0051  putative modification methylase dpniia  29.96 
 
 
259 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481115  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1477  DNA adenine methylase  29.01 
 
 
283 aa  89  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1401  DNA adenine methylase  30.19 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.990942  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1221  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.69 
 
 
265 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0898175  hitchhiker  0.0000277159 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1281  DNA adenine methylase  27.4 
 
 
288 aa  86.3  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329872  normal  0.126066 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2979  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.86 
 
 
254 aa  85.9  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3351  DNA adenine methylase  25.93 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28151  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  29.61 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3360  adenine specific DNA methyltransferase, D12 class  26.89 
 
 
262 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0834  DNA adenine methylase  24.43 
 
 
251 aa  84  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000010943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3299  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.15 
 
 
280 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0050  prophage Lp2 protein 3  28.62 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.287398  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0828  DNA adenine methylase  28.78 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.90544  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  29.41 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3388  DNA adenine methylase, putative  26.04 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3728  DNA adenine methylase  24.36 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  27.4 
 
 
280 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3004  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.49 
 
 
321 aa  79  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0233  DNA adenine methylase  23.39 
 
 
293 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.793505 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0690  type II DNA modification methyltransferase, putative  25 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1480  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.81 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  25.98 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1499  DNA adenine methylase  29.95 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.142483 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3649  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.28 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0179  DNA adenine methylase  22.38 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000431718  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3396  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.72 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0847  DNA adenine methylase  27.57 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0220  DNA adenine methylase  26.74 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3349  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.96 
 
 
284 aa  74.7  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04430  DNA adenine methylase  27.03 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0884  DNA adenine methylase  21.77 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2112  DNA adenine methylase  23.9 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000292224  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3991  DNA adenine methylase  28.65 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.075904  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2158  DNA adenine methylase  23.9 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000173496  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  25.99 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3140  DNA adenine methylase  29.44 
 
 
638 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1923  DNA adenine methylase  26.57 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595545  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3347  DNA adenine methylase  21.58 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.758382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0632  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.93 
 
 
281 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0647  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.84 
 
 
704 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0151  DNA adenine methylase  27.04 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.851887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1697  hypothetical protein  24.81 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1068  DNA adenine methylase  25.47 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.859034  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1475  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.11 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7315  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.5 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000824248  hitchhiker  0.000000113371 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2682  DNA adenine methylase  25 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0836  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.28 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3635  putative adenine-specific DNA methyltransferase  25.72 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0650243  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1945  DNA adenine methylase  27.59 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1279  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.230898  hitchhiker  0.0056893 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1756  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.05 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.663014  normal  0.0339487 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2087  DNA adenine methylase  27.69 
 
 
292 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.674044  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0139  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0465  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.64 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821976  normal  0.340502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1003  DNA adenine methylase  28.37 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0410349  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3545  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.164224  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1737  DNA adenine methylase  25.83 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00929025  normal  0.808648 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3376  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25 
 
 
268 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.684699  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3769  adenine-specific DNA methyltransferase  26.88 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2787  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.96 
 
 
305 aa  67  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113292  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0181  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.77 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1568  methyltransferase, putative  28 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1627  putative N-6 adenine-specific DNA methylase  26.16 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3321  DNA adenine methylase  24.64 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2052  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  24.28 
 
 
268 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0637864  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3363  DNA adenine methylase  28.34 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.757208  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1513  DNA adenine methylase  25.76 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971855  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2739  DNA adenine methylase  28.34 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1822  DNA adenine methylase  22.84 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20420  DNA adenine methylase Dam  21.57 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.180762 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0660  prophage PSPPH06, putative adenine modification methytransferase  24.43 
 
 
225 aa  64.3  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0703  DNA adenine methylase  24.83 
 
 
325 aa  63.5  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0202559  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0878  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.56 
 
 
296 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0291145  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0888  DNA adenine methylase  29.7 
 
 
290 aa  63.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  26.56 
 
 
307 aa  62.8  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.3 
 
 
273 aa  62.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0103783  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0177  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.43 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.044334 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1638  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  22.71 
 
 
264 aa  62  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.355798  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0308  DNA adenine methylase  28.72 
 
 
310 aa  61.6  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0432416  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0463  putative N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  23.19 
 
 
263 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1850  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.97 
 
 
262 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000906575  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0517  DNA adenine methylase  23.44 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13128  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2017  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.81 
 
 
290 aa  60.8  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1368  DNA adenine methylase  26.92 
 
 
270 aa  60.1  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544834  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2898  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.16 
 
 
263 aa  59.3  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.160115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.16 
 
 
263 aa  59.3  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  hitchhiker  0.00000213835 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>