27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0182 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0182  adenine-specific DNA methylase, putative  100 
 
 
215 aa  426  1e-118  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0297  adenine-specific DNA methylase, putative  93.49 
 
 
222 aa  401  1e-111  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00524367  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0180  hypothetical protein  77.89 
 
 
106 aa  153  2e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1475  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  43.08 
 
 
310 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3649  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.79 
 
 
291 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1631  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.21 
 
 
289 aa  51.6  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00785835  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1989  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.05 
 
 
306 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4275  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.89 
 
 
274 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.020773  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1606  putative adenine-specific DNA methyltransferase  27.55 
 
 
284 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.299391  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2787  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.92 
 
 
305 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113292  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2016  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.05 
 
 
306 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.469174 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0834  DNA adenine methylase  32.91 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000010943  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4215  DNA adenine methylase  30.43 
 
 
319 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4254  DNA adenine methylase  30.43 
 
 
319 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000556419 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0220  DNA adenine methylase  34.58 
 
 
271 aa  48.5  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0051  putative modification methylase dpniia  26.09 
 
 
259 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1480  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.35 
 
 
293 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.895873 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04430  DNA adenine methylase  33.64 
 
 
306 aa  46.6  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2028  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.05 
 
 
292 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2890  DNA adenine methylase  25.19 
 
 
295 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0670  DNA adenine methylase  36.92 
 
 
163 aa  43.5  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0429675  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3545  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.21 
 
 
280 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.164224  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3706  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.9 
 
 
248 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1588  DNA adenine methylase  25.74 
 
 
278 aa  42.4  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2636  DNA adenine methylase  29.81 
 
 
280 aa  42.4  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0410463  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.72 
 
 
673 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>